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Interferón lambda 3

El interferón lambda 3 codifica la proteína IFNL3. IFNL3 se denominaba anteriormente IL28B , pero el Comité de Nomenclatura de Genes de la Organización del Genoma Humano renombr...

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El interferón lambda 3 codifica la proteína IFNL3. IFNL3 se denominaba anteriormente IL28B , pero el Comité de Nomenclatura de Genes de la Organización del Genoma Humano renombró este gen en 2013, al tiempo que asignaba un nombre al gen IFNL4, recientemente descubierto en ese momento . [ 5 ] Junto con IFNL1 (anteriormente IL29 ) e IFNL2 (anteriormente IL28A ), estos genes se encuentran en un grupo en la región cromosómica 19q13. IFNL3 comparte aproximadamente un 96 % de identidad de aminoácidos con IFNL2, aproximadamente un 80 % de identidad con IFNL1 y aproximadamente un 30 % de identidad con IFNL4.

Los genes del interferón lambda codifican citocinas clasificadas como interferones de tipo III , que están distantemente relacionados con los interferones de tipo I y la familia IL-10 . Los interferones de tipo III son inducidos por infecciones virales e interactúan con un receptor de citocinas heterodimérico de clase II que consta del receptor de interleucina 10 beta (IL10RB) y el receptor de interferón lambda 1 (IFNLR1) para señalizar a través de la vía antiviral JAK-STAT. [Proporcionado por RefSeq , julio de 2008].

Hepatitis C

Las variantes se trasladaron a IFNL4.

En 2009 (es decir, antes del descubrimiento de IFNL4) , los resultados de estudios de asociación de genoma completo (GWAS) indicaron que los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) ubicados cerca de IFNL3 (rs12979860, rs8099917 y otros) estaban fuertemente asociados con la respuesta al tratamiento con interferón-α pegilado y ribavirina para la hepatitis C crónica, [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] así como con la eliminación espontánea de la infección por hepatitis C (VHC). [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] El gen entonces conocido como IL28B (ahora IFNL3) era el gen conocido más cercano en ese momento, por lo que estas variantes genéticas se denominaron " variantes de IL28B ". Se asumió que las asociaciones observadas reflejaban diferencias en la estructura o regulación de ese gen. Sin embargo, el descubrimiento de IFNL4 reveló que el SNP rs12979860 está ubicado dentro del intrón 1 de IFNL4 , mientras que rs8099917 se encuentra en una región intergénica , pero más cerca de IFNL4. [ 5 ]   Los SNP rs12979860 y rs8099917 están en alto desequilibrio de ligamiento con una variante de IFNL4 ( IFNL4- ΔG/TT; rs368234815) que controla la generación de la proteína IFNL4. [ 5 ] IFNL4- ΔG/TT parece ser el polimorfismo funcional que explica las asociaciones de GWAS de SNP cercanos con la eliminación del VHC, y se demostró que IFNL4- ΔG/TT tiene una asociación estadística más fuerte con la eliminación del VHC que la de rs12979860, especialmente en poblaciones de ascendencia africana en las que el desequilibrio de ligamiento entre estas variantes es más débil que en otras poblaciones. [ 5 ] [ 14 ]

Variantes reales de IFNL3

Una posible variante funcional en IFNL3 es el SNP rs4803217, que se encuentra en la región reguladora no traducida 3'. La sustitución de guanina por la timina ancestral en este sitio aumenta la expresión del ARNm de IFNL3 al disminuir la degradación del ARNm y la unión de microARN inducida por el VHC [ 15 ] y cambia la estructura del ARN. [ 16 ] [ 11 ] Existe un alto desequilibrio de ligamiento entre rs4803217 y la variante IFNL4- ΔG/TT. [ 5 ] Se ha demostrado que rs4803217 se asocia con la eliminación del VHC, [ 16 ] sin embargo, esa asociación parece provenir del desequilibrio de ligamiento con IFNL4- ΔG/TT más que de un efecto funcional directo del SNP rs4803217 en sí.

Referencias

  1. 1 2 3 GRCh38: Versión 89 de Ensembl: ENSG00000197110 – Ensembl , mayo de 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Versión 89 de Ensembl: ENSMUSG00000060747 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ↑ "Referencia humana de PubMed:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ↑ "Referencia de PubMed sobre el ratón:" . Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU .
  5. 1 2 3 4 5 Prokunina-Olsson L, Muchmore B, Tang W, Pfeiffer RM, Park H, Dickensheets H, et al. (febrero de 2013). "Una variante corriente arriba de IFNL3 (IL28B) que crea un nuevo gen de interferón IFNL4 está asociada con una eliminación deficiente del virus de la hepatitis C" . Nature Genetics . 45 (2): 164– 71. doi : 10.1038/ng.2521 . PMC 3793390. PMID 23291588 .   
  6. ↑ Ge D, Fellay J, Thompson AJ, Simon JS, Shianna KV, Urban TJ, et al. (septiembre de 2009). " La variación genética en IL28B predice la eliminación viral inducida por el tratamiento de la hepatitis C" . Nature . 461 (7262): 399– 401. Bibcode : 2009Natur.461..399G . doi : 10.1038/nature08309 . PMID 19684573. S2CID 1707096 .   
  7. ↑ Suppiah V, Moldovan M, Ahlenstiel G, Berg T, Weltman M, Abate ML, et al. (octubre de 2009). "IL28B se asocia con la respuesta a la terapia con interferón alfa y ribavirina para la hepatitis C crónica". Nature Genetics . 41 (10): 1100– 4. doi : 10.1038/ng.447 . PMID 19749758. S2CID 21619093 .   
  8. ↑ Tanaka Y, Nishida N, Sugiyama M, Kurosaki M, Matsuura K, Sakamoto N, et al. (octubre de 2009). "Asociación genómica de IL28B con la respuesta al tratamiento con interferón alfa pegilado y ribavirina para la hepatitis C crónica". Nature Genetics . 41 (10): 1105– 9. doi : 10.1038/ng.449 . PMID 19749757. S2CID 20399078 .   
  9. ↑ Muir AJ, Gong L, Johnson SG, Lee MT, Williams MS, Klein TE, et al. (febrero de 2014). "Directrices del Consorcio de Implementación de Farmacogenética Clínica (CPIC) para el genotipo IFNL3 (IL28B) y regímenes basados ​​en interferón-α PEG" . Farmacología Clínica y Terapéutica . 95 (2): 141– 6. doi : 10.1038/clpt.2013.203 . PMC 3904555. PMID 24096968 .   
  10. ↑ Thomas DL, Thio CL, Martin MP, Qi Y, Ge D, O'Huigin C, et al. (2009). " Variación genética en IL28B y eliminación espontánea del virus de la hepatitis C" . Nature . 461 (7265): 798– 801. Bibcode : 2009Natur.461..798T . doi : 10.1038/nature08463 . PMC 3172006. PMID 19759533 .   
  11. 1 2 Salum GM, Dawood RM, Abd El-Meguid M, Ibrahim NE, Abdel Aziz AO, El Awady MK (septiembre de 2020). "Correlación entre variantes genéticas IL28B/TLR4 y desarrollo de CHC con/sin tratamiento con AAD en pacientes con VHC crónico" . Genes & Diseases . 7 (3): 392– 400. doi : 10.1016/j.gendis.2019.05.004 . PMC 7452484. PMID 32884993 .  
  12. ^ Thomas DL, Thio CL, Martin MP, Qi Y, Ge D, O'Huigin C, et al. (octubre de 2009). "Variación genética en IL28B y eliminación espontánea del virus de la hepatitis C" . Naturaleza . 461 (7265): 798– 801. Bibcode : 2009Natur.461..798T . doi : 10.1038/naturaleza08463 . PMC 3172006 . PMID 19759533 .   
  13. ↑ Rauch A, Kutalik Z, Descombes P, Cai T, Di Iulio J, Mueller T, et al. (abril de 2010). "La variación genética en IL28B se asocia con la hepatitis C crónica y el fracaso del tratamiento: un estudio de asociación de todo el genoma". Gastroenterology . 138 ( 4): 1338– 45, 1345.e1-7. doi : 10.1053/j.gastro.2009.12.056 . PMID 20060832. S2CID 25546833 .   
  14. ↑ Lu YF, Goldstein DB, Urban TJ, Bradrick SS (febrero de 2015). "El interferón-λ4 es un interferón tipo III celular autónomo asociado con la carga viral del virus de la hepatitis C antes del tratamiento" . Virology . 476 : 334–340 . doi : 10.1016 /j.virol.2014.12.020 . PMC 4494652. PMID 25577150 .  
  15. ↑ McFarland AP, Horner SM, Jarret A, Joslyn RC, Bindewald E, Shapiro BA, et al. (enero de 2014). " El genotipo favorable IFNL3 escapa a la degradación del ARNm mediada por elementos ricos en AU y microARN inducidos por el virus de la hepatitis C" . Nature Immunology . 15 (1): 72–9 . doi : 10.1038/ni.2758 . PMC 4183367. PMID 24241692 .   
  16. 1 2 Lu YF, Mauger DM, Goldstein DB, Urban TJ, Weeks KM, Bradrick SS (noviembre de 2015). "La estructura del ARNm de IFNL3 se remodela mediante un polimorfismo no codificante funcional asociado con la eliminación del virus de la hepatitis C" . Scientific Reports . 5 16037. Bibcode : 2015NatSR...516037L . doi : 10.1038/srep16037 . PMC 4631997. PMID 26531896 .  

Lecturas adicionales

  • Sheppard P, Kindsvogel W, Xu W, Henderson K, Schlutsmeyer S, Whitmore TE, et  al. (enero de 2003). "IL-28, IL-29 y su receptor de citocinas de clase II IL-28R". Nature Immunology . 4 (1): 63– 8. doi : 10.1038/ni873 . PMID 12469119. S2CID 35764259 .  
  • Kotenko SV, Gallagher G, Baurin VV, Lewis-Antes A, Shen M, Shah NK, et al. (enero de 2003). "Las IFN-lambdas median la protección antiviral a través de un complejo receptor de  citocinas de clase II distinto". Nature Immunology . 4 (1): 69– 77. doi : 10.1038/ni875 . PMID 12483210. S2CID 2734534 .  
  • Li M, He S (abril de 2006). "Purificación y caracterización de la interleucina-29 humana recombinante expresada en Escherichia coli". Journal of Biotechnology . 122 (3): 334–40 . doi : 10.1016/j.jbiotec.2005.11.019 . PMID 16413080 . 
  • Mennechet FJ, Uzé G (junio de 2006). "Las células dendríticas tratadas con interferón lambda inducen específicamente la proliferación de células T supresoras que expresan FOXP3" . Blood . 107 (11): 4417–23 . doi : 10.1182/blood-2005-10-4129 . PMID 16478884 . 
  • Li MC, Wang HY, Wang HY, Li T, He SH (abril de 2006). "Expresión de IL-28 e IL-29 mediada por liposomas en células A549 y efecto antiviral de IL-28 e IL-29 en células WISH" . Acta Pharmacologica Sinica . 27 (4): 453–9 . doi : 10.1111/j.1745-7254.2006.00292.x . PMID 16539846 . 
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  • Gad HH, Dellgren C, Hamming OJ, Vends S, Paludan SR, Hartmann R (julio de 2009). "El interferón lambda es funcionalmente un interferón, pero estructuralmente relacionado con la familia de la interleucina-10" . The Journal of Biological Chemistry . 284 (31): 20869–75 . doi : 10.1074/jbc.M109.002923 . PMC 2742852. PMID 19457860 .  
  • Ge D, Fellay J, Thompson AJ, Simon JS, Shianna KV, Urban TJ, et  al. (septiembre de 2009). " La variación genética en IL28B predice la eliminación viral inducida por el tratamiento de la hepatitis C" . Nature . 461 (7262): 399– 401. Bibcode : 2009Natur.461..399G . doi : 10.1038/nature08309 . PMID 19684573. S2CID 1707096 .