Hispanopedia Wiki
Articulo de referencia

FlexAID

FlexAID es un software de acoplamiento molecular que utiliza moléculas pequeñas y péptidos como ligandos , y proteínas y ácidos nucleicos como dianas de acoplamiento. Como su no...

Hispanopedia WikiContenido en espanolLectura gratuita

FlexAID es un software de acoplamiento molecular que utiliza moléculas pequeñas y péptidos como ligandos , y proteínas y ácidos nucleicos como dianas de acoplamiento. Como su nombre indica, FlexAID admite la flexibilidad total del ligando, así como la flexibilidad de las cadenas laterales de la diana. Para ello, emplea una función de puntuación suave basada en la complementariedad de las dos superficies (ligando y diana).

Se ha demostrado que FlexAID supera a software ampliamente utilizado, como AutoDock Vina y FlexX, en la predicción de conformaciones de unión. Esto es particularmente cierto en casos donde la flexibilidad del objetivo es crucial, como suele ocurrir al usar modelos de homología. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] El código fuente está disponible en GitHub bajo la licencia Apache . [ 4 ]

Interfaz gráfica de usuario

Los autores originales también han desarrollado un complemento PyMOL para FlexAID, NRGsuite. [ 5 ]

Véase también

Referencias

  1. ↑ "Sistemas Computacionales y Farmacología Estructural" . biophys.umontreal.ca . Grupo de Investigación Najmanovich . Consultado el 17 de diciembre de 2025 .
  2. ↑ Morency, Louis-Philippe; Gaudreault, Francis; Najmanovich, Rafael (2018). «Aplicaciones de NRGsuite y el software de acoplamiento molecular FlexAID en el descubrimiento y diseño computacional de fármacos». Descubrimiento y diseño computacional de fármacos . Métodos en biología molecular. Vol. 1762. pp. 367–388 . doi : 10.1007/978-1-4939-7756-7_18 . ISBN   978-1-4939-7755-0. PMID 29594781 . 
  3. ↑ Gaudreault, Francis; Najmanovich, Rafael J. (27 de julio de 2015). "FlexAID: Revisando el acoplamiento en estructuras no nativas complejas" (PDF) . Journal of Chemical Information and Modeling . 55 (7): 1323– 1336. doi : 10.1021/acs.jcim.5b00078 . ISSN 1549-9596 . PMID 26076070 .  
  4. ↑ GitHub - NRGlab/FlexAID: Acoplamiento flexible de inteligencia artificial. , NRGlab, 28-02-2018 , consultado el 22-05-2019
  5. ↑ Gaudreault, Francis; Morency, Louis-Philippe; Najmanovich, Rafael J. (2015-12-01). "NRGsuite: un complemento de PyMOL para realizar simulaciones de acoplamiento en tiempo real usando FlexAID" . Bioinformatics . 31 ( 23): 3856– 3858. doi : 10.1093/bioinformatics/btv458 . ISSN 1367-4803 . PMC 4653388. PMID 26249810 .   
  • Recursos del Grupo de Investigación Najmanovich