Hispanopedia WikiLa Clasificación Evolutiva de Dominios Proteicos ( ECOD ) es una base de datos biológica que clasifica los dominios proteicos disponibles en el Protein Data Bank . La ECOD intenta determinar las relaciones evolutivas entre las proteínas.
De manera similar a Pfam , CATH y SCOP , ECOD compila dominios en lugar de proteínas completas. Sin embargo, ECOD se centra más en las relaciones evolutivas: en lugar de agrupar las proteínas por pliegues , que pueden representar simplemente una evolución convergente , ECOD agrupa las proteínas solo por homología demostrable . [1]
Referencias
- ^ Cheng, H; Schaeffer, RD; Liao, Y; Kinch, LN; Pei, J; Shi, S; Kim, BH; Grishin, NV (diciembre de 2014). "ECOD: una clasificación evolutiva de dominios proteicos". PLOS Computational Biology . 10 (12): e1003926. Bibcode :2014PLSCB..10E3926C. doi : 10.1371/journal.pcbi.1003926 . PMC 4256011 . PMID 25474468.