Articulo de referencia

Exiguobacteria

"},"type_species":{"wt":"''[[Exiguobacterium aurantiacum]]''"},"type_species_authority":{"wt":"Collins et al. 1984"},"subdivision_ranks":{"wt":"Species"},"subdivision_ref":{"wt"...

Exiguobacterium es un género de bacilos y un miembro delfilo de bajo GC de Bacillota . Collins et al . describieron por primera vez el género Exiguobacterium con la caracterización de la cepa E. aurantiacum DSM6208T de una planta procesadora de papa alcalina. [ 3 ] Se ha encontrado en áreas que abarcan un amplio rango de temperaturas (-12 °C—55 °C), incluyendo glaciares en Groenlandia y aguas termales en Yellowstone , y se ha aislado del permafrost antiguo en Siberia. [ 4 ] Esta capacidad de sobrevivir en temperaturas extremas variables los convierte en un área de estudio importante. Algunas cepas, además de la adaptación térmica dinámica, también son halotolerantes (hasta un 13 % de NaCl añadido al medio), pueden crecer dentro de un amplio rango de valores de pH (5-11), toleran altos niveles de radiación UV y estrés por metales pesados ​​(incluido el arsénico). [ 5 ]

Exiguobacterium son organismos globalmente diversos que se encuentran en una variedad de ambientes que incluyen microbialitos ( trombolitos [ 6 ] del lago Pavilion , BC y estromatolitos [ 7 ] de la laguna Socompa , Argentina), océano, [ 8 ] lagos de agua dulce, [ 9 ] hielo del Himalaya , [ 10 ] suelo del Himalaya , [ 11 ] respiraderos hidrotermales , [ 12 ] camarones de salmuera , [ 13 ] tracto gastrointestinal de peces marinos [ 14 ] y en biopelículas microbianas [ 15 ].

Se han completado siete genomas del género, ya sea completos (un cromosoma circular , con plásmidos ) o en formato de borrador (que contiene múltiples contigs no ensamblados ). Se ha encontrado una nueva especie de Exiguobacterium chiriqhucha con distribución global en lagos fríos de Groenlandia, el lago Pavilion BC y Laguna Negra, Argentina. [ 16 ] 'Chiri qhucha' en quechua significa 'lago frío'. El estudio de Gutiérrez-Preciado et al. fue confirmado por la finalización de los genomas de dos cepas de Exiguobacterium chiriqhucha RW2 y GIC31. [ 17 ] El análisis de ácidos grasos fosfolipídicos (PLFA) a diferentes temperaturas en la cepa RW2 de Exiguobacterium chiriqhucha da como resultado importantes reordenamientos de la función de la membrana celular que pueden permitir su adaptación a la temperatura, el pH y la salinidad. [ 18 ]

Biodegradación del plástico

Según un artículo del Stanford News Service, [ 19 ] el ingeniero de investigación sénior Wei-Min Wu informó en su artículo "Biodegradación y mineralización del poliestireno por gusanos de la harina que comen plástico. 2. Papel de los microorganismos intestinales." [ 20 ] que los gusanos de la harina pueden sobrevivir con una dieta de poliestireno cuando son ayudados por la cepa YT2 de Exiguobacterium que vive en su intestino.

Filogenia

La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) [ 1 ] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [ 2 ]

Especie no asignada:

  • " E. arabatum " Jakubauskas et al. 2009
  • " E. homiense " Kwon 2006a
  • " E. panipatensis " Lal y Gupta 2007
  • " E. taiwanense " Chen et al. 2006

Referencias

  1. 1 2 A.C. Parte; et  al. "Exiguobacterium" . Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) . Recuperado el 28 de febrero de 2025 .
  2. 1 2 C.L. Schoch; et al. "Exiguobacterium" . Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Recuperado el 28 de febrero de 2025 . 
  3. Collins MD, Lund BM, Farrow JA, Schleifer KH (1983). "Estudio quimiotaxonómico de una bacteria alcalófila, Exiguobacterium aurantiacum gen nov., sp. nov." . J. Gen. Microbiol . 129 (7): 2037– 2042. doi : 10.1099/00221287-129-7-2037 .
  4. Vishnivetskaya, Tatiana A.; Katariou, Sofía; Tiedje, James M. (mayo de 2009). "El género Exiguobacterium: biodiversidad y biogeografía". Extremófilos . 13 (3): 541– 555. arXiv : 1109.6589 . doi : 10.1007/s00792-009-0243-5 . PMID 19381755 . S2CID 10667997 .  
  5. ^ Ordoñeza OF, Lanzarottid E, Kurtha D, Gorritia MF, Revalec S, Cortez N, Vazquez MP, Farías ME, Turjanskie AG (julio-agosto de 2013). "Borrador de secuencia del genoma de la cepa poliextremófila Exiguobacterium sp. S17, aislada de lagos hiperarsénicos en la Puna argentina" . Anuncios del genoma . 1 (4): 2037–2042 . doi : 10.1128/genomeA.00480-13 . PMC 3735063 . PMID 23887911 .  
  6. White III RA, Grassa CJ, Suttle CA (julio-agosto de 2013). "Secuencia genómica preliminar de una cepa Exiguobacterium pavilionensis RW-2 con amplia tolerancia térmica, salinidad y pH, aislada de microorganismos modernos de agua dulce" . Genome Announcements . 1 (4): e00597–13. doi : 10.1128/genomeA.00597-13 . PMC 3738901. PMID 23929485 .  
  7. ^ Ordoñez OF, Lanzarotti E, Kurth D, Gorriti MF, Revale S, Cortez N, Vazquez MP, Farías ME, Turjanski AG (julio-agosto de 2013). "Borrador de secuencia del genoma de la cepa poliextremófila Exiguobacterium sp. S17, aislada de lagos hiperarsénicos en la Puna argentina" . Anuncios del genoma . 1 (4): 2037–2042 . doi : 10.1128/genomeA.00480-13 . PMC 3735063 . PMID 23887911 .  
  8. ^ Kim IJ, Lee MH, Jung SY, Song JJ, Oh TK, Yoon JH (2005). "Exiguobacterium aestuarii sp. nov. y E. marinum sp. nov., aislados de la llanura de marea del mar Amarillo en Corea" . Int. J. Sistema. Evolución. Microbiol . 55 (2): 885– 889. doi : 10.1099/ijs.0.63308-0 . PMID 15774680 . 
  9. ^ Raichand R, Pareek S, Singh NK, Mayilraj S (2012). "Exiguobacterium Aquaticum sp. Nov., un nuevo miembro del género Exiguobacterium". Int. J. Sistema. Evolución. Microbiol . 62 (parte 9): 2150–2155 . doi : 10.1099/ijs.0.035790-0 . PMID 22058319 . 
  10. ^ Chaturvedi P, Shivaji S (2006). "Exiguobacterium indicum sp. nov., una bacteria psicrófila del glaciar Hamta de las cadenas montañosas del Himalaya de la India" . Int. J. Sistema. Evolución. Microbiol . 56 (103): 2765–2770 . doi : 10.1099/ijs.0.64508-0 . PMID 17158975 . 
  11. ^ Singh NK, Raichand R, Kaur I, Kaur C, Pareek S, Mayilraj S (2013). "Exiguobacterium himgiriensis sp. nov., un nuevo miembro del género Exiguobacterium, aislado del Himalaya indio". Antonie van Leeuwenhoek . 103 (4): 789– 796. doi : 10.1007/s10482-012-9861-5 . PMID 23229437 . S2CID 2499061 .  
  12. Crapart S, Fardeau ML, Cayol JL, Thomas P, Sery C, Ollivier B, Combet-Blanc Y (2007). "Exiguobacterium profundum sp., nov., una bacteria moderadamente termófila productora de ácido láctico aislada de una chimenea hidrotermal de aguas profundas" . Int. J. Syst. Bacteriol . 57 (Pt 2): 287–292 . doi : 10.1099/ijs.0.64639-0 . PMID 17267965 . 
  13. Lopez-Cortes A, Schumann P, Pukall R, Stackebrandt E (2006). "Exiguobacterium mexicanum sp. nov. y Exiguobacterium artemiae sp., nov., aislados del camarón de salmuera Artemia franciscana". Syst. Appl. Microbiol . 29 (3): 183– 190. Bibcode : 2006SyApM..29..183L . doi : 10.1016/j.syapm.2005.09.007 . PMID 16564954 . 
  14. Hossain TJ, Chowdhury SI, Mozumder HA, Chowdhury MN, Ali F, Rahman N, Dey S (2020). " Exoenzimas hidrolíticas producidas por bacterias aisladas e identificadas del tracto gastrointestinal del Bombay Duck" . Front. Microbiol . 11 (2097): 2150–2155 . doi : 10.3389/fmicb.2020.02097 . PMC 7479992. PMID 32983064 .  
  15. Carneiro AR; RamosRT; Dall'Agnol H; Pinto AC; de Castro SoaresS; Santos AR; Guimarães LC; Almeida SS; Baraúna RA; das Graças DA; Franco LC; Ali A; Hassan SS; Nunes CI; Barbosa MS; Fiaux KK; Abujaile FF; Barbosa EG; Bakhtiar SM; Vilela D; Nóbrega F; dos Santos AL; Carepo MS; Azevedo V; diputado Schneider; Pellizari VH; Silva A (2012). "Secuencia del genoma de Exiguobacterium antarcticum B7, aislado de una biopelícula en Ginger Lake, Isla Rey Jorge, Antártida" . J. Bacteriol . 194 (23): 6689– 6690. doi : 10.1128/JB.01791-12 . PMC 3497522 . PMID 23144424 .  
  16. Gutiérrez-Preciado A, Vargas-Chávez C, Reyes-Prieto M, Ordoñez OF, Santos-García D, Rosas-Pérez T, Valdivia-Anistro J, Rebollar EA, Saralegui A, Moya A, Merino E, Farías ME, Latorre A, Souza V (2017). «La secuencia genómica de Exiguobacterium chiriqhucha str. N139 revela una especie que prospera en aguas frías y condiciones ambientales extremas» . PeerJ . 5e3162 . doi : 10.7717/peerj.3162 . PMC 5399880 . PMID 28439458 .  
  17. White RA 3rd, Soles SA, Gavelis G, Gosselin E, Slater GF, Lim DS, Leander B, Suttle CA (2019). "Genoma completo y análisis fisiológico de la cepa RW2 de la firmicute euritérmica Exiguobacterium chiriqhucha aislada de un microbialito de agua dulce, ampliamente adaptable a amplios rangos térmicos, de pH y de salinidad" . Frontiers in Microbiology . 9 : 3189. doi : 10.3389/fmicb.2018.03189 . PMC 6331483. PMID 30671032 .  
  18. White RA 3rd, Soles SA, Gavelis G, Gosselin E, Slater GF, Lim DS, Leander B, Suttle CA (2019). "Genoma completo y análisis fisiológico de la cepa RW2 de la firmicute euritérmica Exiguobacterium chiriqhucha aislada de un microbialito de agua dulce, ampliamente adaptable a amplios rangos térmicos, de pH y de salinidad" . Frontiers in Microbiology . 9 : 3189. doi : 10.3389/fmicb.2018.03189 . PMC 6331483. PMID 30671032 .  
  19. "Los gusanos que comen plástico podrían ofrecer una solución al creciente problema de los residuos, descubren investigadores de Stanford - Comunicado de prensa de Stanford" . news.stanford.edu . 29 de septiembre de 2015. Archivado del original el 20 de febrero de 2021. Consultado el 1 de octubre de 2015 .
  20. Yang Y, Yang J, Wu WM, Zhao J, Song Y, Gao L, Yang R, Jiang L (2015). "Biodegradación y mineralización de poliestireno por gusanos de la harina que se alimentan de plástico: Parte 2. Papel de los microorganismos intestinales". Environ. Sci. Technol . 49 (20): 12087– 93. Bibcode : 2015EnST...4912087Y . doi : 10.1021/acs.est.5b02663 . PMID 26390390 . 
  21. "El LTP" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
  22. "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
  23. "Notas de la versión LTP_10_2024" (PDF) . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
  24. "GTDB versión 09-RS220" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2024 .
  25. "bac120_r220.sp_labels" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2024 .
  26. "Historial de taxones" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 10 de mayo de 2024 .
Obtenido de " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Exiguobacterium&oldid=1337536292 "