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HECHO (biología)

FACT ( facilita la transcripción de la cromatina , [ 1 ] a veces facilita las transcripciones de la cromatina [ 2 ] [ 3 ] ) es un complejo proteico heterodimérico que afecta la ...

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FACT ( facilita la transcripción de la cromatina , [ 1 ] a veces facilita las transcripciones de la cromatina [ 2 ] [ 3 ] ) es un complejo proteico heterodimérico que afecta la elongación de la transcripción de la ARN polimerasa II (Pol II) eucariota tanto in vitro como in vivo . Fue descubierto en 1998 como un factor purificado de células humanas que era esencial para la transcripción productiva in vitro de la Pol II en una plantilla de ADN cromatinizado . [ 4 ]

FACT consta de subunidades de 140 y 80 kilodaltons (kDa). La subunidad de 140 kDa está codificada por el gen humano SUPT16H (SPT16 en S. cerevisiae ), mientras que la subunidad de 80 kDa está codificada por el gen humano SSRP1 (POB3 en S. cerevisiae ). Ambas subunidades en levadura afectan la elongación de la transcripción de Pol II, y el FACT humano purificado se une específicamente a los mononucleosomas y al dímero de histonas H2A / H2B , pero no al tetrámero H3 / H4 (véase: partícula central del nucleosoma ) ni a Pol II. [ 5 ]

Los ensayos de co-inmunoprecipitación con proteínas recombinantes marcadas mostraron que la subunidad Spt16 interactúa con dímeros H2A/H2B y mononucleosomas, pero no con tetrámeros H3/H4, mientras que la subunidad SSRP1 interactúa solo con tetrámeros H3/H4 y no con mononucleosomas. La deleción del extremo C-terminal altamente ácido de Spt16 (una característica común de las chaperonas de histonas conocidas) no impide que Spt16 forme un complejo estable con SSRP1, pero sí elimina la interacción con mononucleosomas y la capacidad de estimular la transcripción in vitro en plantillas cromatinizadas. Las dos subunidades juntas, pero ninguna por separado, pueden estimular la formación de nucleosomas a partir de histonas libres y ADN ( actividad de chaperona de histonas ). Estas dos subunidades están altamente conservadas en todos los eucariotas y, además de la transcripción, se ha demostrado que también afectan la reparación y replicación del ADN. [ 6 ]

En las células, FACT se enriquece en partes del genoma involucradas en la elongación activa de Pol II, como se observa en la tinción con anticuerpos fluorescentes de cromosomas politénicos de Drosophila y en ensayos de inmunoprecipitación de cromatina (ChIP) en extractos de células Kc de Drosophila . [ 7 ]

Referencias

  1. ↑ Winkler, Duane D.; Luger, Karolin (27 de mayo de 2011). "The Histone Chaperone FACT: Structural Insights and Mechanisms for Nucleosome Reorganization" . The Journal of Biological Chemistry . 286 (21): 18369– 18374. doi : 10.1074/jbc.R110.180778 . ISSN 0021-9258 . PMC 3099653. PMID 21454601 .   
  2. ↑ Martin, Benjamin JE; Chruscicki, Adam T.; Howe, LeAnn J. (2018-11-01). "La transcripción promueve la interacción del complejo de facilitación de transacciones de cromatina (FACT) con los nucleosomas en Saccharomyces cerevisiae" . Genetics . 210 ( 3): 869– 881. doi : 10.1534/genetics.118.301349 . ISSN 0016-6731 . PMC 6218215. PMID 30237209 .   
  3. ↑ Frost, Jennifer M.; Kim, M. Yvonne; Park, Guen Tae; Hsieh, Ping-Hung; Nakamura, Miyuki; Lin, Samuel JH; Yoo, Hyunjin; Choi, Jaemyung; Ikeda, Yoko; Kinoshita, Tetsu; Choi, Yeonhee (2018-05-15). "El complejo FACT es necesario para la desmetilación del ADN en la heterocromatina durante la reproducción en Arabidopsis" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 115 (20): E4720– E4729. Bibcode : 2018PNAS..115E4720F . doi : 10.1073/pnas.1713333115 . ISSN 0027-8424 . PMC 5960277 . PMID 29712855 .   
  4. ↑ Orphanides, George; LeRoy, Gary; Chang, Chun-Hsiang; Luse, Donal S.; Reinberg, Danny (1998). " FACT, un factor que facilita la elongación de la transcripción a través de los nucleosomas" . Cell . 92 (1): 105–116 . doi : 10.1016/S0092-8674(00)80903-4 . PMID 9489704. S2CID 11248520 .  
  5. ↑ Orphanides, George; Wu, Wei-Hua; Lane, William S.; Hampsey, Michael; Reinberg, Danny (1999). "El factor de elongación de la transcripción específico de la cromatina FACT comprende las proteínas humanas SPT16 y SSRP1". Nature . 400 (6741): 284– 288. Bibcode : 1999Natur.400..284O . doi : 10.1038/22350 . PMID 10421373 . S2CID 4300397 .  
  6. ↑ Belotserkovskaya, Rimma; Oh, Sangtaek; Bondarenko, Vladimir A.; Orphanides, George; Studitsky, Vasily; Reinberg, Danny (2003). "FACT facilita la alteración de nucleosomas dependiente de la transcripción". Science . 301 (5636): 1090– 1093. Bibcode : 2003Sci...301.1090B . doi : 10.1126/science.1085703 . PMID 12934006 . S2CID 26667338 .  
  7. ↑ Saunders, Abbie; Werner, Janis; Andrulis, Erik D.; Nakayama, Takahiro; Hirose, Susumu; Reinberg, Danny; Lis, John T. (2003). "Seguimiento de FACT y del complejo de elongación de la ARN polimerasa II a través de la cromatina in vivo". Science . 301 (5636): 1094– 1096. Bibcode : 2003Sci...301.1094S . doi : 10.1126/science.1085712 . PMID 12934007 . S2CID 10064786 .  

Lecturas adicionales

Reinberg, D., Sims, R. (2006). Dinámica de nucleosomas de FACTo . Journal of Biological Chemistry, 281 (33) 23297-23391.