GIMIAS

GIMIAS es un entorno orientado al flujo de trabajo , centrado en el procesamiento y la simulación de imágenes biomédicas . Este marco de código abierto es extensible mediante complementos y se enfoca en la creación de prototipos de software para investigación y clínica . GIMIAS se ha utilizado para desarrollar prototipos clínicos en los campos de la imagenología y simulación cardíaca , la imagenología y simulación angiográfica y la neurología ^{[ 1 ] [ 2 ].}

GIMIAS está siendo financiado por varios proyectos nacionales e internacionales como cvREMOD, euHeart o VPH NoE. ^{[ 3 ]}

GIMIAS significa Interfaz Gráfica para Análisis y Simulación de Imágenes Médicas. GIMIAS proporciona una interfaz gráfica de usuario con todas las funciones principales de entrada/salida de datos, visualización e interacción para imágenes, mallas y señales. Las características de GIMIAS incluyen:

• Navegador DICOM y conexión PACS
• Compatibilidad con diferentes modalidades de imagen.
• Visualización de datos biomédicos en 2D y 3D: reformateo multiplanar, vista de corte ortogonal, vista de cortes múltiples, renderizado volumétrico , renderizado de rayos X, proyección de máxima intensidad.
• Varios formatos de entrada y salida: DICOM , vtk, stl, Nifty, Analyze.
• Control de la película: reproducir, pausar, control de velocidad
• Múltiples objetos de datos: imágenes DICOM 2D, imágenes 3D, mallas de superficie, mallas volumétricas, señales o anotaciones.
• Anotaciones de imágenes y mallas de superficie: puntos de referencia, mediciones y regiones de interés.
• Navegación del flujo de trabajo clínico que puede ayudar al usuario a navegar desde los datos del paciente hasta la información útil para el tratamiento del paciente. ^{[ 4 ]}
• Otras herramientas adicionales para la segmentación de imágenes , manipulación de mallas y navegación de señales. ^{[ 5 ]}

GIMIAS es un marco de desarrollo que permite a los desarrolladores crear sus propias aplicaciones médicas utilizando diferentes complementos que se pueden cargar y combinar dinámicamente. Los prototipos desarrollados en GIMIAS pueden ser verificados por los usuarios finales en escenarios reales y con datos reales en las primeras etapas de desarrollo. ^{[ 6 ]}

Está desarrollado en lenguaje C++ , tiene una arquitectura de complementos y es multiplataforma mediante la herramienta estándar CMake . Permite la integración de nuevas bibliotecas con la herramienta CSnake y se basa en bibliotecas de código abierto comunes como VTK , ITK , MITK, BOOST y wxWidgets . Un complemento puede extender el marco añadiendo nuevos componentes de procesamiento, componentes de interfaz gráfica de usuario (GUI) como barras de herramientas o ventanas, nuevos tipos de procesamiento de datos o nuevas bibliotecas de renderizado. ^{[ 7 ]}

GIMIAS admite varios tipos de complementos, desde una simple DLL y un complemento de línea de comandos compatible con 3D Slicer hasta un complemento GIMIAS más complejo con interfaz gráfica personalizada. La generación automática de la interfaz gráfica y el modelo de objetos de datos extensible permiten compartir complementos con otros marcos de trabajo y potenciar la interoperabilidad.

El software está disponible para Windows y Linux , de 64 y 32 bits . ^{[ 8 ]}

Las versiones iniciales del marco de código abierto se publicaron a finales de 2009 (GIMIAS 0.6.15 se publicó en octubre de 2009). ^{[ 9 ]}

En 2010, se redobló el esfuerzo para potenciar el marco de código abierto, ofreciendo más funcionalidades como gestor de flujos de trabajo, compatibilidad con el complemento 3D Slicer , visor de señales y vistas personalizables. Ese mismo año se lanzaron las versiones 0.8.1, 1.0.0, 1.1.0 y 1.2.0 de GIMIAS.

El equipo de GIMIAS ha colaborado con:

• Equipo cmgui: probar el uso de la API cmgui provisional de la plataforma de software GIMIAS ^{[ 10 ] [ 11 ]}
• Grupo CTK ^{[ 12 ]}
• Grupo B3C (MAF) ^{[ 13 ]}

GIMIAS es una de las herramientas utilizadas en el Humano Fisiológico Virtual . ^{[ 14 ]}

• AngioLab es una herramienta de software desarrollada dentro del marco GIMIAS y forma parte de un proyecto más ambicioso para el manejo integrado de aneurismas cerebrales. Actualmente, AngioLab incluye cuatro complementos: segmentación angiográfica, colocación virtual de stents mediante angiomorfología y angiografía virtual. En diciembre de 2009, 23 clínicos completaron un cuestionario de evaluación sobre AngioLab. Esta actividad formó parte de un curso de formación impartido durante el 2.º Curso de Formación de la Sociedad Europea para el Tratamiento Neurovascular Mínimamente Invasivo (ESMINT), celebrado en la Universitat Pompeu Fabra de Barcelona, ​​España. Se evaluaron el Análisis Morfológico Automatizado (complemento de angiomorfología) y la Planificación del Tratamiento Endovascular (complemento de colocación de stents). En general, los resultados proporcionados por estas herramientas se consideraron relevantes y una necesidad emergente en su ámbito clínico. ^{[ 15 ] [ 16 ]}
• CardioLab : El paquete CardioLab para GIMIAS permite realizar un flujo de trabajo completo, desde imágenes médicas hasta la caracterización y cuantificación de enfermedades miocárdicas y la planificación de la terapia de resincronización cardíaca (TRC) . ^{[ 17 ]}
• FocusDET : La localización precisa de los focos epileptogénicos en la epilepsia parcial refractaria es esencial para evaluar la posibilidad de cirugía como tratamiento. Se desarrolló un paquete de software específico para localizar el foco epileptogénico utilizando imágenes SPECT ictales e interictales y resonancia magnética, empleando la metodología SISCOM. FocusDET se desarrolló utilizando las instalaciones de GIMIAS. ^{[ 18 ]}
• QuantiDopa es un software que permite realizar una cuantificación semiautomática de la captación estriatal en estudios SPECT de neurotransmisión del sistema dopaminérgico. ^{[ 19 ]}

• SourceForge.net (linux debian)
• MITK