Mapeo de eliminación

En genética , y especialmente en ingeniería genética , el mapeo por deleción es una técnica que se utiliza para descubrir los sitios de mutación dentro de un gen .

El principio del mapeo por deleción consiste en cruzar una cepa con una mutación puntual en un gen con múltiples cepas que presentan deleciones en regiones distintas del mismo gen. Si se produce recombinación entre las dos cepas para generar un gen de tipo silvestre (+) (independientemente de la frecuencia), la mutación puntual no puede estar dentro de la región de la deleción. Si la recombinación no produce ningún gen de tipo silvestre, se puede concluir que la mutación puntual y la deleción se encuentran en el mismo segmento de ADN .

Este ejemplo debería demostrar cómo funciona el principio:

Supongamos que tenemos un gen X , que en su forma silvestre (+) se puede representar linealmente de la siguiente manera:

5'-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------3' gen X, +

Supongamos que una cepa de organismos tiene una mutación puntual en el gen (ahora llamado gen X, – para indicar que ya no es de tipo silvestre):

5'----------------------------------------------------X--------------------------------------------------------------3' gen X, –

Ahora supongamos que tenemos dos cepas de organismos, cada una con deleciones en el gen X en sitios diferentes, llamadas del-1 y del-2 , respectivamente (la línea punteada indica el sitio de la deleción):

5'------------------(................................................)------------------------------------------------3' del-1

5'------------------------------------------------------------(.................................................)---------3' del-2

Dado que la mutación puntual se encuentra dentro de la deleción de del-1, no habrá recombinantes de tipo silvestre (+) entre el mutante puntual y el mutante del-1. Sin embargo, en un cruce entre el mutante puntual y el mutante del-2, podría producirse un recombinante de tipo silvestre (+) con éxito.

En la recombinación genética, si un alelo mutante del donante se encuentra dentro de la secuencia correspondiente a la región eliminada en el receptor, no se obtendrán recombinantes (+) (como en el cruce con del-1). Para reparar una deleción por recombinación, el donante debe tener una secuencia de ADN de tipo silvestre en la región correspondiente al ADN eliminado en el receptor (como en el cruce con del-2). En otras palabras, existe una posibilidad de recombinación factible entre el mutante puntual y del-2 en la que se podría generar un segmento de ADN que no contuviera ni la mutación puntual ni la deleción, lo que indica que las mutaciones en estas dos cepas no pueden estar en la misma región.

Tenga en cuenta que no todos los entrecruzamientos entre el mutante puntual y del-2 producirán recombinantes (+); en este caso, solo aquellos eventos de entrecruzamiento que ocurran entre el mutante puntual y el extremo 5' de la deleción heredarán la secuencia de tipo silvestre.