Aguas arriba y aguas abajo (ADN)

En biología molecular y genética , tanto aguas arriba como aguas abajo se refieren a las posiciones relativas del código genético en el ADN o ARN . Cada hebra de ADN o ARN tiene un extremo 5' y un extremo 3' , llamados así por la posición del carbono en el anillo de desoxirribosa (o ribosa ). Por convención, aguas arriba y aguas abajo se relacionan con la dirección 5' a 3' respectivamente en la que tiene lugar la transcripción del ARN. ^{[ 1 ]} Aguas arriba es hacia el extremo 5' de la molécula de ARN, y aguas abajo es hacia el extremo 3'. Al considerar el ADN de doble hebra, aguas arriba es hacia el extremo 5' de la hebra codificante para el gen en cuestión y aguas abajo es hacia el extremo 3'. Debido a la naturaleza antiparalela del ADN, esto significa que el extremo 3' de la hebra molde está aguas arriba del gen y el extremo 5' está aguas abajo.

Algunos genes de la misma molécula de ADN pueden transcribirse en direcciones opuestas. Esto significa que las regiones proximal y distal de la molécula pueden variar según el gen que se utilice como referencia.

Los términos aguas arriba y aguas abajo también se aplican a veces a una secuencia polipeptídica, donde aguas arriba se refiere a una región N-terminal y aguas abajo a los residuos C-terminales de un punto de referencia.

• Direccionalidad (biología molecular)
• Aguas arriba y aguas abajo (transducción)