Hispanopedia WikiLa exonucleasa III (ExoIII) es una enzima que pertenece a la familia de las exonucleasas . La ExoIII cataliza la eliminación gradual de mononucleótidos de los extremos 3'-hidroxilo del ADN de doble cadena . [ 1 ] Un número limitado de nucleótidos se elimina durante cada evento de unión, lo que da como resultado deleciones progresivas coordinadas dentro de la población de moléculas de ADN . [ 2 ]
Función
Los sustratos preferidos son los extremos 3' romos o empotrados, aunque ExoIII también actúa en muescas en ADN bicatenario para producir huecos de cadena simple. La enzima no es activa en ADN monocatenario, por lo que los extremos 3' sobresalientes son resistentes a la escisión. El grado de resistencia depende de la longitud de la extensión; las extensiones de 4 bases o más son esencialmente resistentes a la escisión. Esta propiedad se utiliza para producir deleciones unidireccionales de una molécula lineal con un extremo resistente (extremo 3' sobresaliente) y un extremo susceptible (romo o extremo 5' sobresaliente). [ 3 ]
La actividad de ExoIII depende parcialmente de la estructura helicoidal del ADN [ 4 ] y muestra dependencia de secuencia (C>A=T>G). [ 5 ]
También se ha informado que ExoIII tiene actividades de RNasa H, 3´-fosfatasa y AP-endonucleasa. [ 1 ]
Estudios actuales
Existen numerosas exonucleasas diferentes, y muchas aún están por descubrirse en bacterias; actualmente se realizan estudios en E. coli . Muchas exonucleasas pertenecen a superfamilias con diferentes dominios de la vida, lo que demuestra que la exonucleasa III es de origen antiguo. Las exonucleasas evolucionaron tempranamente en la historia de la vida y desempeñan funciones biológicas vitales. [ 6 ]
Regulación
La temperatura , la concentración de sal y la proporción de enzima con respecto al ADN afectan en gran medida la actividad enzimática, por lo que es necesario adaptar las condiciones de reacción a las aplicaciones específicas.
Referencias
- 1 2 3 PDB : 1ako ;Mol CD, Kuo CF, Thayer MM, Cunningham RP, Tainer JA (marzo de 1995). "Estructura y función de la enzima multifuncional de reparación del ADN exonucleasa III". Nature . 374 (6520): 381– 6. Bibcode : 1995Natur.374..381M . doi : 10.1038/374381a0 . PMID 7885481 . S2CID 4335526 .
- 1 2 Imagen generada en MacPyMOL©2006 DeLano Scientific
- ↑ Rogers SG, Weiss B (1980). "Exonucleasa III de Escherichia coli K-12, una AP endonucleasa" . Ácidos nucleicos Parte I. Métodos en enzimología. Vol. 65. págs. 201–11 . doi : 10.1016/S0076-6879(80)65028-9 . ISBN 978-0-12-181965-1. PMID 6246343 .
- ↑ Maniatis T, Sambrook J, Fritsch EF (1989). Clonación molecular: un manual de laboratorio (2.ª ed.). Cold Spring Harbor, NY: Cold Spring Harbor Laboratory. pp. 584–5 . ISBN 978-0-87969-309-1.
- ↑ Henikoff S (junio de 1984). "La digestión unidireccional con exonucleasa III crea puntos de ruptura específicos para la secuenciación de ADN". Gene . 28 (3): 351– 9. doi : 10.1016/0378-1119(84)90153-7 . PMID 6235151 .
- ↑ Lovett ST (diciembre de 2011). " Las exonucleasas de ADN de Escherichia coli" . EcoSal Plus . 4 (2). doi : 10.1128/ecosalplus.4.4.7 . PMC 4238392. PMID 26442508 .
Lecturas adicionales
- Richardson CC, Lehman IR, Kornberg A (enero de 1964). "Una fosfatasa de ácido desoxirribonucleico-exonucleasa de Escherichia coli . II. Caracterización de la actividad exonucleasa" . The Journal of Biological Chemistry . 239 (1): 251–8 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)51775-0 . PMID 14114851 .
- Linxweiler W, Hörz W (agosto de 1982). "Especificidad de secuencia de la exonucleasa III de E. coli" . Nucleic Acids Research . 10 (16): 4845– 59. doi : 10.1093 / nar/10.16.4845 . PMC 320823. PMID 6752885 .
- CE 3.1