En biología molecular, el dominio DM es un dominio proteico descubierto inicialmente en las proteínas doublesex de Drosophila melanogaster y también presente en C. elegans y proteínas de mamíferos. [ 1 ] En D. melanogaster, el gen doublesex controla la diferenciación sexual somática mediante la producción de ARNm con empalme alternativo que codifican polipéptidos específicos del sexo . [ 2 ] Se cree que estas proteínas funcionan como factores de transcripción en genes de determinación sexual posteriores , especialmente en la diferenciación de neuroblastos y la transcripción de genes de proteínas de la yema . [ 3 ] [ 4 ]
El dominio DM se une al ADN como un dímero, lo que permite el reconocimiento de secuencias pseudopalindrómicas . [ 2 ] [ 5 ] [ 6 ] El análisis de RMN del dominio DM de DSX [ 6 ] reveló un nuevo módulo de zinc que contiene sitios de unión de zinc CCHC y HCCC 'entrelazados'. El reconocimiento del ADN requiere la cola básica carboxi-terminal que contacta con el surco menor de la secuencia diana .
Proteínas con este dominio
Las proteínas con el dominio DM se encuentran en muchos organismos modelo. Muchas proteínas Mab de C. elegans contienen este dominio, siendo mab-3 la más conocida. [ 1 ] Las proteínas humanas que contienen este dominio incluyen DMRT1 , DMRT2 , DMRT3 , DMRTA1 , DMRTA2 , DMRTB1 y DMRTC2 ; cada una de ellas tiene un homólogo en ratón . [ 7 ]
Los homólogos de DMRT1 tienen un dominio común adicional en el extremo C-terminal del dominio DM. Este dominio solo se encuentra en vertebrados óseos , y se desconoce tanto su estructura como su función. [ 8 ] : el árbol de especies Jpred predice que la versión humana de la sección es principalmente espirales; también sugiere una débil similitud con PDB : 6BO4 porBLAST . [ 9 ]
Las proteínas DMRTA poseen un motivo adicional en su extremo C-terminal. Este motivo, omnipresente en eucariotas, tiene una función desconocida. Su secuencia es similar a la de algunos motivos asociados a la ubiquitina . [ 10 ]
Referencias
- 1 2 Raymond CS, Shamu CE, Shen MM, Seifert KJ, Hirsch B, Hodgkin J, Zarkower D (febrero de 1998). "Evidencia de conservación evolutiva de genes determinantes del sexo". Nature . 391 (6668): 691– 5. Bibcode : 1998Natur.391..691R . doi : 10.1038/35618 . PMID 9490411 . S2CID 11414843 .
- 1 2 Erdman SE, Chen HJ, Burtis KC (diciembre de 1996). "Caracterización funcional y genética de las propiedades de oligomerización y unión al ADN de las proteínas doublesex de Drosophila" . Genetics . 144 ( 4): 1639– 52. doi : 10.1093/genetics/144.4.1639 . PMC 1207715. PMID 8978051 .
- ↑ Burtis KC, Coschigano KT, Baker BS , Wensink PC (septiembre de 1991). "Las proteínas doublesex de Drosophila melanogaster se unen directamente a un potenciador del gen de la proteína de la yema específico del sexo" . EMBO J. 10 ( 9): 2577–82 . doi : 10.1002/j.1460-2075.1991.tb07798.x . PMC 452955. PMID 1907913 .
- ↑ Shen MM, Hodgkin J (septiembre de 1988). "mab-3, un gen requerido para la expresión de la proteína de la yema específica del sexo y un linaje específico del macho en C. elegans". Cell . 54 ( 7): 1019–31 . doi : 10.1016/0092-8674(88)90117-1 . PMID 3046751. S2CID 1386352 .
- ↑ Yi W, Zarkower D (febrero de 1999). "La similitud de la unión al ADN y la regulación transcripcional por Caenorhabditis elegans MAB-3 y Drosophila melanogaster DSX sugiere la conservación de los mecanismos de determinación del sexo". Development . 126 (5): 873–81 . doi : 10.1242/dev.126.5.873 . PMID 9927589 .
- 1 2 Zhu L, Wilken J, Phillips NB, Narendra U, Chan G, Stratton SM, Kent SB, Weiss MA (julio de 2000). " El dimorfismo sexual en diversos metazoos está regulado por una nueva clase de dedos de zinc entrelazados" . Genes Dev . 14 (14): 1750– 64. doi : 10.1101/gad.14.14.1750 . PMC 316782. PMID 10898790 .
- ↑ "Proteínas coincidentes: dominio de unión al ADN DM (IPR001275) filtrado por especie (Homo sapiens)" . InterPro .
- ↑ "Familia: Dmrt1 (PF12374)" . Pfam .
- ↑ "Resultados de Jpred (MTECSGTSQPPPASVPTTAASEGRMVIQDIPAVTSRGHVENTPD)" . www.compbio.dundee.ac.uk . Archivado del original el 10 de abril de 2019. Consultado el 10 de abril de 2019 .
- ↑ "Especie: motivo DMRTA (IPR005173)" . InterPro . Consultado el 10 de abril de 2019 .
- Familias de proteínas
- dominios de proteínas