David J. States es un biofísico estadounidense que es profesor de Genética Humana en la Universidad de Michigan . Su grupo de investigación utiliza métodos computacionales para comprender el genoma humano y su relación con el proteoma humano . Es el director del Programa de Capacitación en Bioinformática del NIH de Michigan y científico sénior del Centro Nacional de Informática Biomédica Integrativa.
Vida temprana y educación
States obtuvo sus títulos de BA ('75), MD ('83) y Ph.D. ('83) en la Universidad de Harvard . [ cita requerida ]
Carrera
Fue científico del personal en el Laboratorio Nacional Magnet del MIT y residente en medicina interna en el Centro Médico de la UCSD . Luego se trasladó al NIH como asociado clínico y miembro del personal sénior, donde se unió al Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). Mientras estaba en el NCBI, él y Warren Gish mejoraron BLAST , uno de los programas más utilizados en bioinformática [4]. En 1992, States fue reclutado por la Universidad de Washington como Director del Instituto de Computación Biomédica y, en 2001, se trasladó a la Universidad de Michigan para establecer el Programa de Bioinformática de la Universidad de Michigan. Fue miembro de la Junta Directiva fundadora y Tesorero de la Sociedad Internacional de Biología Computacional y Presidente de las Conferencias de Sistemas Inteligentes para Biología Molecular de 2005.
States también es conocido por su trabajo en resonancia magnética nuclear , donde desarrolló la espectroscopia multidimensional de fase de absorción pura, una técnica que ahora se usa ampliamente en la determinación de la estructura de proteínas. States también contribuyó a la biofísica computacional como autor del programa de simulación de dinámica molecular CHARMM . Combinó la espectroscopia de RMN y el modelado para demostrar por primera vez la presencia de una estructura similar a la nativa en los intermediarios de plegamiento del inhibidor de tripsina pancreática bovina [1-2] y la primera demostración de un intermediario de plegamiento atrapado conformacionalmente [3].
Publicaciones
- Estados Unidos DJ, Creighton TE, Dobson CM, Karplus M. Conformaciones de intermediarios en el plegamiento del inhibidor de tripsina pancreática. Journal of Molecular Biology. 1987 195(3):731-9. PMID 2443711
- Estados Unidos DJ, Dobson CM, Karplus M. Un nuevo intermediario de dos disulfuros en el replegamiento del inhibidor de tripsina pancreática bovina reducida. Journal of Molecular Biology. 1984 174(2):411-8. PMID 6201619
- Estados Unidos DJ, Dobson CM, Karplus M, Creighton TE. Un isómero conformacional de la proteína inhibidora de tripsina pancreática bovina producida por replegamiento. Nature. 1980 286(5773):630-2. PMID 7402343
- Gish W, States DJ. Identificación de regiones codificantes de proteínas mediante búsqueda de similitud en bases de datos. Nature Genetics. 1993 3(3):266-72. PMID 8485583
Enlaces externos
- Laboratorio de estados
- Centro Nacional de Informática Biomédica Integrativa
- Programa de Bioinformática de Michigan