Articulo de referencia

David W. Deamer

David Wilson Deamer (nacido el 21 de abril de 1939) es un biólogo estadounidense y profesor de investigación de ingeniería biomolecular en la Universidad de California, Santa Cr...

David Wilson Deamer (nacido el 21 de abril de 1939) es un biólogo estadounidense y profesor de investigación de ingeniería biomolecular en la Universidad de California, Santa Cruz . Deamer ha hecho contribuciones al campo de la biofísica de membranas. Su trabajo condujo a un nuevo método de secuenciación de ADN y a una comprensión más completa del papel de las membranas en el origen de la vida .

En 1985 recibió una beca Guggenheim que financió una investigación en la Universidad Nacional Australiana en Canberra para investigar los compuestos orgánicos del meteorito Murchison . Fue presidente de la Sociedad Internacional para el Estudio del Origen de la Vida entre 2013 y 2014. [1]

Primeros años de vida

El padre de Deamer, también llamado David, trabajó en Douglas Aircraft en Santa Mónica, California , durante y después de la Segunda Guerra Mundial , mientras que su madre Zena cuidaba de Deamer y sus dos hermanos, Richard y John. En 1952, la familia se mudó a Ohio , donde los tres hermanos asistieron a la escuela secundaria Westerville. En 1957, Deamer presentó su investigación sobre protozoos autoorganizados a la Westinghouse Science Talent Search y estuvo entre los 40 ganadores que fueron invitados a Washington DC ese año. Se le otorgó una beca completa para la Universidad de Duke, donde completó una licenciatura en química en 1961. [2]

Deamer obtuvo un doctorado en Química Fisiológica en la Facultad de Medicina de la Universidad Estatal de Ohio en 1965 y fue investigador postdoctoral en la Universidad de California, Berkeley, de 1965 a 1967.

Carrera académica

Comenzó su carrera académica en la Universidad de California, Davis , donde se desempeñó como profesor desde 1967 hasta 1994. [3] En 1994, se unió a la Universidad de California, Santa Cruz , donde se convirtió en profesor de investigación en Química y Bioquímica. [4] Más tarde cofundó el Departamento de Ingeniería Biomolecular y se desempeñó como su presidente desde 2003 hasta 2006. [1] Deamer ha ocupado puestos de científico visitante en la Universidad de Bristol , el Instituto Weizmann y la Universidad Nacional Australiana . [3]

Investigación

Como profesor joven en la UC Davis, Deamer continuó trabajando con microscopía electrónica , revelando por primera vez partículas relacionadas con enzimas ATPasa funcionales dentro de las membranas del retículo sarcoplásmico. [5] Después de pasar sabáticos en Inglaterra en la Universidad de Bristol en 1971 y con Alec Bangham en 1975, Deamer se interesó en los liposomas . Las conversaciones con Bangham inspiraron su investigación sobre el papel de las membranas en el origen de la vida, y en 1985 Deamer demostró que el meteorito carbonoso de Murchison contenía compuestos similares a lípidos que podían ensamblarse en vesículas membranosas. [6] Deamer describió la importancia de los procesos de autoensamblaje en su libro de 2011 First Life . [7] En un trabajo colaborativo con Mark Akeson, un estudiante de postdoctorado en ese momento, los dos establecieron métodos para monitorear la permeación de protones a través de canales iónicos como la gramicidina. [8] En 1989, mientras regresaba de una reunión científica en Oregón, Deamer concibió que podría ser posible secuenciar moléculas individuales de ADN mediante el uso de un voltaje impuesto para hacerlas pasar individualmente a través de un canal nanoscópico. La secuencia de ADN podría distinguirse por el efecto modulador específico de las cuatro bases sobre la corriente iónica a través del canal. [9]

Secuenciación de nanoporos

En 1993, él y Dan Branton iniciaron una colaboración de investigación con John Kasianowitz en el NIST para explorar esta posibilidad con el canal de hemolisina , y en 1996 publicaron el primer artículo que demostraba que la secuenciación de nanoporos podía ser factible. [10] George Church en Harvard había propuesto de forma independiente una idea similar, y Church, Branton y Deamer decidieron iniciar una solicitud de patente que se concedió en 1998. [11] Mark Akeson se unió al esfuerzo de investigación en 1997, y en 1999 publicó un artículo que mostraba que el canal de hemolisina, ahora conocido como nanoporo , podía distinguir entre bases de purina y pirimidina en moléculas de ARN individuales. [12] En 2007, Oxford Nanopore Technologies (ONT) licenció las patentes que describen la tecnología [13] y en 2014 lanzó el dispositivo de secuenciación de nanoporos MinION a investigadores seleccionados. Las primeras publicaciones aparecieron en 2015, una de las cuales utilizó el MinION para secuenciar el ADN de E. coli con una precisión del 99,4 % en relación con el genoma establecido de 5,4 millones de pares de bases. [14] A pesar del escepticismo inicial, la secuenciación por nanoporos ahora se acepta como un método viable de secuenciación de tercera generación . [15] [16] [17] [18]

Origen de la vida

Otra área importante de investigación de Deamer es el origen y evolución de las membranas celulares . [19] Demostró que las moléculas anfifílicas encontradas en meteoritos pueden autoensamblarse en estructuras similares a membranas, ofreciendo información sobre los precursores potenciales de la vida en la Tierra. [20] Sus experimentos con ciclos de hidratación-deshidratación revelaron vías para la encapsulación de polímeros en vesículas primitivas, proporcionando un posible mecanismo para el surgimiento de protocélulas. [9]

Publicaciones seleccionadas

  • Deamer, David W. (2011). La primera vida: descubriendo las conexiones entre las estrellas, las células y cómo comenzó la vida . Berkeley: University of California Press. ISBN 978-0-520-25832-7.</ref>
  • Deamer, David W (2019). Ensamblando la vida: ¿Cómo puede surgir la vida en la Tierra y otros planetas habitables?: Deamer, David W.: 9780190646387: Amazon.com: Libros . Oxford University Press. ISBN 978-0190646387.
  • Deamer, David W. (2020). Origen de la vida: lo que todo el mundo necesita saber® . Oxford University Press. ISBN 978-0190098995.
  • La búsqueda de FOXP5: una novela de misterio genómico, Wallace Kaufman y David Deamer, Springer, 2016, ISBN 978-3-319-28960-1 

Referencias

  1. ^ ab Damer, Bruce (2019-05-02). "David Deamer: cinco décadas de investigación sobre la cuestión de cómo puede comenzar la vida". Life . 9 (2): 36. doi : 10.3390/life9020036 . ISSN  2075-1729. PMC 6617542 . PMID  31052584. 
  2. ^ Deamer, DW; Branton, D. (1967). "Planos de fractura en un sistema de membrana modelo de bicapa de hielo". Science . 158 (3801): 655– 657. Bibcode :1967Sci...158..655D. doi :10.1126/science.158.3801.655. PMID  4860951. S2CID  25432205.
  3. ^ ab "David W Deamer". Oxford Nanopore Technologies . Consultado el 6 de enero de 2025 .
  4. ^ ""El origen de la vida" de David W. Deamer se publica en persa". Tehran Times . 2024-06-12 . Consultado el 2025-01-06 .
  5. ^ Deamer, DW; Baskin, RJ (1969). "Ultraestructura de preparaciones de retículo sarcoplásmico". Revista de biología celular . 42 (1): 296– 307. CiteSeerX 10.1.1.281.3389 . doi :10.1083/jcb.42.1.296. PMC 2107567 . PMID  4182374.  
  6. ^ Deamer, DW (1985). "Las estructuras límite están formadas por compuestos orgánicos de la condrita carbonácea de Murchison". Nature . 317 (6040): 792– 794. Bibcode :1985Natur.317..792D. doi :10.1038/317792a0. S2CID  4249097.
  7. ^ Deamer, David (2011). La primera vida: descubrimiento de las conexiones entre las estrellas, las células y cómo comenzó la vida . Berkeley, CA, EE. UU.: University of California Press. ISBN 9780520274457.OCLC 727950391  .
  8. ^ Patente estadounidense 5795782, Church, George; Deamer, David W.; Branton, Daniel; Baldarelli, Richard; Kasianowicz, John, "Caracterización de moléculas de polímeros individuales basada en interacciones monómero-interfaz", expedida el 18 de agosto de 1998, asignada al presidente y miembros del Harvard College 
  9. ^ ab Singer, Emily (17 de marzo de 2016). "En los charcos cálidos y grasientos, ¿la chispa de la vida?". Quanta Magazine . Consultado el 6 de enero de 2025 .
  10. ^ Akeson, M.; Deamer, DW (1991). "Conductancia de protones en el alambre de agua de gramicidina: ¿modelo para la conductancia de protones en la ATPasa FoF1?". Biophysical Journal . 60 (1): 101– 109. doi :10.1016/s0006-3495(91)82034-3. PMC 1260042 . PMID  1715764. 
  11. ^ Kasianowicz, J.; Brandin, E.; Branton, D.; Deamer, DW (1996). "Caracterización de moléculas de polinucleótidos individuales utilizando un canal de membrana" (PDF) . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de Estados Unidos . 93 (24): 13770– 13773. Bibcode :1996PNAS...9313770K. doi : 10.1073/pnas.93.24.13770 . PMC 19421 . PMID  8943010. 
  12. ^ Akeson, M.; Branton, D.; Kasianowicz, JJ; Brandin, E.; Deamer, DW (1999). "Discriminación en escala de tiempo de microsegundos entre ácido policitidílico, ácido poliadenílico y ácido poliuridílico como homopolímeros o como segmentos dentro de moléculas de ARN individuales". Biophysical Journal . 77 (6): 3227– 3233. Bibcode :1999BpJ....77.3227A. doi :10.1016/s0006-3495(99)77153-5. PMC 1300593 . PMID  10585944. 
  13. ^ "Tecnología de nanoporos de Oxford" . Consultado el 17 de diciembre de 2015 .
  14. ^ Loman, NJ; Quick, J.; Simpson, JT (2015). "Un genoma bacteriano completo ensamblado de novo utilizando solo datos de secuenciación de nanoporos". Nature Methods . 12 (8): 733– 735. doi :10.1038/nmeth.3444. PMID  26076426. S2CID  15053702.
  15. ^ Regalado, Antonio; Quick, J.; Simpson, JT (17 de septiembre de 2014). "Un nuevo y radical secuenciador de ADN finalmente llega a manos de los investigadores". MIT Technology Review . Consultado el 26 de marzo de 2019 .
  16. ^ Hayden, Antonio; Quick, J.; Simpson, JT (2015). "Un secuenciador de ADN de tamaño reducido impresiona a los primeros usuarios". Nature . 521 (7550): 15– 16. Bibcode :2015Natur.521...15C. doi : 10.1038/521015a . PMID  25951262.
  17. ^ Zon, Jerry; Quick, J.; Simpson, JT (15 de septiembre de 2015). "Secuenciación de nanoporos: 20 años después". Zone in With Zon: tendencias en la investigación de ácidos nucleicos . Consultado el 26 de marzo de 2019 .
  18. ^ Krol, Aaron; Quick, J.; Simpson, JT (22 de diciembre de 2014). "La secuenciación de nanoporos llegó para quedarse". Bio-IT World . Consultado el 26 de marzo de 2019 .
  19. ^ Stephens, Tim; Escritor 459-2495, Staff. "Un químico de la UCSC explora los orígenes membranosos de la primera célula viva". UC Santa Cruz News . Consultado el 6 de enero de 2025 .{{cite web}}: CS1 maint: nombres numéricos: lista de autores ( enlace )
  20. ^ Djokic, Martin J. Van Kranendonk, David W. Deamer, Tara (1 de agosto de 2017). "La vida en la Tierra surgió de una piscina volcánica caliente, no del mar, según nuevas evidencias". Scientific American . Consultado el 6 de enero de 2025 .{{cite web}}: CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
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