FAM114A2 ( marco de lectura abierto 3 del cromosoma 5 ) es un gen ubicado en el cromosoma 5 humano que codifica la proteína FAM114A2. Su función no se conoce con precisión. Sin embargo, FAM114A2 está altamente conservada en mamíferos y presenta homólogos tanto en hongos como en plantas.
Proteína
La proteína FAM114A2 tiene 505 aminoácidos de longitud [ 5 ] con un peso molecular de 55,5 kdal y un punto isoeléctrico de 4,66. [ 6 ] Se predice que permanece en el núcleo después de la traducción [ 7 ] Hay evidencia de que c5orf3 interactúa con otra proteína de función desconocida del cromosoma 5, c5orf4 [ 8 ] Se cree que esta proteína incluye un bucle P [ 9 ] que sugiere una función en la unión de ATP y/o GTP [ 10 ]
Gene
El gen FAM114A2 se localiza en el cromosoma 5 (5q31-33). [ 11 ] Este gen tiene 14 exones que abarcan su secuencia. [ 5 ] La secuencia codificante es de 2886 pares de bases con una región 5' UTR de 94 pares de bases y una región 3' UTR de 1273 pares de bases. [ 5 ] Se expresa en altos niveles en la mayoría de los tejidos del cuerpo humano. [ 11 ] También se expresa en altos niveles en los tejidos del cerebro humano. [ 12 ]
Referencias
- 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000055147 – Ensembl , mayo de 2017
- 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000020523 – Ensembl , mayo de 2017
- ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
- ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
- 1 2 3 Familia Homo sapiens con similitud de secuencia 114, miembro A2 (FAM114A2) - Nucleótido - NCBI
- ↑ Banco de trabajo de biología: http://seqtool.sdsc.edu/CGI/BW.cgi# !
- ↑ Servidor WWW PSORT
- ↑ STRING: http://string-db.org/newstring_cgi/show_network_section.pl Archivado el 15/05/2013 en Wayback Machine .
- ↑ "STRING: Redes de asociación de proteínas funcionales" . Archivado del original el 26/10/2021 . Consultado el 07/05/2011 .
- ↑ Saraste M, Sibbald PR, Wittinghofer A (noviembre de 1990). "El bucle P: un motivo común en las proteínas de unión a ATP y GTP". Trends Biochem. Sci . 15 (11): 430–4 . doi : 10.1016/0968-0004(90)90281-f . PMID 2126155 .
- 1 2 Gen FAM114A2 - GeneCards | Proteína F1142 | Anticuerpo F1142
- ↑ Atlas cerebral de Allen: http://human.brain-map.org/search?type=mi Archivado el 18 de agosto de 2011 en Wayback Machine
Enlaces externos
- Localización del genoma humano FAM114A2 y página de detalles del gen FAM114A2 en el navegador genómico de UCSC .
Lecturas adicionales
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "Diversificación de la modulación transcripcional: identificación y caracterización a gran escala de promotores alternativos putativos de genes humanos" . Genome Res . 16 (1): 55– 65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129. PMID 16344560 .
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "Estado, calidad y expansión del proyecto de ADNc de longitud completa de los NIH: la Colección de Genes de Mamíferos (MGC)" . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "Secuenciación completa y caracterización de 21.243 cDNA humanos de longitud completa" . Nat. Genet . 36 (1): 40– 5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Construcción y caracterización de una biblioteca de ADNc enriquecida en longitud completa y en el extremo 5'". Gene . 200 ( 1–2 ): 149–56 . doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
- Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: un método simple para reemplazar la estructura de la caperuza de los ARNm eucariotas con oligorribonucleótidos". Gene . 138 ( 1–2 ): 171–4 . doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
- Genes en el cromosoma 5 humano
- Fragmentos de genes del cromosoma 5 humano