Articulo de referencia

Sistema de identificación digital automatizado

El sistema digital de identificación automatizada (DAISY) es un sistema automatizado de identificación de especies optimizado para la detección rápida de invertebrados (por ejem...

El sistema digital de identificación automatizada (DAISY) es un sistema automatizado de identificación de especies optimizado para la detección rápida de invertebrados (por ejemplo, insectos) por parte de personas no expertas (por ejemplo, parataxónomos ).

Fue desarrollado por el Dr. Mark O'Neill a mediados de la década de 1990. El desarrollo fue apoyado por fondos de la Iniciativa Darwin en 1997 [ 1 ] y BBSRC . [ 2 ] Los derechos de propiedad intelectual fueron adquiridos por la empresa de O'Neill, Tumbling Dice Ltd, en febrero de 2000 [ 3 ] al final del Proyecto Darwin financiado por la subvención . El sistema se desarrolló aún más, lo que dio como resultado la producción de un ejemplar accesible a través de la web y que puede manejar en tiempo casi real grupos (por ejemplo, polillas esfinge ) que contienen varios cientos de taxones . En hardware de servidor PC de gama media a alta (por ejemplo, un servidor blade ) es posible una identificación en menos de un segundo para un grupo de 300 taxones. La paralelización de los códigos críticos del clasificador DAISY (usando tecnología FPGA a medida o tecnología de programación GPU de propósito general como CUDA ) dará un aumento de un orden de magnitud en el rendimiento. Esto significa que DAISY se puede utilizar para realizar identificaciones en tiempo real dentro de grupos que contienen miles de taxones (por ejemplo, moscas verdaderas ).

DAISY ha sido utilizado en varios proyectos de investigación por O'Neill [ 4 ] y otros, y ha aparecido en programas de divulgación científica y artículos de revistas. El proyecto también ha sido objeto de un artículo reciente en Science . [ 5 ]

En 2011, se instaló en el Museo de Historia Natural de Londres la primera instalación DAISY capaz de escalar a cientos de taxones. Este servidor ofrecía interfaces basadas en VNC y servicios web , y podía descargar las operaciones de comparación de patrones de alto consumo computacional a una GPU NVIDIA programada con CUDA . Esta instalación era capaz de identificar especies a partir de un conjunto de datos de más de 300 taxones en menos de un segundo en un entorno multiusuario.

Más recientemente, bajo el patrocinio de Innovate UK , DAISY ha sido ampliamente modificado para satisfacer las necesidades de las actividades de exploración y producción en el sector del petróleo y el gas, en particular la bioestratigrafía . El sistema resultante, GeoDAISY, representa un avance tecnológico significativo. Es capaz de realizar aprendizaje profundo , encapsulación de conocimiento, minería de datos basada en patrones y búsqueda de contenido (basada en imágenes) , y puede gestionar eficientemente conjuntos de entrenamiento que constan de millones de patrones en hardware estándar mediante una combinación de almacenamiento en caché de datos inteligente y OpenMP . Encontrará más detalles sobre GeoDAISY y la justificación de su desarrollo en los documentos técnicos disponibles en la página de LinkedIn de Tumbling Dice .

Véase también

Referencias

  1. "Automatización de la identificación de insectos para el inventario de la biodiversidad costarricense" . Iniciativa Darwin . Defra . Consultado el 15 de diciembre de 2010 .
  2. "Descripción general de Daisy" (PDF) . Tumbling Dice Ltd. 2007. Consultado el 14 de diciembre de 2010 .
  3. "Daisy" . Tumbling Dice . Consultado el 14 de diciembre de 2010 .
  4. Watson, Anna T. ; O'Neill, Mark A. ; Kitching, Ian J. (2003). "Un estudio cualitativo que investiga la identificación automatizada de macrolepidópteros vivos utilizando el Sistema Digital de Identificación Automatizada (DAISY)". Systematics and Biodiversity . 1 : 287– 300. doi : 10.1017/S1477200003001208 . S2CID 86265419 . 
  5. Reed, Sarah (2010). "Impulsando a DAISY". Science . 328 (5986): 1628– 1629. doi : 10.1126/science.328.5986.1628 . PMID 20576867 . 
  6. Leafsnap
  7. iPflanzen
  8. "PlantNet" . Archivado del original el 18 de abril de 2018. Consultado el 13 de abril de 2018 .
  9. Plantas
  10. Plantador
  11. NatureGate
  • Sitio web oficial
  • Página DAISY del Museo de Historia Natural