Articulo de referencia

DSIF

DSIF y NELF, en conjunto, pueden detener la transcripción justo después de su inicio, interrumpiendo la elongación de la Pol II. P-TEFb puede fosforilar DSIF, NELF y la Pol II p...

DSIF y NELF, en conjunto, pueden detener la transcripción justo después de su inicio, interrumpiendo la elongación de la Pol II. P-TEFb puede fosforilar DSIF, NELF y la Pol II para reanudar la transcripción. Una vez fosforilado, NELF se disocia mientras que DSIF estimula la elongación. [ 1 ]

DSIF ( factor inductor de sensibilidad a DRB ) es un complejo proteico que puede afectar negativa o positivamente la transcripción por la ARN polimerasa II (Pol II). [ 2 ] Puede interactuar con el factor de elongación negativo (NELF) para promover la detención de Pol II en algunos genes, lo que se denomina pausa proximal al promotor. [ 3 ] La pausa ocurre poco después de la iniciación, una vez que se han transcrito 20-60 nucleótidos. [ 3 ] Esta detención se alivia mediante el factor de elongación de transcripción positivo b (P-TEFb) y Pol II entra en elongación productiva para reanudar la síntesis hasta finalizar. [ 1 ] En humanos, DSIF está compuesto por hSPT4 y hSPT5 . [ 2 ] hSPT5 tiene un papel directo en la caperuza del ARNm que ocurre mientras la elongación está pausada. [ 4 ]

SPT5 se conserva en humanos y bacterias. [ 5 ] SPT4 y SPT5 en levaduras son los homólogos de hSPT4 y hSPT5. [ 2 ] [ 6 ] En bacterias, el complejo homólogo solo contiene NusG , un homólogo de Spt5. [ 7 ] Las arqueas tienen ambas proteínas. [ 8 ]

El complejo bloquea la pinza de la ARN polimerasa (RNAP) en un estado cerrado para evitar la disociación del complejo de elongación (EC). El dominio NGN de ​​Spt5 ayuda a hibridar las dos hebras de ADN río arriba. El único dominio KOW en bacterias y arqueas ancla un ribosoma a la RNAP. [ 8 ]

Función en las enfermedades

VIH

DSIF desempeña el mismo papel en la expresión génica del VIH-1 que el que desempeña normalmente en la transcripción. [ 9 ] [ 10 ] Esto se debe a que P-TEFb fosforila DSIF de la misma manera, independientemente de si P-TEFb pasa por la regulación celular normal o la elude debido a Tat . [ 11 ]

Referencias

  1. 1 2 Zhou, Qiang; Li, Tiandao; Price, David H. (2012-07-07). "Control de elongación de la ARN polimerasa II" . Annual Review of Biochemistry . 81 (1): 119– 143. doi : 10.1146/annurev-biochem-052610-095910 . ISSN 0066-4154 . PMC 4273853. PMID 22404626 .   
  2. 1 2 3 Wada T, Takagi T, Yamaguchi Y, Ferdous A, Imai T, Hirose S, et al. (febrero de 1998). "DSIF, un nuevo factor de elongación de la transcripción que regula la procesividad de la ARN polimerasa II, está compuesto por homólogos humanos de Spt4 y Spt5" . Genes & Development . 12 (3): 343– 356. doi : 10.1101/gad.12.3.343 . PMC 316480. PMID 9450929 .   
  3. 1 2 Tettey, Theophilus T.; Gao, Xin; Shao, Wanqing; Li, Hua; Story, Benjamin A.; Chitsazan, Alex D.; Glaser, Robert L.; Goode, Zach H.; Seidel, Christopher W.; Conaway, Ronald C.; Zeitlinger, Julia; Blanchette, Marco; Conaway, Joan W. (2019-06-25). "Un papel para FACT en la pausa proximal del promotor de la ARN polimerasa II" . Cell Reports . 27 (13): 3770–3779.e7. doi : 10.1016/j.celrep.2019.05.099 . PMID 31242411 . 
  4. Wen, Y.; Shatkin, AJ (1999-07-15). " El factor de elongación de la transcripción hSPT5 estimula la adición de la caperuza al ARNm" . Genes & Development . 13 (14): 1774– 1779. doi : 10.1101/gad.13.14.1774 . ISSN 0890-9369 . PMC 316881. PMID 10421630 .   
  5. Decker, Tim-Michael (2021-07-09). "Mecanismos del factor de elongación de la transcripción DSIF (Spt4–Spt5)" . Journal of Molecular Biology . 433 (14) 166657. doi : 10.1016/j.jmb.2020.09.016 . PMID 32987031 . 
  6. Wenzel, Sabine; Schweimer, Kristian; Rösch, Paul; Wöhrl, Birgitta M. (2008-06-06). "La pequeña subunidad hSpt4 del factor de elongación de la transcripción humano DSIF es una proteína con dedos de zinc con topología de tipo α/β" . Biochemical and Biophysical Research Communications . 370 (3): 414– 418. Bibcode : 2008BBRC..370..414W . doi : 10.1016/j.bbrc.2008.03.080 . PMID 18373978 . 
  7. Yakhnin, Alexander V.; Murakami, Katsuhiko S.; Babitzke, Paul (2016-03-04). "NusG es un factor de pausa de la ARN polimerasa específico de secuencia que se une al ADN no molde dentro de la burbuja de transcripción en pausa" . Journal of Biological Chemistry . 291 (10): 5299– 5308. doi : 10.1074/jbc.M115.704189 . PMC 4777861. PMID 26742846 .  
  8. 1 2 Fouqueau T, Blombach F, Cackett G, Carty AE, Matelska DM, Ofer S, et al. (diciembre de 2018). " La vanguardia de la transcripción arqueal" . Temas emergentes en ciencias de la vida . 2 (4): 517– 533. doi : 10.1042/ETLS20180014 . PMC 7289017. PMID 33525828 .   
  9. Zhang, Zhiqiang; Klatt, Alicia; Gilmour, David S.; Henderson, Andrew J. (2007-06-08). "El factor de elongación negativo NELF reprime la transcripción del virus de la inmunodeficiencia humana al pausar el complejo de la ARN polimerasa II" . Journal of Biological Chemistry . 282 (23): 16981– 16988. doi : 10.1074/jbc.M610688200 . PMID 17442680 . 
  10. Ping, Yueh-Hsin; Rana, Tariq M. (2001-04-20). "DSIF y NELF interactúan con el complejo de elongación de la ARN polimerasa II y el Tat del VIH-1 estimula la fosforilación mediada por P-TEFb de la ARN polimerasa II y DSIF durante la elongación de la transcripción" . Journal of Biological Chemistry . 276 (16): 12951– 12958. doi : 10.1074/jbc.M006130200 . PMID 11112772 . 
  11. ^ Zhu, Yuerong; Pe'ery, Tsafrira; Peng, Junmin; Ramanathan, Yegnanarayana; Marshall, Nick; Marshall, Tricia; Enmienda, Brad; Mathews, Michael B.; Precio, David H. (15 de octubre de 1997). "Se requiere el factor de alargamiento de la transcripción P-TEFb para la transactivación de Tat del VIH-1 in vitro" . Genes y desarrollo . 11 (20): 2622–2632 . doi : 10.1101/gad.11.20.2622 . ISSN 0890-9369 . PMC 316609 . PMID 9334325 .