Convergencia de haplotipos

La convergencia de haplotipos es la aparición no relacionada de haplotipos idénticos en poblaciones separadas, ya sea por evolución convergente o por azar.    

La convergencia de haplotipos es rara, debido a la enorme probabilidad de que dos individuos no emparentados evolucionen independientemente exactamente la misma secuencia genética en el sitio de interés. Por lo tanto, los haplotipos se comparten principalmente entre individuos muy emparentados, ya que la información genética en dos individuos emparentados será mucho más similar que entre individuos no emparentados. ^{[ 1 ]} El sesgo de sustitución aumenta aún más la probabilidad de convergencia de haplotipos, ya que esto aumenta la probabilidad de que ocurran mutaciones en el mismo sitio. ^{[ 2 ]} Las secuencias también pueden divergir de la misma secuencia original y luego revertir, convergiendo de esta manera. ^{[ 3 ]} La convergencia a través de la evolución convergente en dos grupos no emparentados es mucho menos común, ya que los rasgos derivados pueden surgir a través de vías drásticamente diferentes. ^{[ 4 ] [ 5 ]}

Determinar erróneamente que dos individuos son idénticos debido a la convergencia de haplotipos se vuelve mucho menos probable cuando se analizan más marcadores genéticos, ya que esto requeriría una mayor cantidad de coincidencias extremadamente raras. ^{[ 6 ]} Con los enfoques modernos de secuenciación de alto rendimiento, secuenciar un gran conjunto de marcadores, o incluso el genoma completo, es mucho más factible y minimiza en gran medida estos problemas. ^{[ 7 ]}

En algunas regiones, debido a la baja diversidad del gen Y-STR (que se usa frecuentemente para estudiar el origen de los apellidos), la convergencia de haplotipos puede confundir los análisis, llevando a la conclusión de que individuos no emparentados están muy emparentados. ^{[ 8 ]}

De manera similar, un estudio de haplogrupos de ADN mitocondrial del Nuevo Mundo observó que las similitudes en los haplotipos entre nativos americanos y asiáticos eran resultado de la hipervariabilidad de la región HVSI en el ADN mitocondrial, en lugar de una ascendencia común. ^{[ 2 ]}

Como ejemplo de convergencia de haplotipos debido a la evolución convergente en grupos más distantemente relacionados, el espinoso de tres espinas  en ambientes de aguas negras similares a los del antiguo killifish de aleta azul y la dorada negra desarrollaron independientemente el mismo haplotipo en el gen SWS2, que promueve una mejor visión en esas condiciones. ^{[ 9 ]}