Dinamo de ADN

DNADynamo es un paquete de software comercial para el análisis de secuencias de ADN, desarrollado por Blue Tractor Software Ltd ^{[ 1 ]} , compatible con Microsoft Windows , Mac OS X y Linux ^{[ 2 ].} Es utilizado por biólogos moleculares ^{[ 3 ]} para analizar secuencias de ADN y proteínas. Se puede descargar una versión de demostración gratuita desde el sitio web de los desarrolladores del software.

DNADynamo es un paquete de software de análisis de secuencias de ADN y proteínas de propósito general que puede realizar la mayoría de las funciones requeridas por un laboratorio estándar de biología molecular para investigación.

• Visualización, edición y anotación de secuencias de ADN y proteínas.
• Ensamblaje de contigs y edición de cromatogramas , incluyendo la comparación con una secuencia de referencia para identificar mutaciones.
• Alineación global de secuencias con ClustalW y MUSCLE y edición.
• Seleccione y arrastre. Edición de alineación de secuencias para alineaciones de ADN y proteínas hechas manualmente.
• Análisis de zonas restringidas : para visualizar las zonas de corte por restricciones en tablas y en mapas lineales y circulares.
• Una herramienta de subclonación para el ensamblaje de construcciones utilizando sitios de restricción o ensamblaje de Gibson ,
• Simulación de gel de agarosa .
• Búsqueda en bases de datos en línea: busque en bases de datos públicas del NCBI, como GenBank y UniProt .
• Búsquedas BLAST en línea .
• Análisis de proteínas, incluyendo la estimación del peso molecular, el coeficiente de extinción y el punto isoeléctrico (pI).
• Diseño de cebadores de PCR , incluyendo una interfaz para Primer3.
• Visualización de la estructura 3D a través de una interfaz con Jmol.

DNADynamo ha sido desarrollado desde 2004 por BlueTractorSoftware Ltd, una empresa de desarrollo de software con sede en el norte de Gales, Reino Unido ^{[ 4 ].}

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