Hispanopedia WikiLa tasa de disociación en química , bioquímica y farmacología es la tasa o velocidad a la que un ligando se disocia de una proteína , por ejemplo, un receptor . [1] Es un factor importante en la afinidad de unión y la actividad intrínseca (eficacia) de un ligando en un receptor. [1] La tasa de disociación para un sustrato particular se puede aplicar a la cinética enzimática, incluido el modelo de Michaelis-Menten. [2] La tasa de disociación del sustrato contribuye a qué tan grande o pequeña será la velocidad de la enzima. [2] En el modelo de Michaelis-Menten, la enzima se une al sustrato produciendo un complejo enzima-sustrato, que puede retroceder disociándose o avanzar formando un producto. [2] La constante de tasa de disociación se define utilizando K off . [2]
La constante de Michaelis-Menten se denota por K m y se representa por la ecuación K m = (K off + K cat )/ K on [ definición necesaria ] . Las velocidades a las que la enzima se une y se disocia del sustrato se representan por K on y K off respectivamente. K m también se define como la concentración de sustrato a la que la velocidad enzimática alcanza la mitad de su velocidad máxima. [3] Cuanto más fuerte se una un ligando a un sustrato, menor será la velocidad de disociación. K m y K off son proporcionales, por lo tanto, a niveles más altos de disociación, la constante de Michaelis-Menten será mayor. [4]
Las mediciones directas mediante espectrometría de masas de ionización por electrospray (ESI-MS) han cuantificado las constantes de velocidad de disociación para interacciones de proteína-ligando de alta afinidad, como el sistema biotina-estreptavidina, lo que ofrece una comprensión más profunda de la dinámica enzima-sustrato. [5] Estudios computacionales recientes han proporcionado información sobre los procesos de difusión que influyen en las tasas de disociación de los complejos biomoleculares, destacando la importancia del movimiento molecular y la especificidad de unión en estas interacciones, la importancia es considerar tanto el movimiento físico de las moléculas como sus especificidades de unión al analizar las tasas de disociación. [6]
Referencias
- ^ ab Wanner K, Höfner G (27 de junio de 2007). Espectrometría de masas en química medicinal: aplicaciones en el descubrimiento de fármacos. John Wiley & Sons. págs. 142– 156. ISBN 978-3-527-61091-4.
- ^ abcd Berezhkovskii AM, Szabo A, Rotbart T, Urbakh M, Kolomeisky AB (abril de 2017). "Dependencia de la velocidad enzimática de la tasa de disociación del sustrato". The Journal of Physical Chemistry B . 121 (15): 3437– 3442. doi :10.1021/acs.jpcb.6b09055. PMC 5577799 . PMID 28423908.
- ^ Reuveni S, Urbakh M, Klafter J (marzo de 2014). "El papel de la desunión del sustrato en las reacciones enzimáticas de Michaelis-Menten". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 111 (12): 4391– 6. Bibcode :2014PNAS..111.4391R. doi : 10.1073/pnas.1318122111 . PMC 3970482 . PMID 24616494.
- ^ Copeland RA (2000). Enzimas: una introducción práctica a la estructura, el mecanismo y el análisis de datos . Catálogo de la Biblioteca Wiley: J. Wiley. pp. 76– 81.
- ^ Deng, Lu; Kitova, Elena N.; Klassen, John S. (1 de enero de 2013). "Cinética de disociación de la interacción estreptavidina-biotina medida mediante análisis de espectrometría de masas de ionización por electrospray directo". Revista de la Sociedad Americana de Espectrometría de Masas . 24 (1): 49– 56. Bibcode :2013JASMS..24...49D. doi :10.1007/s13361-012-0533-5. ISSN 1044-0305. PMID 23247970.
- ^ Mereghetti, Paolo; Kokh, Daria; McCammon, J Andrew; Wade, Rebecca C (diciembre de 2011). "Procesos de difusión y asociación en sistemas biológicos: teoría, computación y experimentación". BMC Biophysics . 4 (1): 2. doi : 10.1186/2046-1682-4-2 . ISSN 2046-1682. PMC 3093674 . PMID 21595997.