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EsyN

esyN (Easy Networks) [ 1 ] [ 2 ] es una herramienta web bioinformática para visualizar , construir y analizar redes de interacción molecular . esyN se basa en cytoscape.js y su ...

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esyN (Easy Networks) [ 1 ] [ 2 ] es una herramienta web bioinformática para visualizar , construir y analizar redes de interacción molecular . esyN se basa en cytoscape.js y su objetivo es facilitar el análisis de redes a cualquier persona. esyN está conectado con varias bases de datos, específicamente: pombase, flybase y la mayoría de los almacenes de datos de InterMine , DrugBank y BioGRID, desde los cuales es posible descargar las interacciones proteína-proteína o genéticas para cualquier proteína o gen en varios organismos diferentes.

Las redes publicadas en esyN se pueden publicar fácilmente en otros sitios web utilizando la metodología. [ 3 ]<iframe>

Uso

Según Google Analytics, en enero de 2016 esyN era vista por 1500 usuarios únicos al día (unos 16000 al mes) .

Las capacidades de incrustación de esyN son utilizadas por varias bases de datos para mostrar sus datos de interacción:

Véase también

Referencias

  1. ↑ Bean; et  al. (2014). "esyN: Creación, intercambio y publicación de redes" . PLOS ONE . 9 (9) e106035. doi : 10.1371/journal.pone.0106035 . PMC 4152123. PMID 25181461 .  
  2. ↑ Hoffman; et al. (2015). "Una levadura antigua para jóvenes genetistas: una introducción al sistema modelo de Schizosaccharomyces pombe" . Genetics . 201 ( 2): 403– 423. doi : 10.1534/genetics.115.181503 . PMC 4596657. PMID 26447128 .   
  3. ↑ "Tutorial: Bienvenido a esyN" . esyN.org . 2018. Archivado del original el 22 de agosto de 2014. Consultado el 10 de febrero de 2019 .
  4. ↑ "Informe de interacción física" . FlyBase . 21 de diciembre de 2018. Consultado el 10 de febrero de 2019 .
  5. ↑ "Alelo: ttk [ MI01174 ] D. melanogaster" . FlyMine . Noviembre de 2018. Consultado el 10 de febrero de 2019 .
  6. ↑ "Página de informe" . HumanMine . Noviembre de 2018. Consultado el 10 de febrero de 2019 .
  7. ↑ Rutherford KM, Lera-Ramírez M, Wood V (mayo de 2024). "PomBase: un recurso global de datos biológicos básicos: crecimiento, colaboración y sostenibilidad" . Genetics . 227 ( 1). doi : 10.1093/genetics/iyae007 . PMC 11075564. PMID 38376816 .  
  • Sitio web oficial