Articulo de referencia

Hanah Margalit

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Hanah Margalit ( en hebreo : חנה מרגלית ) es profesora en la facultad de medicina de la Universidad Hebrea de Jerusalén . [ 4 ] [ 5 ] Su investigación combina bioinformática , biología computacional y biología de sistemas , específicamente en los campos de la regulación genética en bacterias y eucariotas . [ 3 ]

Educación

Margalit obtuvo su licenciatura (en matemáticas y biología, 1974) y su maestría (en genética, con honores, 1977) de la Universidad Hebrea de Jerusalén. [ 4 ] En 1985, completó su doctorado en biología molecular computacional , bajo la supervisión de Norman Grover, en la Universidad Hebrea de Jerusalén.

Carrera e investigación

Margalit realizó una investigación postdoctoral en los Institutos Nacionales de Salud (NIH) en el laboratorio de biología matemática bajo la supervisión de Charles DeLisi , donde desarrolló el primer algoritmo computacional para predecir péptidos antigénicos reconocidos por las células inmunitarias. [ 6 ] En 1989, regresó a Israel y estableció su grupo de investigación independiente en la Facultad de Medicina de la Universidad Hebrea de Jerusalén.

Sus primeras investigaciones incluyeron el desarrollo de algoritmos computacionales para predecir la unión de péptidos antigénicos a moléculas MHC , [ 7 ] modelos computacionales de preferencias de unión proteína-ADN , [ 8 ] [ 9 ] también en colaboración con Nir Friedman , [ 10 ] identificación de pares de dominios como bloques de construcción de redes de interacción proteína-proteína , [ 11 ] análisis de la red integrada de interacciones proteína-proteína y proteína-ADN [ 12 ] (en colaboración con Uri Alon ), así como modelos computacionales para predecir pequeñas moléculas de ARN regulador en bacterias, [ 13 ] que fueron verificadas experimentalmente en colaboración con Shoshy Altuvia y Gerhart Wagner.

Más recientemente, el laboratorio de Margalit estudió la dinámica de la regulación por ARN pequeños [ 14 ] (en colaboración con Ofer Biham ) y predijo computacionalmente que existen moléculas de microARN virales que reprimen el sistema inmunitario humano, un mecanismo que fue validado experimentalmente en colaboración con Ofer Mandelboim. [ 15 ] Desde 2012, Margalit ha combinado la investigación experimental y computacional para estudiar las interacciones entre ARN pequeños y sus dianas en bacterias. [ 16 ]

Margalit fue una de las investigadoras pioneras en bioinformática y biología computacional en Israel y a nivel mundial. En la Universidad Hebrea, cofundó el programa de "Ciencias de la Computación y Ciencias de la Vida" en bioinformática y biología computacional (en 1999) y el programa de posgrado en "Genómica y Bioinformática" (en 2000). En 2002 fue elegida primera presidenta de la Sociedad Israelí de Bioinformática y Biología Computacional (2002-2004). Margalit ha sido mentora de más de 50 estudiantes de posgrado, muchos de los cuales ocupan puestos docentes en bioinformática en Israel y en el extranjero. [ 17 ]

Premios y distinciones

En 2008, recibió el premio Michael Landau en Biología de Sistemas. [ 18 ] En 2018, Margalit fue elegida miembro de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB) por sus destacadas contribuciones a los campos de la biología computacional y la bioinformática . [ 1 ] En 2020, la profesora Margalit recibió el premio Rothschild en Biología Computacional. [ 19 ]

Vida personal

Margalit está casada con Avi y es madre de tres hijos.

Referencias

  1. 1 2 Anon (2018). "ISCB Fellows" . iscb.org . Sociedad Internacional de Biología Computacional. Archivado del original el 15 de abril de 2015. Recuperado el 13 de marzo de 2018 .
  2. "El Premio Rothschild" . El Premio Rothschild . Consultado el 7 de marzo de 2020 .
  3. 1 2 Publicaciones de Hanah Margalit indexadas por Google Académico
  4. 1 2 "Detalles de las ponencias principales" . www.iscb.org . Consultado el 28 de noviembre de 2018 .
  5. «Laboratorio de Hanah Margalit» . margalit.huji.ac.il .
  6. Margalit, H.; Spouge, JL; Cornette, JL; Cease, KB; Delisi, C.; Berzofsky, JA (1987). "Predicción de sitios antigénicos de células T auxiliares inmunodominantes a partir de la secuencia primaria". Journal of Immunology . 138 (7): 2213– 2229. doi : 10.4049/jimmunol.138.7.2213 . ISSN 0022-1767 . PMID 2435793 .  
  7. Altuvia, Y.; Schueler, O.; Margalit, H. (1995). "Clasificación de péptidos de unión potenciales a moléculas MHC mediante un enfoque de alineación computacional". Journal of Molecular Biology . 249 (2): 244– 250. doi : 10.1006/jmbi.1995.0293 . ISSN 0022-2836 . PMID 7540211 .  
  8. Mandel-Gutfreund, Y.; Schueler, O.; Margalit, H. (1995). "Análisis exhaustivo de los enlaces de hidrógeno en los complejos proteína-ADN reguladores: en busca de principios comunes". Journal of Molecular Biology . 253 (2): 370– 382. doi : 10.1006/jmbi.1995.0559 . ISSN 0022-2836 . PMID 7563096 .  
  9. Mandel-Gutfreund, Y.; Margalit, H. (1998). "Parámetros cuantitativos para la interacción aminoácido-base: implicaciones para la predicción de sitios de unión proteína-ADN" . Nucleic Acids Research . 26 (10): 2306– 2312. doi : 10.1093/ nar /26.10.2306 . ISSN 0305-1048 . PMC 147552. PMID 9580679 .   
  10. Kaplan, Tommy; Friedman, Nir; Margalit, Hanah (2005). "Predicción ab initio de objetivos de factores de transcripción utilizando conocimiento estructural" . PLOS Computational Biology . 1 (1): e1. Bibcode : 2005PLSCB...1....1K . doi : 10.1371/journal.pcbi.0010001 . ISSN 1553-734X . PMC 1183507. PMID 16103898 .   
  11. Sprinzak, E.; Margalit, H. (24 de agosto de 2001). "Secuencias correlacionadas como marcadores de interacción proteína-proteína". Journal of Molecular Biology . 311 (4): 681– 692. doi : 10.1006/jmbi.2001.4920 . ISSN 0022-2836 . PMID 11518523 .  
  12. Yeger-Lotem, Esti; Sattath, Shmuel; Kashtan, Nadav; Itzkovitz, Shalev; Milo, Ron; Pinter, Ron Y.; Alon, Uri; Margalit, Hanah (2004). "Motivos de red en redes celulares integradas de regulación de la transcripción e interacción proteína-proteína" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos de América . 101 (16): 5934– 5939. Bibcode : 2004PNAS..101.5934Y . doi : 10.1073/pnas.0306752101 . ISSN 0027-8424 . PMC 395901. PMID 15079056 .   
  13. ^ Argaman, L.; Hershberg, R.; Vogel, J.; Bejerano, G.; Wagner, por ejemplo; Margalit, H.; Altuvia, S. (26 de junio de 2001). "Nuevos genes pequeños que codifican ARN en las regiones intergénicas de Escherichia coli" . Biología actual . 11 (12): 941– 950. Código bibliográfico : 2001CBio...11..941A . doi : 10.1016/s0960-9822(01)00270-6 . ISSN 0960-9822 . PMID 11448770 .  
  14. Shimoni, Yishai; Friedlander, Gilgi; Hetzroni, Guy; Niv, Gali; Altuvia, Shoshy; Biham, Ofer; Margalit, Hanah (2007). "Regulación de la expresión génica por ARN pequeños no codificantes: una visión cuantitativa" . Biología de Sistemas Moleculares . 3 138. doi : 10.1038/msb4100181 . ISSN 1744-4292 . PMC 2013925. PMID 17893699 .   
  15. Stern-Ginossar, Noam; Elefant, Naama; Zimmermann, Albert; Wolf, Dana G.; Saleh, Nivin; Biton, Moshe; Horwitz, Elad; Prokocimer, Zafnat; Prichard, Mark; Hahn, Gabriele; Goldman-Wohl, Debra; Hahn, Gabriele; Greenfield, Caryn; Yagel, Simcha; Hengel, Hartmut; Altuvia, Yael; Margalit, Hanah; Mandelboim, Ofer (2007). "Dirigiendo genes del sistema inmunitario del huésped mediante un miRNA viral" . Science . 317 (5836): 376– 381. Bibcode : 2007Sci...317..376S . doi : 10.1126/science.1140956 . ISSN 1095-9203 . PMC 4283197 . PMID 17641203 .   
  16. ^ Melamed, Sahar; Par, Asaf; Faigenbaum-Romm, Raya; Gatt, Yair E.; Reiss, Niv; Barra, Amir; Altuvia, Yael; Argamán, Lirón; Margalit, Haná (2016). "Mapeo global de pequeñas interacciones ARN-objetivo en bacterias" . Célula molecular . 63 (5): 884– 897. doi : 10.1016/j.molcel.2016.07.026 . ISSN 1097-4164 . PMC 5145812 . PMID 27588604 .   
  17. "Laboratorio de Hannah Margalit" . margalit.huji.ac.il . Consultado el 28 de noviembre de 2018 .
  18. ^ "קרן לנדאו - פרס למדעים ומחקר" (en hebreo). 2012-06-17. Archivado desde el original el 17 de junio de 2012 . Consultado el 28 de noviembre de 2018 .
  19. "El Premio Rothschild" . El Premio Rothschild . Consultado el 7 de marzo de 2020 .