Hafniaceae

Las Hafniaceae son una familia de bacterias Gram negativas . Esta familia pertenece al orden Enterobacterales, en la clase Gammaproteobacteria del filo Pseudomonadota . Los géneros de esta familia incluyen el género tipo Hafnia , junto con Edwardsiella y Obesumbacterium . ^{[ 1 ]}

El nombre Hafniaceae deriva del término latino Hafnia , que hace referencia al género tipo de la familia, y del sufijo "-aceae", una terminación utilizada para designar una familia. En conjunto, Hafniaceae se refiere a una familia cuyo tipo nomenclatural es el género Hafnia . ^{[ 1 ]}

Los miembros son catalasa-positivos, oxidasa-negativos y negativos para la lisina descarboxilasa. Estas bacterias también pueden crecer en medios MacConkey y son capaces de reducir el nitrato. ^{[ 1 ]}

Se identificaron cuatro indels característicos conservados (CSI) para esta familia en las proteínas GIrR (regulador de respuesta del sistema de dos componentes), GIrR ( glucosa-1-fosfato adenililtransferasa) , NhaR (activador transcripcional ) y la histidina quinasa /regulador de respuesta (sensor híbrido). ^{[ 1 ]} Estas firmas moleculares se identificaron mediante análisis genómicos y constituyen un método molecular fiable para distinguir a los miembros de esta familia de otras familias dentro del orden Enterobacterales y de todas las demás bacterias.

Hafniaceae , a fecha de 2021, contiene tres géneros válidamente publicados. ^{[ 2 ]} Los miembros de esta familia pertenecían originalmente a la familia Enterobacteriaceae , un gran grupo de especies filogenéticamente no relacionadas con características bioquímicas distintas y diferentes nichos ecológicos. La asignación original de especies a la familia Enterobacteriaceae se basó principalmente en análisis de secuencias del genoma del ARNr 16S, que se sabe que tienen un bajo poder discriminatorio y cuyos resultados varían según el algoritmo y la información del organismo utilizada. A pesar de ello, los análisis aún mostraron ramificación polifilética, lo que indica la presencia de subgrupos distintos dentro de la familia. ^{[ 3 ]}

En 2016, Adeolu et al. propusieron la división de Enterobacteriaceae en 7 nuevas familias basándose en análisis genómicos comparativos y el patrón de ramificación de varios árboles filogenéticos construidos a partir de secuencias genómicas conservadas, secuencias de ARNr 16S y análisis de secuencias multilocus. También se identificaron marcadores moleculares, específicamente indels característicos conservados , específicos de esta familia, como evidencia que respalda la división independientemente de los árboles filogenéticos. ^{[ 1 ]}