Fermentibacteria (anteriormente Hyd24-12) es un filo bacteriano con estatus de candidato . [ 2 ]
La secuencia clonal original utilizada para definir Fermentibacteria como un filo ( AJ535232 ) se recuperó del entorno de filtración fría de Hydrate Ridge (Margen de Cascadia, frente a la costa de Oregón, EE. UU.). [ 3 ] Los primeros genomas de este filo se recuperaron de muestras de digestores anaeróbicos mesófilos a gran escala en plantas de tratamiento de aguas residuales danesas. [ 2 ] Se infirió que los tres genomas recuperados representan organismos que dependen de la fermentación de azúcares simples como fuente de energía, y por lo tanto se propuso el nombre "Fermentibacteria" (como en "fermentar"). [ 2 ]
Se han detectado miembros de este filo en una amplia gama de entornos, incluyendo filtraciones de metano, [ 4 ] arenas de arrecifes de coral, [ 5 ] y la boca del delfín. [ 6 ]
Clasificación
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) [ 1 ] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [ 7 ]
- Clase "Fermentibacterias" Kirkegaard 2016
- Orden "Fermentibacterales" Kirkegaard 2016
- Familia "Fermentibacteraceae" Kirkegaard 2016
- Género " Candidatus Aegiribacteria " Hamilton et al. 2016 [ 11 ] [ 12 ]
- Género " Candidatus Fermentibacter " Kirkegaard 2016
- Especie " Ca. F. daniensis" Kirkegaard 2016 [ 2 ]
- Género " Candidatus Sabulitectum " Saad et al. 2017
- Especie " Ca. S. silens" Saad et al. 2017 [ 13 ]
- Familia "Fermentibacteraceae" Kirkegaard 2016
- Orden "Fermentibacterales" Kirkegaard 2016
Referencias
- 1 2 Fermentibacterota en LPSN ; Freese, HM; Meier-Kolthoff, JP; Sardà Carbasse, J.; Afolayan, AO; Göker, M. (29 de octubre de 2025). "TYGS y LPSN en 2025: un recurso global de datos biológicos básicos para la clasificación y nomenclatura basadas en el genoma de procariotas dentro de la Diversidad Digital de DSMZ". Nucleic Acids Research . 53 : D1– D12. doi : 10.1093/nar/gkaf1110 .
- ^ Kirkegaard , Rasmus Hansen ; Düholm, Morten Simonsen; McIlroy, Simon Jon; Nierychlo, Marta; Karst, Søren Michael; Albertsen, Mads; Nielsen, Per Halkjær (octubre de 2016). "Conocimientos genómicos sobre miembros del filo candidato Hyd24-12 común en digestores anaeróbicos mesófilos" . La Revista ISME . 10 (10): 2352–2364 . doi : 10.1038/ismej.2016.43 . ISSN 1751-7370 . PMC 5030696 . PMID 27058503 .
- ^ Knittel, Katrin; Boecio, Antje; Lemke, Andreas; Eilers, Heike; Lochte, Karin; Pfannkuche, Olaf; Enlace, Peter; Amann, Rudolf (julio de 2003). "Actividad, distribución y diversidad de reductores de sulfato y otras bacterias en sedimentos sobre hidratos de gas (Cascadia Margin, Oregon)". Revista de Geomicrobiología . 20 (4): 269– 294. doi : 10.1080/01490450303896 . hdl : 21.11116/0000-0001-D20F-2 . ISSN 0149-0451 . S2CID 140639772 .
- ^ Ruff, S. Emil; Biddle, Jennifer F.; Teske, Andreas P.; Knittel, Katrin; Boecio, Antje; Ramette, Alban (16 de marzo de 2015). "Dispersión global y diversificación local del microbioma de filtración de metano" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 112 (13): 4015– 4020. Código bibliográfico : 2015PNAS..112.4015R . doi : 10.1073/pnas.1421865112 . ISSN 0027-8424 . PMC 4386351 . PMID 25775520 .
- ↑ Schöttner, Sandra; Pfitzner, Barbara; Grünke, Stefanie; Rasheed, Mohammed; Wild, Christian; Ramette, Alban (2011-05-09). " Factores determinantes de la dinámica de la diversidad bacteriana en arenas de arrecifes de coral de carbonato y silicato permeables del Mar Rojo" . Environmental Microbiology . 13 (7): 1815– 1826. doi : 10.1111/j.1462-2920.2011.02494.x . ISSN 1462-2912 . PMC 3207121. PMID 21554515 .
- ↑ Dudek, Natasha K.; Sun, Christine L.; Burstein, David; Kantor, Rose S.; Aliaga Goltsman, Daniela S.; Bik, Elisabeth M.; Thomas, Brian C.; Banfield, Jillian F.; Relman, David A. (2017-12-18). "Nueva diversidad microbiana y potencial funcional en el microbioma oral de mamíferos marinos" (PDF) . Current Biology . 27 (24): 3752–3762.e6. doi : 10.1016/j.cub.2017.10.040 . ISSN 1879-0445 . PMID 29153320 .
- ↑ Schoch CL; et al. "Fermentibacterota" . Base de datos taxonómica del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Consultado el 5 de junio de 2025 .
- ↑ "GTDB versión 10-RS226" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
- ↑ "bac120_r226.sp_label" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
- ↑ "Historial de taxones" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
- ↑ Aegiribacteria en LPSN ; Freese, HM; Meier-Kolthoff, JP; Sardà Carbasse, J.; Afolayan, AO; Göker, M. (29 de octubre de 2025). "TYGS y LPSN en 2025: un recurso global de datos biológicos básicos para la clasificación y nomenclatura basadas en el genoma de procariotas dentro de la Diversidad Digital DSMZ". Nucleic Acids Research . 53 : D1– D12. doi : 10.1093/nar/gkaf1110 .
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- ↑ Saad, Sainab; Bhatnagar, Srijak; Tegetmeyer, Halina E.; Geelhoed, Jeanine S.; Strous, Marc; Ruff, S. Emil (2017). "La exposición transitoria al oxígeno o al nitrato revela la ecofisiología de las poblaciones microbianas bentónicas fermentativas y reductoras de sulfato" . Environmental Microbiology . 19 (12): 4866– 4881. doi : 10.1111/1462-2920.13895 . ISSN 1462-2920 . PMC 5763382. PMID 28836729 .
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