En biología molecular, la hemadina es un péptido anticoagulante sintetizado por la sanguijuela india , Haemadipsa sylvestris . Adopta una estructura secundaria que consta de cinco cortas hebras beta (beta1-beta5), dispuestas en dos láminas antiparalelas distorsionadas formadas por las hebras beta1-beta4-beta5 y beta2-beta3 enfrentadas. Este sándwich beta se estabiliza mediante seis cisteínas encerradas dispuestas en un apareamiento de disulfuro [1-2, 3-5, 4-6], lo que da como resultado un núcleo hidrofóbico rico en disulfuros que es en gran medida inaccesible al disolvente . La proximidad de los enlaces disulfuro [3-5] y [4-6] organiza la hemadina en cuatro bucles distintos . El segmento N-terminal de este dominio se une al sitio activo de la trombina , inhibiéndola. [ 1 ]
La hemadina (MEROPS I14.002) pertenece a una superfamilia (MEROPS IM) de inhibidores de proteasas que también incluye la hirudina (MEROPS I14.001) y la antistasina (MEROPS I15). [ 2 ] [ 3 ]
Referencias
- ↑ Richardson JL, Kroger B, Hoeffken W, Sadler JE , Pereira P, Huber R, Bode W, Fuentes-Prior P (noviembre de 2000). "Estructura cristalina del complejo alfa-trombina-hemadina humano: un inhibidor de la unión al exositio II" . EMBO J. 19 ( 21): 5650–60 . doi : 10.1093/emboj/19.21.5650 . PMC 305786. PMID 11060016 .
- ↑ "InterPro" . www.ebi.ac.uk .
- ↑ "Clan IM" . MEROPS - la base de datos de peptidasas .
- dominios de proteínas