Articulo de referencia

DXZ4

DXZ4 es una secuencia de ADN repetida en tándem de número variable . En humanos, está compuesta por monómeros de 3 kb que contienen un sitio de unión a CTCF altamente conservado...

DXZ4 es una secuencia de ADN repetida en tándem de número variable . En humanos, está compuesta por monómeros de 3 kb que contienen un sitio de unión a CTCF altamente conservado . CTCF es una proteína factor de transcripción y el principal aislante responsable de la partición de los dominios de cromatina en el genoma de los vertebrados . [ 1 ]

Además de estar enriquecido en islas CpG , [ 2 ] DXZ4 transcribe ARN largos no codificantes ( lncRNA ) y ARN pequeños de función desconocida. [ 3 ] [ 4 ] El número de copias repetidas de DXZ4 es altamente polimórfico en poblaciones humanas (variando entre 50 y 100 copias). DXZ4 es uno de los muchos loci de repetición en tándem grandes definidos como macrosatélites . [ 2 ] Se han descrito varios macrosatélites en humanos y comparten características similares, como alto contenido de GC, grandes monómeros de repetición y alta variabilidad para el número de copias repetidas dentro de las poblaciones. [ 2 ] DXZ4 juega un papel importante en la conformación estructural única del cromosoma X inactivo (Xi) en células somáticas femeninas al actuar como un punto de bisagra entre dos grandes “superdominios”. [ 5 ]

Además de actuar como la división principal entre dominios, DXZ4 forma interacciones de largo alcance con varias otras regiones ricas en repeticiones a lo largo del cromosoma X inactivo. [ 6 ] La eliminación del locus DXZ4 reveló la pérdida de esta conformación estructural en el Xi, manteniéndose el silenciamiento en todo el cromosoma. [ 7 ]

Referencias

  1. Ong CT, Corces VG (abril de 2014). "CTCF: una proteína arquitectónica que une la topología y la función del genoma" . Nature Reviews. Genetics . 15 (4): 234–46 . doi : 10.1038/nrg3663 . PMC 4610363. PMID 24614316 .  
  2. 1 2 3 Giacalone J, Friedes J, Francke U (mayo de 1992). "Un nuevo macrosatélite VNTR humano rico en GC en Xq24 se metila diferencialmente en cromosomas X activos e inactivos". Nature Genetics . 1 (2): 137– 43. doi : 10.1038 / ng0592-137 . PMID 1302007. S2CID 20003755 .  
  3. Chadwick BP (agosto de 2008). "La cromatina DXZ4 adopta una conformación opuesta a la del cromosoma circundante y adquiere una nueva función inactiva específica del cromosoma X que involucra a CTCF y transcritos antisentido" . Genome Research . 18 (8): 1259–69 . doi : 10.1101/gr.075713.107 . PMC 2493436. PMID 18456864 .  
  4. Pohlers M, Calabrese JM, Magnuson T (agosto de 2014). "Expresión de ARN pequeño del macrosatélite humano DXZ4" . G3: Genes, Genomas, Genética . 4 (10): 1981–9 . doi : 10.1534 / g3.114.012260 . PMC 4199704. PMID 25147189 .  
  5. Deng X, Ma W, Ramani V, Hill A, Yang F, Ay F, Berletch JB, Blau CA, Shendure J, Duan Z, Noble WS, Disteche CM (agosto de 2015). " Estructura bipartita del cromosoma X inactivo del ratón" . Genome Biology . 16 (1) 152. doi : 10.1186/s13059-015-0728-8 . PMC 4539712. PMID 26248554 .  
  6. Rao SS, Huntley MH, Durand NC, Stamenova EK, Bochkov ID, Robinson JT, Sanborn AL, Machol I, Omer AD, Lander ES, Aiden EL (diciembre de 2014). "Un mapa 3D del genoma humano con resolución de kilobases revela principios del bucle de cromatina" . Cell . 159 ( 7): 1665–80 . doi : 10.1016/j.cell.2014.11.021 . PMC 5635824. PMID 25497547 .  
  7. Darrow EM, Huntley MH, Dudchenko O, Stamenova EK, Durand NC, Sun Z, et al. (agosto de 2016). "La eliminación de DXZ4 en el cromosoma X inactivo humano altera la arquitectura del genoma de orden superior" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 113 (31): E4504-12. Bibcode : 2016PNAS..113E4504D . doi : 10.1073/pnas.1609643113 . PMC 4978254. PMID 27432957 .