En enzimología , una UDP -N -acetilmuramoil- L -alanina— D -glutamato ligasa ( EC 6.3.2.9 ) es una enzima que cataliza la reacción química
- ATP + UDP-N-acetilmuramoil-L-alanina + D-glutamatoADP + fosfato + UDP-N-acetilmuramoil-L-alanil-D-glutamato
Los 3 sustratos de esta enzima son ATP , UDP-N-acetilmuramoil-L-alanina y D-glutamato , mientras que sus 3 productos son ADP , fosfato y UDP-N-acetilmuramoil-L-alanil-D-glutamato .
Esta enzima pertenece a la familia de las ligasas , específicamente a aquellas que forman enlaces carbono-nitrógeno como las ligasas de ácido-D-aminoácido (péptido sintasas). El nombre sistemático de esta clase de enzimas es UDP-N-acetilmuramoil-L-alanina:D-glutamato ligasa (formadora de ADP) . Otros nombres de uso común incluyen MurD sintetasa , UDP-N-acetilmuramoil-L-alanil-D-glutamato sintetasa , uridina difosfo-N-acetilmuramoilalanil-D-glutamato sintetasa , enzima que agrega D-glutamato , D-glutamato ligasa , UDP-Mur-NAC-L-Ala:D-Glu ligasa , UDP-N-acetilmuramoil-L-alanina:glutamato ligasa (formadora de ADP) y UDP-N-acetilmuramoilalanina-D-glutamato ligasa . Esta enzima participa en el metabolismo de la D-glutamina y el D-glutamato y en la biosíntesis de peptidoglicano .
Estudios estructurales
A finales de 2007, se habían resuelto 9 estructuras para esta clase de enzimas, con los códigos de acceso PDB PDB : 1E0D ,PDB : 1EEH ,PDB : 1UAG ,PDB : 2JFF ,PDB : 2JFG ,PDB : 2JFH ,PDB : 2UAG ,PDB : 3UAG yPDB : 4UAG .
Véase también
Referencias
- Ito, E; Strominger JL (1962). "Síntesis enzimática del péptido en nucleótidos de uridina bacterianos I. Adición enzimática de L-alanina, ácido D-glutámico y L-lisina" . J. Biol. Chem . 237 : 2689–2695 . doi : 10.1016/S0021-9258(19)73808-3 .
- van Heijenoort J (octubre de 2001). "Avances recientes en la formación de la unidad monomérica del peptidoglicano bacteriano". Natural Product Reports . 18 (5): 503– 19. doi : 10.1039/a804532a . PMID 11699883 .
- CE 6.3.2
- Enzimas de estructura conocida
- restos de ligasa