Selección genómica

La selección genómica (SG) predice los valores genéticos de la descendencia en una población asociando sus rasgos (p. ej., resistencia a plagas) con sus puntuaciones de marcadores genéticos de alta densidad. ^{[ 1 ]} La SG es un método propuesto para abordar las deficiencias de la selección asistida por marcadores (SAM) en los programas de mejoramiento genético. Sin embargo, la SG es una forma de SAM que se diferencia de ella al estimar, simultáneamente, todos los marcadores genéticos, haplotipos o efectos de marcadores a lo largo de todo el genoma para calcular los valores de los valores genéticos estimados genómicos (VGE). ^{[ 1 ]} El potencial de la SG radica en explicar la diversidad genética de un programa de mejoramiento genético mediante una alta cobertura de marcadores genómicos y evaluar los efectos de dichos marcadores para predecir los valores genéticos. ^{[ 2 ]}

A diferencia de MAS y su enfoque en unos pocos marcadores significativos, GS examina conjuntamente todos los marcadores de una población. Desde la propuesta inicial de GS ^{[ 1 ]} para su aplicación en poblaciones de cría, ha surgido como una solución a las deficiencias de MAS. ^{[ 2 ]}

El MAS ha presentado dos limitaciones principales en las aplicaciones de mejoramiento. Primero, las poblaciones de mapeo biparentales se utilizan para la mayoría de los análisis de QTL , lo que limita su precisión. ^{[ 3 ] [ 4 ]} Esto representa un problema porque una sola población biparental no puede representar la diversidad alélica y los efectos del fondo genético en una población de mejoramiento.

Además, los rasgos poligénicos (o rasgos complejos) controlados por varios marcadores de efectos pequeños han supuesto un gran problema para la selección asistida por marcadores (MAS). Los métodos estadísticos aplicados para identificar marcadores objetivo e implementar la MAS para la mejora de rasgos poligénicos no han tenido éxito. ^{[ 2 ]}