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Hidrobacterias

Hydrobacteria es un taxón que contiene aproximadamente un tercio de las especies de procariotas , en su mayoría bacterias gramnegativas y sus parientes. [1] Se descubrió que es ...

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Hydrobacteria es un taxón que contiene aproximadamente un tercio de las especies de procariotas , en su mayoría bacterias gramnegativas y sus parientes. [1] Se descubrió que es el pariente más cercano de un grupo aún más grande de Bacteria , Terrabacteria , que son en su mayoría bacterias grampositivas . [2] [1] El nombre Hydrobacteria (hydro = "agua") se refiere al ambiente húmedo inferido para el ancestro común de esas especies. En contraste, las especies de Terrabacteria poseen adaptaciones para la vida en la tierra. [2] [1]

El contenido de Hydrobacteria ha crecido para incluir estos superfilos y filos: Acidobacteriota , Aquificota , Bdellovibrionota , Campylobacterota , Deferribacterota , Dependentiae, Desulfobacterota , Desulfuromonadota, Elusimicrobiota , FCB superphylum , Myxococcota , Nitrospirota , Proteobacteria , PVC superphylum y Spirochaetota . [3] [4]

Algunos análisis filogenéticos moleculares sin raíz [5] [6] no han apoyado esta dicotomía de Terrabacteria e Hydrobacteria, pero los análisis genómicos más recientes, [3] [4] incluidos aquellos que se han centrado en enraizar el árbol, [3] han encontrado que estos dos grupos son monofiléticos.

Se infirió que Hydrobacteria y Terrabacteria divergieron hace aproximadamente 3 mil millones de años, lo que sugiere que la tierra (continentes) había sido colonizada por procariotas en ese momento. [1] Juntos, Hydrobacteria y Terrabacteria forman un gran grupo que contiene el 97% de los procariotas y el 99% de todas las especies de Bacteria conocidas hasta 2009, y se ubican en el taxón Selabacteria, en alusión a sus habilidades fototróficas (selas = luz). [7] Actualmente, los filos bacterianos que están fuera de Hydrobacteria + Terrabacteria , y que justifican así el taxón Selabacteria, son objeto de debate y pueden o no incluir a Fusobacteria . [3] [4]

"Gracilicutes", que fue descrito en 1978 por Gibbons y Murray, [8] a veces se utiliza en lugar de Hydrobacteria. Sin embargo, "Gracilicutes" incluía cianobacterias (un miembro de Terrabacteria ) y no se construyó bajo el sistema de tres dominios ahora generalmente aceptado . [8] Más recientemente, se propuso una redefinición de "Gracilicutes" [9] pero no incluía una filogenia molecular o análisis estadísticos. Además, no seguía el sistema de tres dominios , afirmando en cambio que el linaje de eucariotas + Archaea está anidado dentro de Bacteria como un pariente cercano de Actinomycetota , un árbol no respaldado por ninguna filogenia molecular.

Filogenia

  • Un árbol del tiempo rediseñado que muestra la división de Hydrobacteria y Terrabacteria.
    Un árbol del tiempo rediseñado a partir de Battistuzzi y Hedges (2009) muestra la división de Hydrobacteria y Terrabacteria. [2] [1]

La definición de dos divisiones principales dentro del dominio Bacteria , Hydrobacteria y Terrabacteria , proviene en gran medida de análisis filogenéticos enraizados de genomas. [2] [1] [3] [4] Los análisis no enraizados no han respaldado completamente esta división, [6] [5] llamando la atención sobre la importancia de los árboles de la vida enraizados.

Los dos análisis recientes de la filogenia bacteriana apoyaron la división de Hydrobacteria y Terrabacteria. [3] [4] Sin embargo, interpretaron la evolución de la pared celular de manera diferente, con uno concluyendo que el último ancestro común de Bacteria fue un monodermo ( bacterias grampositivas [3] ) y el otro concluyendo que fue un didermo ( bacterias gramnegativas [4] ). El siguiente árbol se redibuja a partir de uno de esos dos estudios recientes, [3] que muestra la filogenia de los filos y superfilos bacterianos, con la posición de Fusobacteria sin resolver y DST siendo el pariente más cercano de Terrabacteria :

  • Una filogenia de filos y superfilos bacterianos según Coleman et al. (2021).[3] En ese estudio, se hizo referencia a Hydrobacteria como "Gracilicutes".
    Una filogenia de filos y superfilos bacterianos según Coleman et al. (2021). [3] En ese estudio, se hizo referencia a Hydrobacteria como "Gracilicutes".

Referencias

  1. ^ abcdefg Battistuzzi, FU; Hedges, SB (1 de febrero de 2009). "Un clado importante de procariotas con adaptaciones antiguas a la vida en la tierra". Biología molecular y evolución . 26 (2): 335–343. doi :10.1093/molbev/msn247. PMID  18988685.
  2. ^ abcd Battistuzzi, Fabia U; Feijao, Andreia; Hedges, S Blair (2004). "Una escala de tiempo genómica de la evolución procariota: perspectivas sobre el origen de la metanogénesis, la fototrofia y la colonización de la tierra". BMC Evolutionary Biology . 4 (1): 44. doi : 10.1186/1471-2148-4-44 . PMC 533871 . PMID  15535883. 
  3. ^ abcdefghi Coleman, Gareth A.; Davín, Adrián A.; Mahendrarajah, Tara A.; Szánthó, Lénárd L.; Spang, Anja; Hugenholtz, Philip; Szöllősi, Gergely J.; Williams, Tom A. (7 de mayo de 2021). "Una filogenia arraigada resuelve la evolución bacteriana temprana". Ciencia . 372 (6542): eabe0511. doi : 10.1126/ciencia.abe0511. hdl : 1983/51e9e402-36b7-47a6-91de-32b8cf7320d2 . PMID  33958449. S2CID  233872903.
  4. ^ abcdef Léonard, Raphaël R.; Sauvage, Eric; Lupo, Valérian; Perrin, Amandine; Sirjacobs, Damien; Charlier, Paulette; Kerff, Frédéric; Baurain, Denis (18 de febrero de 2022). "¿Fue el último ancestro común bacteriano un monodermo después de todo?". Genes . 13 (2): 376. doi : 10.3390/genes13020376 . PMC 8871954 . PMID  35205421. 
  5. ^ ab Hug, Laura A.; Baker, Brett J.; Anantharaman, Karthik; Brown, Christopher T.; Probst, Alexander J.; Castelle, Cindy J.; Butterfield, Cristina N.; Hernsdorf, Alex W.; Amano, Yuki; Ise, Kotaro; Suzuki, Yohey; Dudek, Natasha; Relman, David A.; Finstad, Kari M.; Amundson, Ronald; Thomas, Brian C.; Banfield, Jillian F. (mayo de 2016). "Una nueva visión del árbol de la vida". Nature Microbiology . 1 (5): 16048. doi : 10.1038/nmicrobiol.2016.48 . PMID  27572647. S2CID  3833474.
  6. ^ ab Zhu, Qiyun; Mai, Uyen; Pfeiffer, Wayne; Janssen, Stefan; Asnicar, Francisco; Sanders, Jon G.; Belda-Ferre, Pedro; Al-Ghalith, Gabriel A.; Kopylova, Evguenia; McDonald, Daniel; Kosciolek, Tomasz; Yin, John B.; Huang, Shi; Salam, Nimaichand; Jiao, Jian-Yu; Wu, Zijun; Xu, Zhenjiang Z.; Cantrell, Kalen; Yang, Yimeng; Sayyari, Erfan; Rabiee, Maryam; Morton, James T.; Podell, Sheila; Caballeros, Dan; Li, Wen-Jun; Huttenhower, Curtis; Segata, Nicola; Más inteligente, Larry; Mirarab, Siavash; Caballero, Rob (diciembre de 2019). "La filogenómica de 10.575 genomas revela proximidad evolutiva entre los dominios de bacterias y arqueas". Nature Communications . 10 (1): 5477. Bibcode :2019NatCo..10.5477Z. doi :10.1038/s41467-019-13443-4. PMC 6889312 . PMID  31792218 . 
  7. ^ Battistuzzi, FU; Hedges, SB (2009). "Eubacteria". En Hedges, SB; Kumar, S (eds.). El árbol del tiempo de la vida . Nueva York: Oxford University Press. págs. 106–115.
  8. ^ ab Gibbons, NE; Murray, RGE (1 de enero de 1978). "Propuestas relativas a los taxones superiores de bacterias". Revista internacional de bacteriología sistemática . 28 (1): 1–6. doi : 10.1099/00207713-28-1-1 .
  9. ^ Cavalier-Smith, Thomas (2006). "Enraizando el árbol de la vida mediante análisis de transición". Biology Direct . 1 (1): 19. doi : 10.1186/1745-6150-1-19 . PMC 1586193 . PMID  16834776. 
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