Gene Wiki

La Wiki de Genes es un proyecto dentro de Wikipedia que tiene como objetivo describir las relaciones y funciones de todos los genes humanos . Fue creada para transferir información de recursos científicos a los artículos incompletos de Wikipedia. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

El proyecto Gene Wiki también inició la publicación de artículos de revisión específicos de genes en la revista Gene , junto con la edición de las páginas específicas de genes en Wikipedia. ^{[ 4 ]}

El proyecto Gene Wiki, en colaboración con la revista Gene, se dio por terminado en mayo de 2022, diez años después de su inicio. Un informe de los responsables del proyecto resume sus logros. ^{[ 5 ]}

Objetivos y alcance del proyecto

Número de artículos sobre genes

El genoma humano contiene aproximadamente entre 20 000 y 25 000 genes codificadores de proteínas . ^{[ 6 ]} El objetivo del proyecto Gene Wiki es crear artículos semilla para cada gen humano relevante , es decir, cada gen cuya función ha sido asignada en la literatura científica revisada por pares . Aproximadamente la mitad de los genes humanos tienen una función asignada, por lo que se espera que el número total de artículos semilla del proyecto Gene Wiki esté en el rango de 10 000 a 15 000. Hasta la fecha, se han creado o ampliado aproximadamente 11 000 artículos para incluir contenido del proyecto Gene Wiki.

Expansión

Una vez establecidos los artículos semilla, se espera que estos sean anotados y ampliados por editores con experiencia que abarca desde el público general hasta estudiantes, profesionales y académicos. ^{[ 1 ]}

Proteínas codificadas por genes

En el genoma humano , solo una pequeña porción codifica proteínas . Para comprender la función de un gen que codifica una proteína, generalmente se requiere comprender la función de la proteína correspondiente. Por lo tanto, además de incluir información básica sobre el gen, el proyecto también incluye información sobre la proteína que codifica. Se cree que otras porciones del genoma, el ADN no codificante (anteriormente llamado ADN basura por no tener una función aparente), desempeñan funciones reguladoras.

Contenido generado por Gene Wiki

Los fragmentos de código para el proyecto Gene Wiki son creados por un bot y contienen enlaces a las siguientes bases de datos primarias de genes/proteínas:

Comité de Nomenclatura de Genes HUGO – nombre oficial del gen
Entrez – Base de datos genética
OMIM (Herencia Mendeliana en el Hombre): base de datos que cataloga todas las enfermedades conocidas con un componente genético.
Amigo – Ontología genética
HomoloGéneros : homólogos de genes en otras especies
SymAtlasRNA – patrón de expresión génica en tejidos ^{[ 7 ]}
Banco de datos de proteínas : estructura 3D de la proteína codificada por el gen
UniProt ( recurso universal de proteínas ): un repositorio central de datos de proteínas .

Respuesta

Un informe reveló que entre 2013 y 2017, el contenido que Gene Wiki aportó a Wikipedia se desarrolló mediante colaboración colectiva a lo largo del tiempo. ^{[ 8 ]}

Referencias

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Lecturas adicionales

Good BM, Howe DG, Lin SM, Kibbe WA, Su AI (2011). " Extracción de conocimiento genómico funcional de Gene Wiki" . BMC Genomics . 12 : 603. doi : 10.1186/1471-2164-12-603 . PMC 3271090. PMID 22165947 .
Good BM, Clarke EL, de Alfaro L, Su AI (enero de 2012). "The Gene Wiki en 2011: inteligencia comunitaria aplicada a la anotación de genes humanos" . Nucleic Acids Research . 40 (número especial de bases de datos): D1255–61. doi : 10.1093/nar/gkr925 . PMC 3245148. PMID 22075991 .
Good BM, Clarke EL, Loguercio S, Su AI (2012). "Vinculando genes con enfermedades con una combinación de SNPedia y Gene Wiki" . J Biomed Semantics . 3 (Supl. 1): S6. doi : 10.1186/2041-1480-3-S1-S6 . PMC 3337266. PMID 22541597 .
Su AI, Good BM, van Wijnen AJ (diciembre de 2013). "Gene Wiki Reviews: combinando la colaboración colectiva con la revisión por pares tradicional". Gene . 531 (2): 125. doi : 10.1016/j.gene.2013.08.093 . PMID 24012870 .

Enlaces externos

Spagat E (2008-07-09). "Edita tu ADN: 'Gene wiki' debutará en Wikipedia" . The Associated Press (en ABC News ). Recuperado el 29 de septiembre de 2011 .
McKenney AS (8 de julio de 2008). "Archivado de información sobre el genoma humano mediante Wikipedia" . Noticias de TI/Internet/Correo electrónico . Medical News Today . Consultado el 19 de julio de 2008 .
Tay L (10 de julio de 2008). "Wikipedia alberga un repositorio de genes humanos" . iTnews Australia . Haymarket Media. Archivado del original el 13 de julio de 2008. Recuperado el 19 de julio de 2008 .
Mitch Waldrop (3 de septiembre de 2008). "Big data: Wikiomics" . Nature . 455 (7209): 22–25 . doi : 10.1038/455022a . PMID 18769412 .

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