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Cyclin K

Cyclin-K is a protein that in humans is encoded by the CCNK gene . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Function The protein encoded by this gene is a member of the transcription cyclin family. Th...

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Cyclin-K is a protein that in humans is encoded by the CCNKgene.[5][6][7]

Function

The protein encoded by this gene is a member of the transcription cyclin family. These cyclins may regulate transcription through their association with and activation of cyclin-dependent kinases (CDKs) through conformational changes.[8][9] Activation of CDKs through their cyclin partner, creates kinase complexes that will activate target proteins through phosphorylation. Targeted proteins can then ultimately regulate decisions of a cell's progression within the cell cycle to occur. This gene product may be seen to play a dual role in both regulating CDK and RNA polymerase II (RNAP2) activities.[7] Cyclin K only uses RNA recruitment to activate transcription.[10]

Interactions

Cyclin K has been shown to interact with multiple CDKs including CDK9 and latest CDK12 and CDK13.[6][9] Roles include helping to phosphorylate C-terminal domains of subunits of RNAP2.[11] Cyclin K is most noted for its associated induction of processive elongation.[8] Also, identified with G1 and S phase cyclin activity, however functions are not deeply understood.[5][12]

Cyclin K also interacts with HIV nef protein.[13] In the presence of overexpressed Nef protein, Cyclin k and CDK9 binding is induced, inhibiting the positive elongation factor of other CDK9 binding complexes, resulting in an inhibition of specific HIV-1 gene expression.[9][13] CDK 13 may also be characterized to interact with HIV mRNA splicing, alongside Nef, and the underexpression of Gag and Env related proteins.[12][10]

Cyclin K is indispensable for Leukemia growth. SETD1A, is also known to bind Cyclin K through its FLOS domain.[14] The interaction is shown to be important to DNA damage response genes and for Leukemia proliferation.[10][14]

References

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000090061 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000021258 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 Edwards MC, Wong C, Elledge SJ (julio de 1998). "Ciclina K humana, una nueva ciclina asociada a la ARN polimerasa II que posee actividad quinasa del dominio carboxi-terminal y actividad quinasa activadora de Cdk" . Biología molecular y celular . 18 (7): 4291–300 . doi : 10.1128/MCB.18.7.4291 . PMC 109013. PMID 9632813 .  
  6. 1 2 Fu TJ, Peng J, Lee G, Price DH, Flores O (diciembre de 1999). "La ciclina K funciona como una subunidad reguladora de CDK9 y participa en la transcripción de la ARN polimerasa II" . The Journal of Biological Chemistry . 274 (49): 34527–30 . doi : 10.1074/jbc.274.49.34527 . PMID 10574912 . 
  7. 1 2 "Entrez Gene: CCNK ciclina K" .
  8. 1 2 Baek K, Brown RS, Birrane G, Ladias JA (febrero de 2007). "Estructura cristalina de la ciclina K humana, un regulador positivo de la quinasa dependiente de ciclina 9" . Journal of Molecular Biology . 366 (2): 563– 73. doi : 10.1016/j.jmb.2006.11.057 . PMC 1852425. PMID 17169370 .  
  9. 1 2 3 Greifenberg AK, Hönig D, Pilarova K, Düster R, Bartholomeeusen K, Bösken CA, Anand K, Blazek D, Geyer M (enero de 2016). "Análisis estructural y funcional del complejo Cdk13/ciclina K" . Cell Reports . 14 (2): 320–31 . doi : 10.1016/j.celrep.2015.12.025 . hdl : 11858/00-001M-0000-0029-567D-5 . PMID 26748711 . 
  10. 1 2 3 Kohoutek J, Blazek D (abril de 2012). " La ciclina K va con Cdk12 y Cdk13" . División celular . 7 : 12. doi : 10.1186/1747-1028-7-12 . PMC 3348076. PMID 22512864 .  
  11. ↑ Edwards MC, Wong C, Elledge SJ (julio de 1998). "Ciclina K humana, una nueva ciclina asociada a la ARN polimerasa II que posee actividad quinasa del dominio carboxi-terminal y actividad quinasa activadora de Cdk" . Biología molecular y celular . 18 (7): 4291–300 . doi : 10.1128/mcb.18.7.4291 . PMC 109013. PMID 9632813 .  
  12. ^ Berro R, Pedati C, Kehn-Hall K, Wu W, Klase Z, Even Y, Genevière AM, Ammosova T, Nekhai S, Kashanchi F (julio de 2008). "CDK13, un nuevo factor inhibidor potencial del virus de inmunodeficiencia humana tipo 1 que regula el empalme del ARNm viral" . Revista de Virología . 82 (14): 7155– 66. doi : 10.1128/JVI.02543-07 . PMC 2446983 . PMID 18480452 .  
  13. 1 2 Khan SZ, Mitra D (julio de 2011). "La ciclina K inhibe la expresión génica y la replicación del VIH-1 al interferir con la interacción de la cinasa dependiente de ciclina 9 (CDK9)-ciclina T1 de manera dependiente de Nef" . The Journal of Biological Chemistry . 286 (26): 22943– 54. doi : 10.1074/jbc.M110.201194 . PMC 3123062. PMID 21555514 .  
  14. 1 2 Hoshii T, Cifani P, Feng Z, Huang CH, Koche R, Chen CW, Delaney CD, Lowe SW, Kentsis A, Armstrong SA (febrero de 2018). "Una función no catalítica de SETD1A regula la ciclina K y la respuesta al daño del ADN" . Cell . 172 ( 5): 1007–1021.e17. doi : 10.1016/j.cell.2018.01.032 . PMC 6052445. PMID 29474905 .  

Lecturas adicionales

  • Lin X, Taube R, Fujinaga K, Peterlin BM (mayo de 2002). "P-TEFb que contiene ciclina K y Cdk9 puede activar la transcripción a través del ARN" . The Journal of Biological Chemistry . 277 (19): 16873–8 . doi : 10.1074/jbc.M200117200 . PMID 11884399 . 
  • Mori T, Anazawa Y, Matsui K, Fukuda S, Nakamura Y, Arakawa H (2002). "La ciclina K como objetivo transcripcional directo del supresor tumoral p53" . Neoplasia . 4 ( 3): 268– 74. doi : 10.1038/sj.neo.7900235 . PMC 1531701. PMID 11988847 .  
  • Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (agosto de 2004). "Caracterización a gran escala de las fosfoproteínas nucleares de células HeLa" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (33): 12130– 5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446. PMID 15302935 .  
  • Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (mayo de 2006). "Una red de interacción proteína-proteína para las ataxias hereditarias humanas y los trastornos de la degeneración de las células de Purkinje" . Cell . 125 (4): 801–14 . doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . 
  • Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (noviembre de 2006). "Dinámica de fosforilación global, in vivo y específica del sitio en redes de señalización" . Cell . 127 (3): 635–48 . doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . 
  • Baek K, Brown RS, Birrane G, Ladias JA (febrero de 2007). "Estructura cristalina de la ciclina K humana, un regulador positivo de la quinasa dependiente de ciclina 9" . Journal of Molecular Biology . 366 (2): 563–73 . doi : 10.1016/j.jmb.2006.11.057 . PMC 1852425. PMID 17169370 .  
  • Resumen de toda la información estructural disponible en el PDB para UniProt : O75909 (Ciclina-K) en el PDBe-KB .