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Red de enfermedades humanas

Una red de enfermedades humanas es una red de trastornos y enfermedades humanas que hace referencia a sus orígenes genéticos u otras características. Más específicamente, es el ...

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Una red de enfermedades humanas es una red de trastornos y enfermedades humanas que hace referencia a sus orígenes genéticos u otras características. Más específicamente, es el mapa de asociaciones de enfermedades humanas que se refiere principalmente a genes relacionados con enfermedades . Por ejemplo, en una red de enfermedades humanas, dos enfermedades están vinculadas si comparten al menos un gen asociado. Una red típica de enfermedades humanas generalmente se deriva de redes bipartitas que constan de información tanto sobre enfermedades como sobre genes. Además, algunas redes de enfermedades humanas utilizan otras características, como síntomas y proteínas, para asociar enfermedades.

Red de enfermedades humanas. Se genera como un gráfico de Plotly . [ 1 ] Los nodos son enfermedades. Dos enfermedades están conectadas si comparten un componente genético.

Historia

En 2007, Goh et al. construyeron un grafo bipartito de genes y enfermedades utilizando información de la base de datos OMIM y lo denominaron red de enfermedades humanas. [ 2 ] En 2009, Barrenas et al. derivaron una red compleja de genes y enfermedades utilizando estudios de asociación de genoma completo (GWA). [ 3 ] En el mismo año, Hidalgo et al. publicaron una nueva forma de construir redes de enfermedades fenotípicas humanas en las que las enfermedades se conectaron según su distancia calculada. [ 4 ] En 2011, Cusick et al. resumieron estudios sobre asociaciones genotipo-fenotipo en contexto celular. [ 5 ] En 2014, Zhou et al. construyeron una red de enfermedades humanas basada en síntomas mediante la minería de bases de datos de literatura biomédica. [ 6 ]

Propiedades

Una red de enfermedades humanas a gran escala muestra una propiedad de escala libre. La distribución de grados sigue una ley de potencias, lo que sugiere que solo unas pocas enfermedades se conectan con un gran número de enfermedades, mientras que la mayoría de las enfermedades tienen pocos vínculos con otras. Dicha red también muestra una tendencia a la agrupación por clases de enfermedades. [ 2 ] [ 7 ]

En una red de enfermedades basada en síntomas, las enfermedades también se agrupan según sus categorías. Además, las enfermedades que comparten el mismo síntoma tienen más probabilidades de compartir los mismos genes e interacciones proteicas . [ 6 ]

Véase también

Referencias

  1. ↑ "Visor de Jupyter Notebook" .
  2. 1 2 Goh, Kwang-Il, et al. "La red de enfermedades humanas." Actas de la Academia Nacional de Ciencias 104.21 (2007): 8685-8690.
  3. ↑ Barrenas, Fredrik, et al. "Propiedades de red de genes de enfermedades humanas complejas identificados a través de estudios de asociación de todo el genoma." PLoS ONE 4.11 (2009): e8090.
  4. ↑ Hidalgo, César A., ​​et al. "Un enfoque de red dinámica para el estudio de fenotipos humanos." PLoS Computational Biology 5.4 (2009): e1000353.
  5. ↑ Vidal, Marc, Michael E. Cusick y Albert-Laszlo Barabasi. "Redes de interactoma y enfermedades humanas". Cell 144.6 (2011): 986-998.
  6. 1 2 Zhou, XueZhong, et al. "Red de síntomas y enfermedades humanas." Nature Communications 5 (2014).
  7. ↑ Kannan, Venkateshan et al. "Desarrollo condicional de enfermedades extraído de datos de cohortes de atención médica longitudinales mediante la construcción de redes en capas". Scientific Reports 6, 26170 (2016)
  • https://web.archive.org/web/20080625034729/http://hudine.neu.edu/
  • http://www.barabasilab.com/pubs/CCNR-ALB_Publications/200705-14_PNAS-HumanDisease/200705-14_PNAS-HumanDisease-poster.pdf
  • https://www.nytimes.com/2008/05/06/health/research/06dise.html