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Histona H2A.Z

La histona H2A.Z es una proteína codificada por el gen H2AZ1 en humanos. [ 5 ] [ 6 ] Función Las histonas son proteínas nucleares básicas responsables de la estructura del nucle...

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La histona H2A.Z es una proteína codificada por el gen H2AZ1 en humanos. [ 5 ] [ 6 ]

Función

Las histonas son proteínas nucleares básicas responsables de la estructura del nucleosoma en la fibra cromosómica de los eucariotas . Los nucleosomas constan de aproximadamente 146 pares de bases (pb) de ADN enrollados alrededor de un octámero de histonas , que incluye pares de cada una de las cuatro histonas centrales ( H2A , H2B , H3 y H4 ). La fibra de cromatina se compacta aún más mediante la interacción de una histona de enlace, H1, con el ADN entre los nucleosomas para formar estructuras de cromatina de orden superior. El gen H2AFZ codifica un miembro de la familia de histonas H2A independiente de la replicación, que se distingue de otros miembros de la familia.

Importancia biológica

Estudios realizados en ratones han demostrado que esta histona en particular es necesaria para el desarrollo embrionario e indican que la falta de histona H2A funcional conduce a la letalidad embrionaria. [ 6 ]

La histona H2AZ es una variante de la histona H2A y se utiliza para mediar la respuesta termosensorial, siendo esencial para percibir la temperatura ambiente. La ocupación de nucleosomas por H2A.Z disminuye con la temperatura, y los ensayos in vitro muestran que los nucleosomas que contienen H2A.Z envuelven el ADN de forma más ajustada que los nucleosomas H2A canónicos en Arabidopsis (Cell 140: 136–147, 2010). Sin embargo, algunos otros estudios (Nat. Genet. 41, 941–945 y Genes Dev., 21, 1519–1529) han demostrado que la incorporación de H2A.Z en los nucleosomas, cuando coexiste con H3.3, los debilita.

Expresión génica y estructura de la cromatina

Se ha demostrado que el posicionamiento de los nucleosomas que contienen H2A.Z alrededor de los sitios de inicio de la transcripción afecta la expresión génica posterior. [ 7 ] Evidencia reciente también apunta a un papel de H2A.Z en la represión de un subconjunto de ncRNAs , la desrepresión de CUTs , así como en la mediación de la formación de estructuras de cromatina de orden superior. [ 8 ]

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000164032 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000037894 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. ↑ Hatch CL, Bonner WM (octubre de 1990). "El gen de la histona humana H2A.Z. Secuencia y regulación" . J Biol Chem . 265 (25): 15211–8 . doi : 10.1016/S0021-9258(18)77243-8 . PMID 1697587 . 
  6. 1 2 "Gen Entrez: H2AFZ Familia de histonas H2A, miembro Z" .
  7. ↑ Bargaje R., Alam P., Patowary A., Sarkar M., Ali T., Gupta S., Garg M., Singh M., Purkanti R., Scaria V., Sivasubbu S., Brahmachari V., Pillai B. (2012) La proximidad del nucleosoma que contiene H2A.Z al sitio de inicio de la transcripción influye en los niveles de expresión génica en el hígado y el cerebro de los mamíferos. Nucleic Acids Research (Epub antes de la impresión) Bargaje R, Alam MP, Patowary A, et al. (octubre de 2012). "La proximidad del nucleosoma que contiene H2A.Z al sitio de inicio de la transcripción influye en los niveles de expresión génica en el hígado y el cerebro de los mamíferos" . Nucleic Acids Research . 40 (18): 8965–78 . doi : 10.1093/nar/gks665 . PMC 3467062 . PMID 22821566 .   
  8. ↑ Rege M (2015). " La dinámica de la cromatina y la función del exosoma de ARN actúan en conjunto para regular la homeostasis transcripcional" . Cell Reports . 13 (8): 1610– 1622. doi : 10.1016/j.celrep.2015.10.030 . PMC 4662874. PMID 26586442 .  

Lecturas adicionales

  • Jason LJ, Moore SC, Lewis JD, et  al. (2002). "Ubiquitinación de histonas: ¿se despliega una cola de etiquetado?". BioEssays . 24 ( 2): 166– 74. doi : 10.1002/bies.10038 . PMID 11835281. S2CID 39905043 .  
  • Hatch CL, Bonner WM (1988). "Secuencia de ADNc para H2A.Z de mamíferos, una especie de isoproteína de histona H2A basal divergente evolutivamente pero altamente conservada" . Nucleic Acids Res . 16 (3): 1113–24 . doi : 10.1093/nar/16.3.1113 . PMC 334740. PMID 3344202 .  
  • Kato S, Sekine S, Oh SW, et  al. (1995). "Construcción de un banco de cDNA humano de longitud completa". Gene . 150 (2): 243– 50. doi : 10.1016/0378-1119(94)90433-2 . ​​PMID 7821789 . 
  • Hatch CL, Bonner WM (1995). "Caracterización del promotor proximal del gen de la histona humana H2A.Z" . DNA Cell Biol. (Manuscrito enviado). 14 (3): 257– 66. doi : 10.1089/dna.1995.14.257 . PMID 7880446 . 
  • Popescu N, Zimonjic D, Hatch C, Bonner W (1994). "Mapeo cromosómico del gen de la histona humana H2AZ en 4q24 mediante hibridación in situ con fluorescencia" . Genomics (Manuscrito enviado). 20 (2): 333– 5. doi : 10.1006/geno.1994.1182 . PMID 8020992 . 
  • Hatch CL, Bonner WM (1996). "Una región corriente arriba del promotor del gen H2AZ modula la actividad del promotor en diferentes tipos celulares". Biochim. Biophys. Acta . 1305 ( 1–2 ): 59–62 . doi : 10.1016/0167-4781(95)00223-5 . PMID 8605251 . 
  • El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). "Activación transcripcional del promotor del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 asociado a la cromatina integrada" . Mol . Cell. Biol . 18 (5): 2535– 44. doi : 10.1128/mcb.18.5.2535 . PMC 110633. PMID 9566873 .  
  • Slachta CA, Jeevanandam V, Goldman B, et  al. (2000). "Las arterias coronarias de aloinjertos cardíacos humanos con rechazo crónico contienen células T oligoclonales: persistencia de transcritos TCR expandidos clonalmente idénticos desde el período postrasplante temprano (biopsias endomiocárdicas) hasta el rechazo crónico (arterias coronarias)" . J. Immunol . 165 (6): 3469–83 . doi : 10.4049/jimmunol.165.6.3469 . PMID 10975868 . 
  • Pasqualucci L, Neri A, Baldini L, et  al. (2000). "Las mutaciones de BCL-6 están asociadas con mutaciones de la cadena pesada variable de inmunoglobulina en la leucemia linfocítica crónica de células B". Cancer Res . 60 (20): 5644–8 . PMID 11059755 . 
  • Deng L, de la Fuente C, Fu P, et  al. (2001). "La acetilación de la proteína Tat del VIH-1 por CBP/P300 aumenta la transcripción del genoma integrado del VIH-1 y mejora la unión a las histonas centrales" . Virology . 277 (2): 278– 95. doi : 10.1006/viro.2000.0593 . PMID 11080476 . 
  • Suto RK, Clarkson MJ, Tremethick DJ, Luger K (2001). "Estructura cristalina de una partícula central de nucleosoma que contiene la variante de histona H2A.Z". Nat. Struct. Biol . 7 (12): 1121– 4. doi : 10.1038/81971 . PMID 11101893 . S2CID 5966635 .  
  • Bräuninger A, Yang W, Wacker HH, et  al. (2001). "Desarrollo de células B en centros germinales transformados progresivamente: similitudes y diferencias en comparación con los centros germinales clásicos y la enfermedad de Hodgkin con predominio linfocítico" . Blood . 97 (3): 714–9 . doi : 10.1182/blood.V97.3.714 . PMID 11157489 . 
  • Yamamoto K, Sugita N, Kobayashi T, et  al. (2001). "Evidencia de un nuevo polimorfismo que afecta tanto la glicosilación N-ligada como la unión del ligando del receptor IgG IIIB (CD16)" . Tissue Antigens . 57 (4): 363– 6. doi : 10.1034/j.1399-0039.2001.057004363.x . PMID 11380948 . 
  • Faast R, Thonglairoam V, Schulz TC, et  al. (2001). "La variante de histona H2A.Z es necesaria para el desarrollo temprano de los mamíferos" . Curr. Biol . 11 (15): 1183– 7. Bibcode : 2001CBio...11.1183F . doi : 10.1016/S0960-9822(01)00329-3 . PMID 11516949 . 
  • Deng L, Wang D, de la Fuente C, et  al. (2001). "Mejora de la actividad p300 HAT por VIH-1 Tat en el ADN de la cromatina" . Virología . 289 (2): 312– 26. doi : 10.1006/viro.2001.1129 . PMID 11689053 . 
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et  al. (2003). "Generación y análisis inicial de más de 15.000 secuencias de ADNc humanas y de ratón de longitud completa" . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .  
  • Rangasamy D, Berven L, Ridgway P, Tremethick DJ (2003). "La heterocromatina pericéntrica se enriquece con H2A.Z durante el desarrollo temprano de los mamíferos" . EMBO J. 22 ( 7): 1599– 607. doi : 10.1093/emboj/cdg160 . PMC 152904. PMID 12660166 .  
  • Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). "Regulación de la expresión génica del VIH-1 mediante acetilación de histonas y reclutamiento de factores en el promotor LTR" . EMBO J. 22 ( 24): 6550– 61. doi : 10.1093/emboj/cdg631 . PMC 291826. PMID 14657027 .  
  • PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información estructural disponible en el PDB para la histona humana H2A.Z.