
La heliorrodopsina es una familia de rodopsinas descubierta en 2018 por Alina Pushkarev en el laboratorio del profesor Oded Beja . [1] La nueva familia de heliorrodopsinas tiene una secuencia proteica distinta a la de las rodopsinas de tipo 1 (microbianas) y tipo 2 (animales) conocidas. Las heliorrodopsinas también presentan una orientación inversa en la membrana en comparación con las otras rodopsinas, con el extremo N hacia el interior de la célula y el extremo C hacia el exterior de la célula. [1]
Las heliorrodopsinas utilizan el retinal todo-trans como cromóforo y no tienen ninguna actividad de bombeo de iones a través de la membrana. Las heliorrodopsinas están distribuidas globalmente y existen en eucariotas , procariotas e incluso algunos virus . [1] A pesar de la amplia distribución, las heliorrodopsinas nunca están presentes en los verdaderos didermos , donde hay una doble membrana adecuada alrededor del microorganismo . Se ha sugerido que la función de la heliorrodopsina requiere una interacción directa con el medio ambiente. [2]

Las estructuras cristalinas de las heliorrodopsinas sugieren que forman un homodímero , contienen una fenestración que conduce hacia la molécula retiniana y tienen un gran bucle extracelular que mira hacia el exterior de la célula. [3] [4] [5]
Referencias
- ^ abc Pushkarev, Alina; Inoue, Keiichi; Larom, Shirley; Flores-Uribe, José; Singh, Manish; Konno, Masae; Tomida, Sahoko; Ito, Shota; Nakamura, Ryoko; Tsunoda, Satoshi P.; Philosof, Alon (junio de 2018). "Un grupo abundante y distintivo de rodopsinas microbianas descubiertas mediante metagenómica funcional". Nature . 558 (7711): 595–599. doi :10.1038/s41586-018-0225-9. ISSN 0028-0836. PMC 11128463 . PMID 29925949. S2CID 49330919.
- ^ Flores‐Uribe, José; Hevroni, Gur; Ghai, Rohit; Pushkarev, Alina; Inoue, Keiichi; Kandori, Hideki; Béjà, Oded (junio de 2019). "Las heliorrodopsinas están ausentes en las bacterias diderm (gramnegativas): algunas reflexiones y posibles implicaciones para la actividad". Informes de microbiología ambiental . 11 (3): 419–424. doi :10.1111/1758-2229.12730. ISSN 1758-2229. PMID 30618066. S2CID 58666386.
- ^ Shihoya, Wataru; Inoue, Keiichi; Singh, Manish; Konno, Masae; Hososhima, Shoko; Yamashita, Keitaro; Ikeda, Kento; Higuchi, Akimitsu; Izume, Tamaki; Okazaki, Sae; Hashimoto, Masanori (octubre de 2019). "Estructura cristalina de heliorrodopsina". Naturaleza . 574 (7776): 132-136. doi :10.1038/s41586-019-1604-6. ISSN 0028-0836. PMID 31554965. S2CID 202760270.
- ^ Kovalev, K.; Volkov, D.; Astashkin, R.; Alekseev, A.; Gushchin, I.; Haro-Moreno, JM; Rogachev, A.; Balandín, T.; Borshchevskiy, V.; Popov, A.; Bourenkov, G. (12 de septiembre de 2019). "Conocimientos estructurales de alta resolución sobre la familia de heliorrodopsina". bioRxiv : 767665. doi : 10.1101/767665 .
- ^ Lu, Yang; Zhou, X. Eduardo; Gao, Xiang; Wang, Na; Xia, Ruixue; Xu, Zhenmei; Leng, Yu; Shi, Yuying; Wang, Guangfu; Melcher, Karsten; Xu, H. Eric (enero de 2020). "Estructura cristalina de heliorrodopsina 48C12". Investigación celular . 30 (1): 88–90. doi : 10.1038/s41422-019-0266-0 . ISSN 1001-0602. PMC 6951262 . PMID 31879417.