Centro de Recursos Genéticos de Hongos

Fundado en 1960, el Centro de Recursos Genéticos de Hongos (FGSC) es el principal repositorio abierto de hongos genéticamente caracterizados . El FGSC es miembro de la Federación Mundial de Colecciones de Cultivos y una colección destacada en la Red de Coordinación de Investigación de la Red de Colecciones de Cultivos de EE. UU .

El FGSC distribuye cepas de Neurospora y Aspergillus , así como un número limitado de Fusarium , Magnaporthe y muchas cepas de proyectos actuales de genomas fúngicos . ^{[ 1 ]}

En las décadas de 1980 y 1990, el FGSC añadió a su colección materiales moleculares, incluidos genes clonados , vectores de clonación y bibliotecas genéticas .

A medida que se han secuenciado más genomas de hongos, el FGSC ha reevaluado la definición de un sistema genético. Esto los ha llevado a ampliar la colección, con materiales adicionales que incluyen cepas de programas genómicos ^{[ 2 ]} y colecciones de mutantes para organismos como Neurospora crassa , Aspergillus nidulans , Cryptococcus neoformans y Candida albicans .

Como repositorio genético, el FGSC siempre se ha esforzado por representar la diversidad de materiales genéticos disponibles. Con este fin, conserva un gran número de cepas de algunas especies diferentes. Más específicamente, cepas de 76 especies diferentes que representan 23 géneros diferentes . De estas, hay más de diez cepas para solo diecinueve especies diferentes. Estas cepas han sido depositadas por 310 personas diferentes, 64 de las cuales han depositado solo una cepa. El FGSC también conserva varias cepas no catalogadas, incluida la colección de cepas de tipo silvestre del Dr. David Perkins , así como cepas de Neurospora de otros investigadores jubilados. Estas se conservan con el entendimiento de que se mantendrán mientras haya espacio disponible. No están catalogadas y están disponibles tal cual. Otras colecciones de cepas incluyen Allomyces (pdf) , Aspergillus niger , Ustilago madis y cepas de Neurospora de la colección histórica del laboratorio Tatum.

Entre enero de 1998 y diciembre de 2018, el FGSC distribuyó más de 630 000 cultivos, incluyendo cerca de 5000 mutantes individuales y más de 20 000 mutantes con deleción génica, dispuestos en placas de 96 pocillos. Desde el desarrollo de la base de datos del FGSC en 1987, el FGSC ha distribuido más de 650 000 cepas.

El FGSC se fundó en 1960 en el Dartmouth College con una subvención de la Fundación Nacional de Ciencias de los Estados Unidos . El Dr. R. Barratt fue el primer director del FGSC. Desde entonces, el FGSC se ha mudado tres veces y ha tenido su sede en la Universidad Estatal de Humboldt , el Centro Médico de la Universidad de Kansas , la Universidad de Missouri-Kansas City y, desde 2014, en la Universidad Estatal de Kansas.En el Centro Médico de la Universidad de Kansas, el Dr. J. Kinsey fue director y trabajó en la genética del metabolismo de los aminoácidos y posteriormente identificó el transposón "Tad" en una cepa de Neurospora crassa de Adiopodoume, Costa de Marfil. ^{[ 3 ]} En la Universidad de Missouri-Kansas City, el Dr. Michael Plamann, quien trabajó en la dinámica del citoesqueleto, fue el director. ^{[ 4 ]} Desde 2014, el Dr. John Leslie del Departamento de Patología Vegetal de la Universidad Estatal de Kansas ha sido el director.

El FGSC ha tenido tres curadores desde su creación. William (Bill) Ogata fue el primer curador, cargo que ocupó hasta su jubilación en 1981. Fue sucedido por Craig Wilson en Humboldt. El Sr. Wilson se trasladó con la colección a Kansas City, donde en 1995 el Dr. Kevin McCluskey asumió el cargo de curador. Desde 1995, el acervo del FGSC creció de 8000 cepas a más de 25 000. ^{[ 5 ]} Asimismo, se publicaron guías de buenas prácticas para colecciones de cultivos, las cuales se integraron a las prácticas del FGSC. ^{[ 6 ]}

Durante muchos años, el FGSC recibió apoyo de la Fundación Nacional de Ciencias de los Estados Unidos a través de su programa de Colección de Animales Vivos. ^{[ 7 ]} A partir de 2015, el FGSC ha recibido apoyo de la Facultad de Agricultura de la Universidad Estatal de Kansas y de las tarifas pagadas por los clientes.

Uno de los principales objetivos del FGSC es facilitar el acceso a la investigación con hongos filamentosos ( moho ). Para ello, el sitio web del FGSC ofrece protocolos exhaustivos ^{[ 8 ]} para Neurospora y Aspergillus . Otros materiales y servicios están disponibles según las necesidades específicas.

La mayoría de las actividades de investigación en el FGSC están dirigidas a agregar valor a los materiales de la colección. Entre los proyectos específicos se incluyen la mejora de cepas, la identificación de marcadores desconocidos y la producción de cepas con múltiples marcadores. El trabajo reciente incluye la caracterización de mutaciones termosensibles hasta ahora desconocidas en Neurospora y la caracterización de mutantes clásicos hasta ahora desconocidos en colaboración con el JGI del Departamento de Energía de los Estados Unidos.

El FGSC fue parte del programa de Genómica Funcional de Neurospora. ^{[ 9 ]} y registró más de 13 000 mutantes de deleción de genes que en conjunto conformaron un conjunto de deleción de genoma completo entre 2006 y 2014.

• Centro de Recursos Genéticos de Hongos Archivado el 1 de octubre de 2006 en Wayback Machine
• Federación Mundial de Colecciones Culturales
• La Red de Colecciones Culturales de Estados Unidos
• Genomas de hongos y otros eucariotas en la Iniciativa Conjunta del Genoma del Departamento de Energía de los Estados Unidos.
• Recursos de micología en línea