Matriz extracromosómica

Una matriz extracromosómica es un método para el análisis de mosaico en genética . Es un cósmido y contiene dos genes funcionales ( de tipo salvaje ) estrechamente vinculados : un gen de interés y un marcador de mosaico . Dicha matriz se inyecta en células de la línea germinal , que ya contienen alelos mutantes (específicamente, pérdida de función ) de los tres genes en su ADN cromosómico . El cósmido, que no se empaqueta correctamente durante la mitosis , ocasionalmente está presente solo en una célula hija después de la división celular. La célula hija que contiene la matriz expresa el gen de interés; la célula que carece de la matriz, no.

El marcador de mosaico es un gen que muestra un cambio visible de fenotipo entre los alelos funcionales y no funcionales. Por ejemplo, ncl-1 , ubicado en el ADN cromosómico, muestra un nucléolo más grande que el alelo de tipo salvaje, que se encuentra en la matriz. Por lo tanto, las células que muestran nucléolos más grandes generalmente no han conservado la matriz extracromosómica.

El gen de interés es el objetivo del análisis en mosaico. Las células que carecen de la matriz extracromosómica también carecen del gen funcional de interés. Las células que se desarrollan normalmente sin la matriz no requieren el gen de interés para funcionar normalmente. Se dice que las células que no se desarrollan normalmente requieren el gen. De esta manera, se pueden identificar aquellos linajes celulares que requieren un gen específico.

Las matrices extracromosómicas sustituyen a una técnica anterior que implicaba un fragmento duplicado del cromosoma, denominada duplicación libre . Esta última técnica requería que el gen de interés y el marcador de mosaico estuvieran estrechamente vinculados en la duplicación; la primera permite la libre elección del marcador de mosaico y del gen objetivo.

Miller LM, Waring DA, Kim SK (1996). El análisis en mosaico utilizando una matriz extracromosómica ncl-1 (+) revela que lin-31 actúa en las células Pn.p durante el desarrollo vulvar de Caenorhabditis elegans . Genetics 143 (3): 1181-1191.