Articulo de referencia

Fanzor

La proteína Fanzor (Fz) es una endonucleasa de ADN guiada por ARN eucariota , lo que significa que es un tipo de enzima de corte de ADN que utiliza ARN para dirigirse a genes de...

La proteína Fanzor (Fz) es una endonucleasa de ADN guiada por ARN eucariota , lo que significa que es un tipo de enzima de corte de ADN que utiliza ARN para dirigirse a genes de interés. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] En bacterias , los sistemas de endonucleasas de ADN guiadas por ARN , como el sistema CRISPR/Cas , funcionan como un sistema inmunitario para prevenir infecciones cortando el material genético viral. [ 4 ] Actualmente, la escisión de ADN mediada por CRISPR / Cas9 tiene una amplia aplicación en la investigación biológica y un gran potencial médico en la edición genética humana . [ 4 ]

Fanzor pertenece al sistema OMEGA. [ 1 ] [ 2 ] [ 4 ] Evolutivamente, comparte un ancestro común , OMEGA TnpB, con el sistema CRISPR / Cas12 . [ 1 ] [ 5 ] Debido al ancestro común entre el sistema OMEGA y el sistema CRISPR, la estructura proteica y la función de corte de ADN de Fanzor y Cas12 permanecen en gran medida conservadas. [ 1 ] [ 6 ] Combinado con la presencia generalizada de Fanzor en los diversos genomas de diferentes especies eucariotas , [ 6 ] esto plantea la posibilidad de que OMEGA Fanzor sea una alternativa al sistema CRISPR/Cas con mejor eficiencia y compatibilidad en otros organismos eucariotas complejos , como los mamíferos .

Fanzor como posible editor del genoma humano

Debido a su origen eucariota , el sistema OMEGA Fanzor puede tener algunas ventajas sobre el editor genético CRISPR/Cas, mejor estudiado , en términos de aplicaciones de edición del genoma humano. [ 1 ] En un sistema CRISPR/Cas9, las proteínas Cas9 son guiadas por el ARN guía (ARNg) y el motivo adyacente al protoespaciador (PAM) para la escisión del ADN. Curiosamente, los genes Fanzor en el hongo del suelo S. punctatus [ 1 ] [ 5 ] también contienen secuencias no codificantes llamadas ωRNA . De manera similar a CRISPR/Cas9, se ha demostrado que la proteína Fanzor escinde el ADN en tubos de ensayo bajo la guía del ωRNA y el motivo adyacente al objetivo (TAM). [ 1 ]

Como se muestra en el esquema, la escisión del ADN por Cas9 está dirigida por el ARN guía (gRNA) y la secuencia PAM "NGG" en el ADN diana, donde N puede ser cualquiera de los cuatro componentes del ADN (A, G, C o T). De manera similar, la escisión del ADN por Fanzor está dirigida por el ARN ω y la secuencia TAM "CATA" en el ADN diana. No se muestra una representación precisa del tamaño y la estructura de los ARN y las proteínas.
Como se muestra en el esquema, la escisión del ADN por Cas9 es dirigida por el ARN guía y la secuencia PAM "NGG" [ 7 ] en el ADN diana, donde N puede ser cualquiera de los cuatro componentes del ADN (A, G, C o T). De manera similar, la escisión del ADN por Fanzor es dirigida por el ARN ω y la secuencia TAM "CATA" en el ADN diana1. No es una representación precisa del tamaño y la estructura de los ARN y las proteínas.

En células humanas, la proteína Fanzor de Spizellomyces punctatus se probó con éxito y se demostró que corta el ADN de manera efectiva. [ 1 ] Sin embargo, su eficiencia es menor en comparación con el sistema CRISPR/Cas12a, estrechamente relacionado. [ 1 ] Al modificar y ajustar el ARN ω y la secuencia de aminoácidos, se diseñó una segunda versión de la proteína Fanzor de S. punctatus con una eficiencia de corte mejorada, comparable a la del sistema CRISPR/Cas12a. [ 1 ] Esto demuestra que, con mejores modificaciones y más investigación, OMEGA Fanzor tiene el potencial de igualar al sistema CRISPR en la edición del genoma humano en el futuro.

Importancia clínica y biotecnológica

Los estudios concluyen que Fanzor tiene un gran potencial para la edición eficiente del genoma humano [ 1 ] [ 6 ] con una mayor probabilidad de no ser atacado por el sistema inmunitario. [ 6 ] Por ejemplo, Fanzor podría usarse en tratamientos personalizados contra el cáncer donde las propias células T del paciente —células importantes del sistema inmunitario que reconocen y combaten patógenos extraños— se editan para reconocer y destruir células cancerosas. [ 2 ] [ 8 ] En el campo de la medicina regenerativa , ofrece esperanza para una aplicación en la terapia con células madre para tratar muchas enfermedades de origen genético como la diabetes tipo 1 o enfermedades neurodegenerativas . [ 2 ]

Además, Fanzor podría utilizarse potencialmente para la edición del genoma en óvulos y espermatozoides [ 2 ] para la prevención de enfermedades y el tratamiento de la infertilidad . Sin embargo, la intervención en el ADN de dichas células conlleva riesgos y requiere estrictas directrices éticas . [ 9 ]

Una de las principales ventajas de Fanzor en comparación con el sistema CRISPR/Cas9 es su pequeño tamaño. Por lo tanto, puede administrarse con vectores virales , que son cuerpos inactivos modificados de virus diseñados para administrar material genético de forma segura, como los adenovirus . [ 4 ] Los adenovirus se utilizan comúnmente en aplicaciones médicas como la administración de genes o vacunas [ 10 ] que no provocan respuestas inmunitarias en el cuerpo humano. [ 4 ]

Sin embargo, los investigadores advierten que es necesario realizar más investigaciones para mejorar la eficiencia [ 1 ] [ 6 ] y la precisión de la edición. [ 1 ]

Además de su aplicación en células humanas, Fanzor es una herramienta prometedora para la edición genómica específica en plantas, debido a las ventajas mencionadas de que la proteína sea de pequeño tamaño. [ 2 ] De este modo, se podría mejorar el contenido nutricional , la resistencia a las enfermedades y la asequibilidad de los cultivos . [ 11 ] Además, en relación con los desafíos actuales y futuros causados ​​por el cambio climático , los cultivos podrían adaptarse para soportar mejor factores de estrés como la sequía , la salinidad y el aumento de las temperaturas. [ 12 ]

Referencias

  1. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 Saito, Makoto; Xu, Peiyu; Faure, Guilhem; Maguire, Samantha; Kannan, Soumya; Altae-Tran, Han; Vo, Sam; Desimone, AnAn; Macrae, Rhiannon K.; Zhang, Feng (2023-08-01). "Fanzor es una endonucleasa guiada por ARN programable eucariota" . Nature . 620 (7974): 660– 668. Bibcode : 2023Natur.620..660S . doi : 10.1038/s41586-023-06356-2 . ISSN 1476-4687 . PMC 10432273 . PMID 37380027 .   
  2. 1 2 3 4 5 6 Awan, Muhammad Jawad Akbar; Awan, Muhammad Raza Ali; Amin, Imran; Mansoor, Shahid (2023). "Fanzor: una endonucleasa compacta programable guiada por ARN de eucariotas". Trends in Biotechnology . 41 (11): 1332– 1334. doi : 10.1016/j.tibtech.2023.08.003 . ISSN 0167-7799 . PMID 37673694 . S2CID 261536553 .   
  3. Bao, Weidong; Jurka, Jerzy (2013-04-01). " Los homólogos del TnpB_IS605 bacteriano están ampliamente distribuidos en diversos elementos transponibles eucariotas" . Mobile DNA . 4 (1): 12. doi : 10.1186/1759-8753-4-12 . ISSN 1759-8753 . PMC 3627910. PMID 23548000 .   
  4. 1 2 3 4 5 Badon, Isabel Wen; Oh, Yeounsun; Kim, Ho-Joong; Lee, Seung Hwan (2023). " Aplicación reciente del sistema CRISPR-Cas12 y OMEGA para la edición del genoma" . Terapia molecular . 32 (1): 32– 43. doi : 10.1016/j.ymthe.2023.11.013 . ISSN 1525-0016 . PMC 10787141. PMID 37952084 .   
  5. 1 2 Yang, Hui; Patel, Dinshaw J. (2023-11-06). "Fanzors: sorprendente expansión de las endonucleasas guiadas por ARN a eucariotas" . Cell Research . 34 (2): 99– 100. doi : 10.1038/s41422-023-00894-0 . ISSN 1748-7838 . PMC 10837191. PMID 37932446. S2CID 265041856 .    
  6. 1 2 3 4 5 Jiang, Kaiyi; Lim, Justin; Sgrizzi, Samantha; Trinh, Michael; Kayabolen, Alisan; Yutin, Natalia; Bao, Weidong; Kato, Kazuki; Koonin, Eugenio V.; Gootenberg, Jonathan S.; Abudayyeh, Omar O. (2023). "Las endonucleasas de ADN guiadas por ARN programables están muy extendidas en los eucariotas y sus virus" . Avances científicos . 9 (39): –0171. Código Bib : 2023SciA....9K.171J . doi : 10.1126/sciadv.adk0171 . PMC 10530073 . PMID 37756409 .  
  7. Anders, Carolin; Niewoehner, Ole; Duerst, Alessia; Jinek, Martin (septiembre de 2014). "Base estructural del reconocimiento del ADN diana dependiente de PAM por la endonucleasa Cas9" . Nature . 513 ( 7519): 569–573 . Bibcode : 2014Natur.513..569A . doi : 10.1038/nature13579 . PMC 4176945. PMID 25079318 .  
  8. Dimitri, Alexander; Herbst, Friederike; Fraietta, Joseph A. (18 de marzo de 2022). "Ingeniería de la próxima generación de células T CAR con edición genética CRISPR-Cas9" . Molecular Cancer . 21 (1): 78. doi : 10.1186/s12943-022-01559-z . PMC 8932053. PMID 35303871 .  
  9. Rubeis, Giovanni; Steger, Florian (2018-07-01). "Riesgos y beneficios de la edición del genoma de la línea germinal humana: un análisis ético" . Asian Bioethics Review . 10 (2): 133– 141. doi : 10.1007/s41649-018-0056-x . ISSN 1793-9453 . PMC 7747319. PMID 33717282 .   
  10. Lee, Cody S.; Bishop, Elliot S.; Zhang, Ruyi; Yu, Xinyi; Farina, Evan M.; Yan, Shujuan; Zhao, Chen; Zeng, Zongyue; Shu, Yi; Wu, Xingye; Lei, Jiayan; Li, Yasha; Zhang, Wenwen; Yang, Chao; Wu, Ke; Wu, Ying; Ho, Sherwin; Athiviraham, Aravind; Lee, Michael J.; Wolf, Jennifer Moriatis; Reid, Russell R.; He, Tong-Chuan (2017). "Administración de genes mediada por adenovirus: Aplicaciones potenciales para terapias basadas en genes y células en la nueva era de la medicina personalizada" . Genes & Diseases . 4 (2): 43– 63. doi : 10.1016/j.gendis.2017.04.001 . ISSN 2352-3042 . PMC 5609467 . PMID 28944281 . S2CID 34626858 .    
  11. Pixley, Kevin V.; Falck-Zepeda, Jose B.; Paarlberg, Robert L.; Phillips, Peter WB; Slamet-Loedin, Inez H.; Dhugga, Kanwarpal S.; Campos, Hugo; Gutterson, Neal (abril de 2022). "Cultivos editados genómicamente para mejorar la seguridad alimentaria de los pequeños agricultores" . Nature Genetics . 54 (4): 364–367 . doi : 10.1038/s41588-022-01046-7 . hdl : 10568/119492 . PMID 35393597. S2CID 248025116 .  
  12. Karavolias, Nicholas G.; Horner, Wilson; Abugu, Modesta N.; Evanega, Sarah N. (7 de septiembre de 2021). "Aplicación de la edición genética para el cambio climático en la agricultura" . Frontiers in Sustainable Food Systems . 5 685801. Bibcode : 2021FrSFS...585801K . doi : 10.3389/fsufs.2021.685801 .