Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

Desoxirribonucleasa I

La desoxirribonucleasa I (generalmente llamada DNasa I ) es una endonucleasa de la familia de las DNasas codificada por el gen humano DNASE1 . [ 2 ] La DNasa I es una nucleasa q...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

La desoxirribonucleasa I (generalmente llamada DNasa I ) es una endonucleasa de la familia de las DNasas codificada por el gen humano DNASE1 . [ 2 ] La DNasa I es una nucleasa que corta el ADN preferentemente en los enlaces fosfodiéster adyacentes a un nucleótido de pirimidina , produciendo polinucleótidos terminados en 5'-fosfato con un grupo hidroxilo libre en la posición 3', generando en promedio tetranucleótidos. Actúa sobre ADN monocatenario, ADN bicatenario y cromatina . Además de su función como endonucleasa de gestión de residuos , se ha sugerido que es una de las desoxirribonucleasas responsables de la fragmentación del ADN durante la apoptosis . [ 3 ]

La DNasa I se une a la proteína del citoesqueleto actina . Se une a los monómeros de actina con una afinidad muy alta (subnanomolar) y a los polímeros de actina con una afinidad menor. La función de esta interacción no está clara. Sin embargo, dado que la DNasa I unida a la actina es enzimáticamente inactiva, el complejo DNasa- actina podría ser una forma de almacenamiento de la DNasa I que previene el daño a la información genética. Esta proteína se almacena en los gránulos de zimógeno de la envoltura nuclear y funciona cortando el ADN de forma endonucleolítica.

Se han caracterizado al menos seis alelos autosómicos codominantes del gen DNASE 1, DNASE1*1 a DNASE1*6, y la secuencia de DNASE1*2 está representada en este registro. Las mutaciones en este gen, así como el factor que inactiva su producto enzimático, se han asociado con el lupus eritematoso sistémico (LES) , una enfermedad autoinmune . [ 4 ] [ 5 ] Una forma recombinante de esta proteína se utiliza para tratar uno de los síntomas de la fibrosis quística mediante la hidrólisis del ADN extracelular en el esputo y la reducción de su viscosidad. [ 6 ] Se han observado variantes de empalme transcripcional alternativas de este gen, pero no se han caracterizado completamente. [ 2 ]

En genómica

En genómica, se cree que los sitios hipersensibles a la DNasa I se caracterizan por una cromatina abierta y accesible; por lo tanto, un ensayo de sensibilidad a la DNasa I es una metodología ampliamente utilizada en genómica para identificar qué regiones del genoma tienen probabilidades de contener genes activos [ 7 ].

Especificidad de secuencia de la DNasa I

Recientemente se ha informado que la DNasa I muestra cierto grado de especificidad de secuencia que puede depender de las condiciones experimentales. [ 8 ] A diferencia de otras enzimas que presentan una alta especificidad de sustrato, la DNasa I ciertamente no realiza la escisión con una especificidad de secuencia absoluta. Sin embargo, la escisión en sitios que contienen C o G en su extremo 3' es menos eficiente.

Referencias

  1. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  2. 1 2 "Gen Entrez: DNASE1 desoxirribonucleasa I" .
  3. ↑ Samejima, K. y Earnshaw, WC (2005). " Destrozando el genoma: el papel de las nucleasas durante la apoptosis". Nat Rev Mol Cell Biol . 6 (9): 677– 88. doi : 10.1038/nrm1715 . PMID 16103871. S2CID 13948545 .  
  4. ↑ Hakkim A, Fürnrohr BG, Amann K, Laube B, Abed UA, Brinkmann V, Herrmann M, Voll RE, Zychlinsky A (2010). "El deterioro de la degradación de la trampa extracelular de neutrófilos se asocia con la nefritis lúpica" . Proc Natl Acad Sci USA . 107 (21): 9813–8 . Bibcode : 2010PNAS..107.9813H . doi : 10.1073/pnas.0909927107 . PMC 2906830. PMID 20439745 .  
  5. ↑ Yasutomo K, Horiuchi T, Kagami S, et al. (2001). "Mutación de DNASE1 en personas con lupus eritematoso sistémico". Nat . Genet . 28 (4): 313– 4. doi : 10.1038/91070 . PMID 11479590. S2CID 21277651 .   
  6. ↑ Shak S, Capon DJ, Hellmiss R, et al. (1991). "La DNasa I humana recombinante reduce la viscosidad del esputo de la fibrosis quística" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 87 (23): 9188– 92. doi : 10.1073/pnas.87.23.9188 . PMC 55129. PMID 2251263 .   
  7. ↑ Boyle AP, Davis S, Shulha HP, Meltzer P, Margulies EH, Weng Z, Furey TS, Crawford GE (2008). " Mapeo y caracterización de alta resolución de la cromatina abierta en todo el genoma" . Cell . 132 (2): 311–322 . doi : 10.1016/j.cell.2007.12.014 . PMC 2669738. PMID 18243105 .  
  8. ↑ Koohy, Hashem; Down, Thomas A.; Hubbard, Tim J.; Mariño-Ramírez, Leonardo (26 de julio de 2013). " Los conjuntos de datos de accesibilidad de la cromatina muestran sesgo debido a la especificidad de secuencia de la enzima DNasa I" . PLOS ONE . 8 (7) e69853. Bibcode : 2013PLoSO...869853K . doi : 10.1371/journal.pone.0069853 . PMC 3724795. PMID 23922824 .  

Lecturas adicionales

  • Lachmann PJ (2003). "Lupus y desoxirribonucleasa". Lupus . 12 (3): 202– 6. doi : 10.1191/0961203303lu357xx . PMID 12708782. S2CID 43058677 .  
  • Yasuda T, Awazu S, Sato W, et  al. (1991). "Desoxirribonucleasa humana genéticamente polimórfica: purificación, caracterización y multiplicidad de la desoxirribonucleasa I de la orina". J. Biochem . 108 (3): 393–8 . doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123212 . PMID 2277032 . 
  • Kishi K, Yasuda T, Ikehara Y, et  al. (1990). "Polimorfismo de la desoxirribonucleasa I (DNasa I) del suero humano: similitudes de patrones entre isoenzimas de suero, orina, riñón, hígado y páncreas" . Am . J. Hum. Genet . 47 (1): 121– 6. PMC 1683738. PMID 2349940 .  
  • Kabsch W, Mannherz HG, Suck D, et  al. (1990). "Estructura atómica del complejo actina:DNasa I". Nature . 347 ( 6288): 37– 44. Bibcode : 1990Natur.347...37K . doi : 10.1038/347037a0 . PMID 2395459. S2CID 925337 .  
  • Kishi K, Yasuda T, Awazu S, Mizuta K (1989). "Polimorfismo genético de la desoxirribonucleasa I de la orina humana". Hum . Genet . 81 (3): 295– 7. doi : 10.1007/BF00279009 . PMID 2921043. S2CID 20420713 .  
  • Rosenstreich DL, Tu JH, Kinkade PR, et  al. (1988). "Un inhibidor de la interleucina 1 derivado de la orina humana. Homología con la desoxirribonucleasa I" . J. Exp. Med . 168 (5): 1767–79 . doi : 10.1084/jem.168.5.1767 . PMC 2189114. PMID 3263467 .  
  • Yasuda T, Nadano D, Takeshita H, et  al. (1995). "Análisis molecular del tercer alelo del polimorfismo de la desoxirribonucleasa I humana". Ana. Tararear. Genet . 59 (parte 2): 139– 47. doi : 10.1111/j.1469-1809.1995.tb00737.x . PMID 7625762 . S2CID 43729378 .  
  • Yasuda T, Kishi K, Yanagawa Y, Yoshida A (1995). "Estructura del gen de la desoxirribonucleasa I humana (DNasa I): identificación de la sustitución de nucleótidos que genera su polimorfismo genético clásico". Ann . Hum. Genet . 59 (Pt 1): 1– 15. doi : 10.1111/j.1469-1809.1995.tb01601.x . PMID 7762978. S2CID 23914004 .  
  • Yasuda T, Nadano D, Iida R, et  al. (1995). "Asignación cromosómica del gen humano de la desoxirribonucleasa I, DNASE 1 (DNL1), a la banda 16p13.3 mediante la reacción en cadena de la polimerasa". Cytogenet. Cell Genet . 70 ( 3–4 ): 221–3 . doi : 10.1159/000134038 . PMID 7789176 . 
  • Yasuda T, Nadano D, Takeshita H, et  al. (1995). "La base molecular del polimorfismo genético de la desoxirribonucleasa I humana: identificación de la sustitución de nucleótidos que genera el cuarto alelo". FEBS Lett . 359 ( 2–3 ): 211–4 . Bibcode : 1995FEBSL.359..211Y . doi : 10.1016/0014-5793(95)00037-A . PMID 7867802. S2CID 21461181 .  
  • Yasuda T, Nadano D, Tenjo E, et  al. (1996). "Genotipado del polimorfismo de la desoxirribonucleasa I humana mediante la reacción en cadena de la polimerasa". Electrophoresis . 16 ( 10): 1889– 93. doi : 10.1002/elps.11501601310 . PMID 8586059. S2CID 35528773 .  
  • Iida R, Yasuda T, Takeshita H, et  al. (1996). "Identificación de la sustitución de nucleótidos que genera el cuarto sitio polimórfico en la desoxirribonucleasa I humana (DNasa I)". Hum . Genet . 98 (4): 415–8 . doi : 10.1007/s004390050231 . PMID 8792814. S2CID 6393565 .  
  • Iida R, Yasuda T, Aoyama M, et  al. (1998). "El quinto alelo del polimorfismo de la desoxirribonucleasa I (DNasa I) humana". Electrophoresis . 18 ( 11): 1936– 9. doi : 10.1002/elps.1150181108 . PMID 9420147. S2CID 8969865 .  
  • Yasuda T, Takeshita H, Iida R, et  al. (1999). "Un nuevo alelo, DNASE1*6, del polimorfismo de la desoxirribonucleasa I humana codifica una sustitución de Arg por Cys responsable de su inestabilidad". Biochem. Biophys. Res. Commun . 260 (1): 280– 3. Bibcode : 1999BBRC..260..280Y . doi : 10.1006/bbrc.1999.0900 . PMID 10381379 . 
  • Oliveri M, Daga A, Cantoni C, et  al. (2001). "La DNasa I media la degradación del ADN internucleosomal en células humanas que experimentan apoptosis inducida por fármacos". Eur . J. Immunol . 31 (3): 743– 51. doi : 10.1002/1521-4141(200103)31:3 < 743::AID-IMMU743 > 3.0.CO ; 2-9 . PMID 11241278. S2CID 32330090 .  
  • Otterbein LR, Graceffa P, Dominguez R (2001). "La estructura cristalina de la actina no compleja en el estado ADP". Science . 293 (5530): 708– 11. doi : 10.1126/science.1059700 . PMID 11474115 . S2CID 12030018 .  
  • Yasutomo K, Horiuchi T, Kagami S, et  al. (2001). "Mutación de DNASE1 en personas con lupus eritematoso sistémico". Nat . Genet . 28 (4): 313– 4. doi : 10.1038/91070 . PMID 11479590. S2CID 21277651 .  
  • Ballweber E, Galla M, Aktories K, et  al. (2001). "Interacción de la actina ADP-ribosilada con proteínas de unión a la actina" . FEBS Lett . 508 (1): 131– 5. Bibcode : 2001FEBSL.508..131B . doi : 10.1016/ S0014-5793 (01)03040-X . PMID 11707283. S2CID 7241702 .  
  • Tsutsumi S, Kaneko Y, Asao T, et  al. (2002). "La DNasa I está presente en las células principales de los estómagos humanos y de rata". Histochem . J. 33 ( 9–10 ) : 531–5 . doi : 10.1023/A:1014999624430 . PMID 12005024. S2CID 10324827 .