IMGT o el sistema internacional de información ImMunoGeneTics es una colección de bases de datos y recursos para inmunoinformática , en particular las secuencias de los genes V, D, J y C , además de proporcionar otras herramientas y datos relacionados con el sistema inmunológico adaptativo . [1] IMGT/LIGM-DB, la primera y aún más grande base de datos alojada como parte de IMGT, contiene secuencias de nucleótidos de referencia para el receptor de células T y moléculas de inmunoglobulina de 360 especies , a partir de 2023. [2] Estos genes codifican las proteínas que son la base de la inmunidad adaptativa, que permite un reconocimiento y una memoria altamente específicos de los patógenos.
Historia

El IMGT fue fundado en junio de 1989 por Marie-Paule Lefranc, inmunóloga que trabajaba en la Universidad de Montpellier . El proyecto fue presentado en el 10º Taller de Mapeo del Genoma Humano y dio como resultado el reconocimiento de las regiones V, D, J y C como genes. [3] El primer recurso creado fue el IMGT/LIGM-DB, una referencia para las secuencias de nucleótidos del receptor de células T y de la inmunoglobulina de los seres humanos y, posteriormente, de las especies de vertebrados. El IMGT fue creado bajo los auspicios del Laboratoire d'ImmunoGénétique Moléculaire de la Universidad de Montpellier, así como del Centro Nacional de Investigación Científica (CNRS) de Francia.
Como tanto los receptores de células T como las moléculas de inmunoglobulina se construyen a través de un proceso de recombinación de secuencias de nucleótidos, la anotación de las regiones de bloques de construcción y su papel es único dentro del genoma. Para estandarizar la terminología y las referencias, se creó el IMGT-NC en 1992 y fue reconocido por la Unión Internacional de Sociedades Inmunológicas como un subcomité de nomenclatura. [4] Otras herramientas incluyen IMGT/Collier-de-Perles, un método para la representación bidimensional de secuencias de aminoácidos de receptores, e IMGT/mAb-DB, una base de datos de anticuerpos monoclonales . Ahora mantenida por el HLA Informatics Group , la referencia principal para HLA humano, IPD-IMGT/HLA Database, se originó en parte con IMGT. [5] Se fusionó con la Immuno Polymorphism Database en 2003 para formar la referencia actual.
Desde 2015, el IMGT está dirigido por Sofia Kossida. [6]
Véase también
Referencias
- ^ Lefranc, Marie-Paule (2014). "Genes de receptores de inmunoglobulina y células T: IMGT® y el nacimiento y auge de la inmunoinformática". Frontiers in Immunology . 5 (22): 22. doi : 10.3389/fimmu.2014.00022 . PMC 3913909 . PMID 24600447.
- ^ "IMGT". Archivado desde el original el 3 de enero de 2023. Consultado el 12 de enero de 2023 .
- ^ Lefranc, Marie-Paule; Lefranc, Gérard (2019). "IMGT® y 30 años de conocimiento inmunoinformático sobre la estructura y función de los dominios V y C de los anticuerpos". Antibodies . 8 (2): 29. doi : 10.3390/antib8020029 . PMC 6640715 . PMID 31544835.
- ^ Subcomité de Nomenclatura de la OMS-IUIS sobre la designación de TCR (1993). "Nomenclatura de los segmentos génicos del receptor de células T (TCR) del sistema inmunitario". Boletín de la Organización Mundial de la Salud . 71 (1): 113–115.
- ^ Robinson, James; Barker, Dominic J; Georgiou, Xenia; Cooper, Michael A; Flicek, Paul; Marsh, Steven GE (2020). "Base de datos IPD-IMGT/HLA". Investigación de ácidos nucleicos . 48 (D1): D948–D955. doi :10.1093/nar/gkz950. PMC 7145640 . PMID 31667505.
- ^ "IMGT Acerca de nosotros". Archivado desde el original el 20 de septiembre de 2022. Consultado el 12 de enero de 2023 .