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H2AFY

La macrohistona central H2A.1 es una proteína que en los humanos está codificada por el gen H2AFY . [5] [6] [7] Función Las histonas son proteínas nucleares básicas que son resp...

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La macrohistona central H2A.1 es una proteína que en los humanos está codificada por el gen H2AFY . [5] [6] [7]

Función

Las histonas son proteínas nucleares básicas que son responsables de la estructura del nucleosoma de la fibra cromosómica en eucariotas . Los nucleosomas consisten en aproximadamente 146 pb de ADN envuelto alrededor de un octámero de histonas compuesto por pares de cada una de las cuatro histonas centrales (H2A, H2B, H3 y H4). La fibra de cromatina se compacta aún más a través de la interacción de una histona de enlace, H1 , con el ADN entre los nucleosomas para formar estructuras de cromatina de orden superior. Este gen codifica un miembro de la familia de histonas H2A. Reemplaza a las histonas H2A convencionales en un subconjunto de nucleosomas donde reprime la transcripción y participa en la inactivación estable del cromosoma X. El empalme alternativo da como resultado múltiples variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas. [ 7] La ​​expresión de estas isoformas está asociada a varios cánceres, como el carcinoma hepatocelular. [8]

Referencias

  1. ^ abc GRCh38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSG00000113648 – Ensembl , mayo de 2017
  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000015937 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ Mao M, Fu G, Wu JS, Zhang QH, Zhou J, Kan LX, Huang QH, He KL, Gu BW, Han ZG, Shen Y, Gu J, Yu YP, Xu SH, Wang YX, Chen SJ, Chen Z (julio de 1998). "Identificación de genes expresados ​​en células madre/progenitoras hematopoyéticas CD34(+) humanas mediante etiquetas de secuencia expresadas y clonación eficiente de ADNc de longitud completa". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 95 (14): 8175–80. Bibcode :1998PNAS...95.8175M. doi : 10.1073/pnas.95.14.8175 . PMC 20949 . PMID  9653160. 
  6. ^ Lee Y, Hong M, Kim JW, Hong YM, Choe YK, Chang SY, Lee KS, Choe IS (julio de 1998). "Aislamiento de clones de ADNc que codifican subtipos de la histona humana macroH2A1". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Estructura y expresión génica . 1399 (1): 73–7. doi :10.1016/s0167-4781(98)00098-0. PMID  9714746.
  7. ^ ab "Entrez Gene: familia de histonas H2AFY H2A, miembro Y".
  8. ^ Rappa F, Greco A, Podrini C, Cappello F, Foti M, Bourgoin L, Peyrou M, Marino A, Scibetta N, Williams R, Mazzoccoli G, Federici M, Pazienza V, Vinciguerra M (2013). "La inmunopositividad para las isoformas de histona macroH2A1 marca el carcinoma hepatocelular asociado a esteatosis". MÁS UNO . 8 (1): e54458. Código Bib : 2013PLoSO...854458R. doi : 10.1371/journal.pone.0054458 . PMC 3553099 . PMID  23372727. 

Lectura adicional

  • El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (mayo de 1998). "Activación transcripcional del promotor integrado del virus de inmunodeficiencia humana asociado a la cromatina tipo 1". Biología molecular y celular . 18 (5): 2535–44. doi :10.1128/mcb.18.5.2535. PMC  110633 . PMID  9566873.
  • Costanzi C, Pehrson JR (junio de 1998). "La histona macroH2A1 se concentra en el cromosoma X inactivo de los mamíferos hembra". Nature . 393 (6685): 599–601. Bibcode :1998Natur.393..599C. doi :10.1038/31275. PMID  9634239. S2CID  205001095.
  • Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J, Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (octubre de 2000). "Clonación y análisis funcional de ADNc con marcos de lectura abiertos para 300 genes previamente indefinidos expresados ​​en células madre/progenitoras hematopoyéticas CD34+". Genome Research . 10 (10): 1546–60. doi :10.1101/gr.140200. PMC  310934 . PMID  11042152.
  • Deng L, de la Fuente C, Fu P, Wang L, Donnelly R, Wade JD, Lambert P, Li H, Lee CG, Kashanchi F (noviembre de 2000). "La acetilación de Tat del VIH-1 por CBP/P300 aumenta la transcripción del genoma integrado del VIH-1 y mejora la unión a las histonas centrales". Virology . 277 (2): 278–95. doi : 10.1006/viro.2000.0593 . PMID  11080476.
  • Chadwick BP, Willard HF (mayo de 2001). "Variantes de la histona H2A y el cromosoma X inactivo: identificación de una segunda variante de macroH2A". Human Molecular Genetics . 10 (10): 1101–13. doi : 10.1093/hmg/10.10.1101 . PMID  11331621.
  • Deng L, Wang D, de la Fuente C, Wang L, Li H, Lee CG, Donnelly R, Wade JD, Lambert P, Kashanchi F (octubre de 2001). "Mejora de la actividad de p300 HAT por VIH-1 Tat en el ADN de la cromatina". Virología . 289 (2): 312–26. doi : 10.1006/viro.2001.1129 . PMID  11689053.
  • Chadwick BP, Willard HF (junio de 2002). "Localización dependiente del ciclo celular de macroH2A en la cromatina del cromosoma X inactivo". The Journal of Cell Biology . 157 (7): 1113–23. doi :10.1083/jcb.200112074. PMC  2173542 . PMID  12082075.
  • Takahashi I, Kameoka Y, Hashimoto K (agosto de 2002). "MacroH2A1.2 se une a la proteína nuclear Spop". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Investigación de células moleculares . 1591 (1–3): 63–8. doi :10.1016/S0167-4889(02)00249-5. PMID  12183056.
  • Ganesan S, Silver DP, Greenberg RA, Avni D, Drapkin R, Miron A, Mok SC, Randrianarison V, Brodie S, Salstrom J, Rasmussen TP, Klimke A, Marrese C, Marahrens Y, Deng CX, Feunteun J, Livingston DM (noviembre de 2002). "BRCA1 apoya la concentración de ARN XIST en el cromosoma X inactivo". Cell . 111 (3): 393–405. doi : 10.1016/S0092-8674(02)01052-8 . PMID  12419249. S2CID  372211.
  • Angelov D, Molla A, Perche PY, Hans F, Côté J, Khochbin S, Bouvet P, Dimitrov S (abril de 2003). "La variante de histona macroH2A interfiere con la unión del factor de transcripción y la remodelación del nucleosoma SWI/SNF". Molecular Cell . 11 (4): 1033–41. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00100-X . PMID  12718888.
  • Behrends U, Schneider I, Rössler S, Frauenknecht H, Golbeck A, Lechner B, Eigenstetter G, Zobywalski C, Müller-Weihrich S, Graubner U, Schmid I, Sackerer D, Späth M, Goetz C, Prantl F, Asmuss HP, Bise K, Mautner J (agosto de 2003). "Nuevos antígenos tumorales identificados mediante detección de anticuerpos autólogos de bibliotecas de ADNc de meduloblastoma infantil". Revista Internacional de Cáncer . 106 (2): 244–51. doi : 10.1002/ijc.11208 . PMID  12800201. S2CID  36836051.
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  • Zhang R, Poustovoitov MV, Ye X, Santos HA, Chen W, Daganzo SM, Erzberger JP, Serebriiskii IG, Canutescu AA, Dunbrack RL, Pehrson JR, Berger JM, Kaufman PD, Adams PD (enero de 2005). "Formación de focos de heterocromatina asociados a la senescencia que contienen MacroH2A y senescencia impulsada por ASF1a e HIRA". Developmental Cell . 8 (1): 19–30. doi : 10.1016/j.devcel.2004.10.019 . PMID  15621527.
  • Hernández-Muñoz I, Lund AH, van der Stoop P, Boutsma E, Muijrers I, Verhoeven E, Nusinow DA, Panning B, Marahrens Y, van Lohuizen M (mayo de 2005). "La inactivación estable del cromosoma X involucra el complejo PRC1 Polycomb y requiere la histona MACROH2A1 y la ligasa de ubiquitina E3 CULLIN3/SPOP". Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 102 (21): 7635–40. doi : 10.1073/pnas.0408918102 . PMC  1140410 . PMID  15897469.
  • Ioudinkova ES, Barat A, Pichugin A, Markova E, Sklyar I, Pirozhkova I, Robin C, Lipinski M, Ogryzko V, Vassetzky YS, Razin SV (2012). "Distribución distinta de las variantes de histonas expresadas ectópicamente H2A.Bbd y MacroH2A en dominios de cromatina abiertos y cerrados". PLOS ONE . ​​7 (10): e47157. Bibcode :2012PLoSO...747157I. doi : 10.1371/journal.pone.0047157 . PMC  3484066 . PMID  23118866.
  • PDBe-KB proporciona una descripción general de toda la información de estructura disponible en el PDB para la macrohistona Human Core H2A.1



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