Haloferax (abreviatura común: Hfx. ) es un género de halobacterias del orden Haloferacaceae . [ 2 ]
Intercambio genético
Las células de H. mediterranei y las células de la especie relacionada H. volcanii pueden experimentar un proceso de intercambio genético entre dos células que implica la fusión celular, dando como resultado una célula heterodiploide (que contiene dos cromosomas diferentes en una misma célula). [ 3 ] Si bien este intercambio genético ocurre normalmente entre dos células de la misma especie, también puede ocurrir con menor frecuencia entre una célula de H. mediterranei y una de H. volcanii . Estas dos especies tienen una identidad promedio de secuencia de nucleótidos del 86,6 %. [ 3 ] Durante este proceso de intercambio, se forma una célula diploide que contiene el repertorio genético completo de ambas células parentales, y se facilita la recombinación genética. Posteriormente, las células se separan, dando lugar a células recombinantes.
Taxonomía
A partir de 2022, 13 especies están válidamente publicadas bajo el género Haloferax . [ 1 ]
- Especies propuestas
Se han propuesto varias especies y nuevos nombres binomiales, pero no se han publicado válidamente.
- " Haloferax antrum " Enache et al. 2006 , [ 4 ] " Haloferax opilio " Enache et al. 2006 , " Haloferax rutilus " Enache et al. 2006 y " Haloferax viridis " Enache et al. 2006 fueron aisladas de lagos salados rumanos y propuestas por primera vez como nuevas especies en 2006. [ 5 ] Solo H. prahovense , que fue propuesta junto con ellas, ha sido publicada válidamente desde entonces.
- " Haloferax berberensis " Kharroub et al. 2005e fue aislada en Argelia y propuesta como nueva especie en 2005. [ 6 ]
- Haloferax litoreum , Haloferax marinisediminis y Haloferax marinum se publicaron por primera vez en 2021, pero no se aceptan a partir de 2022. [ 7 ]
- Haloferax marisrubri y Haloferax profundi se publicaron por primera vez en 2020, pero no se aceptan a partir de 2022. [ 8 ]
- Haloferax massilisiensis o Haloferax massiliense se publicó por primera vez en 2016 y nuevamente en 2018 como una arquea halófila asociada al ser humano. A partir de 2022, esta especie no es aceptada. [ 9 ]
Filogenia
La taxonomía actualmente aceptada se basa en la Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) [ 1 ] y el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI). [ 2 ]
Haloferax no asignado :
- " H. antro " Enache et al. 2006
- " H. berberensis " Kharroub et al. 2005e
- " H. opilio " Enache et al. 2006
- " H. rutilus " Enache et al. 2006
- " H. viridis " Enache et al. 2006
Biotecnología industrial
Varias especies de Haloferax , especialmente Haloferax mediterranei, han ganado eminencia por su capacidad de servir como un chasis eficiente para la bioproducción. H. mediterranei es un productor bien conocido de polihidroxialcanoatos , un bioplástico sostenible y biodegradable. [ 16 ] Se han estudiado para la producción de varios productos de valor agregado como bioplásticos, pigmentos y exoenzimas. [ 17 ] H. mediterranei es capaz de acumular altas cantidades tanto de PHA homopolímeros como de PHA copolímeros a partir de una amplia gama de sustratos de carbono sostenibles. [ 16 ] [ 18 ] Las especies de Haloferax también se han utilizado para producir exoenzimas relevantes industrialmente como la lacasa para bioprocesamiento. [ 19 ] Dado que pueden prosperar en condiciones extremas de salinidad, toxicidad, exposición a metales pesados y radiación UV, los costos de fermentación se reducen significativamente ya que se reduce la posibilidad de contaminación. [ 17 ] En ambientes hipersalinos como el Mar Muerto y el Gran Lago Salado , las especies de Haloferax asumen la mayor parte de la responsabilidad de la desnitrificación . [ 20 ] Estas cepas podrían aprovecharse para sistemas de eliminación de nitrógeno diseñados para remediar efluentes salinos de pesquerías, industrias textiles y plantas procesadoras de alimentos.
Véase también
Referencias
- 1 2 3 J.P. Euzéby. "Haloferax" . Lista de nombres procariotas con estatus en la nomenclatura (LPSN) . Recuperado el 10 de octubre de 2023 .
- 1 2 Sayers; et al. "Haloferax" . Base de datos de taxonomía del Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI) . Recuperado el 10 de octubre de 2023 .
- 1 2 Naor A, Lapierre P, Mevarech M, Papke RT, Gophna U (agosto de 2012). "Bajas barreras de especies en arqueas halófilas y la formación de híbridos recombinantes" . Curr. Biol . 22 (15): 1444– 8. Bibcode : 2012CBio...22.1444N . doi : 10.1016/j.cub.2012.05.056 . PMID 22748314 .
- ↑ EBA - Archivo Europeo de Nucleótidos , consultado el 14 de julio de 2022
- ↑ Navegador de taxonomía del NCBI (Haloferax antrum) , consultado el 14 de julio de 2022
- ↑ Navegador de taxonomía del NCBI (Haloferax berberensis) , consultado el 14 de julio de 2022
- ↑ «LPSN - Lista de nombres procarióticos con Standing en Nomenclatura» . Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen . Consultado el 14 de julio de 2022 .
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- ↑ "El LTP" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
- ↑ "Árbol LTP_all en formato newick" . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
- ↑ "Notas de la versión LTP_10_2024" (PDF) . Consultado el 10 de diciembre de 2024 .
- ↑ "GTDB versión 10-RS226" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
- ↑ "ar53_r226.sp_label" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
- ↑ "Historial de taxones" . Base de datos de taxonomía del genoma . Consultado el 1 de mayo de 2025 .
- 1 2 Parroquin-Gonzalez, Mariana; Winterburn, James (2023-09-13). "Producción continua en biorreactor de polihidroxialcanoatos en Haloferax mediterranei" . Frontiers in Bioengineering and Biotechnology . 11 1220271. doi : 10.3389/fbioe.2023.1220271 . ISSN 2296-4185 .
- 1 2 Griffiths, Dana B.; Tiwari, Ravi P.; Murphy, Daniel V.; Scott, Colin (noviembre de 2025). "Haloferax y Haloferacaceae: papel potencial en la bioindustria". Biotechnology Advances . 84 108666. doi : 10.1016/j.biotechadv.2025.108666 . ISSN 1873-1899 . PMID 40744239 .
- ↑ Wang, Ke; Zhang, Ruihong (2021-02-28). "Producción de polihidroxialcanoatos (PHA) por Haloferax mediterranei a partir de nutrientes derivados de residuos alimentarios para aplicaciones de plásticos biodegradables" . Journal of Microbiology and Biotechnology . 31 (2): 338– 347. doi : 10.4014/jmb.2008.08057 . ISSN 1738-8872 . PMC 9706037. PMID 33203825 .
- ↑ Kasirajan, Lakshmi; Adams, Zachary; Couto-Rodriguez, Ricardo L.; Gal, Daniel; Jia, Huiyong; Mondragon, Paula; Wassel, Paul C.; Yu, David; Uthandi, Sivakumar; Maupin-Furlow, Julie A. (2021). "Síntesis y secreción de alto nivel de lacasa, un biocatalizador metaloenzimático, por la arquea halófila Haloferax volcanii". Expresión de proteínas recombinantes: huéspedes procariotas y sistemas libres de células . Métodos en enzimología. Vol. 659. págs. 297–313 . doi : 10.1016/bs.mie.2021.05.012 . ISBN 978-0-323-90146-8ISSN 1557-7988 . PMC 8867731. PMID 34752290 .
- ↑ Torregrosa-Crespo, Javier; Pire, Carmen; Martínez-Espinosa, Rosa María; Bergaust, Linda (2019). "Las haloarqueas desnitrificantes del género Haloferax muestran fenotipos respiratorios divergentes, con implicaciones para la liberación de gases nitrogenados" . Microbiología Ambiental . 21 (1): 427– 436. Bibcode : 2019EnvMi..21..427T . doi : 10.1111/1462-2920.14474 . ISSN 1462-2920 .
Lecturas adicionales
- Oren A, Ventosa A (2000). "Subcomité del Comité Internacional de Bacteriología Sistemática sobre la taxonomía de Halobacteriaceae. Actas de las reuniones, 16 de agosto de 1999, Sídney, Australia" . Int. J. Syst. Evol. Microbiol . 50 (3): 1405–1407 . doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID 10843089 .
- Torreblanca M, Rodriquez-Valera F, Juez G, Ventosa A, Kamekura M, Kates M (1986). "Clasificación de halobacterias no alcalífilas basada en taxonomía numérica y composición de lípidos polares, y descripción de Haloarcula gen. nov. y Haloferax gen. nov." Syst. Appl. Microbiol . 8 ( 1– 2): 89– 99. Bibcode : 1986SyApM...8...89T . doi : 10.1016/s0723-2020(86)80155-2 .
- Gibbons, NE (1974). "Familia V. Halobacteriaceae fam. nov." En RE Buchanan; NE Gibbons (eds.). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (8.ª ed.). Baltimore: The Williams & Wilkins Co. ISBN 0-683-01117-0.
Enlaces externos
- Haloferax en Bac Dive : la base de datos de metadatos de diversidad bacteriana
- géneros de arqueas
- Taxones descritos en 1986
- Haloarqueas