Articulo de referencia

Motivo de ARN IMPDH

El motivo de ARN IMPDH es una estructura de ARN conservada que fue descubierta mediante bioinformática . [ 1 ] Los ARN con el motivo IMPDH se encuentran en organismos clasificad...

El motivo de ARN IMPDH es una estructura de ARN conservada que fue descubierta mediante bioinformática . [ 1 ] Los ARN con el motivo IMPDH se encuentran en organismos clasificados dentro del género Faecalibacterium .

Los ARN IMPDH suelen ubicarse río arriba de los genes que codifican la inosina monofosfato deshidrogenasa . Sin embargo, en algunos casos, el motivo IMPDH no se encuentra río arriba de genes que codifican proteínas . Por lo tanto, no está claro si los ARN IMPDH funcionan como elementos reguladores cis o si actúan en trans .

El motivo de ARN IMPDH incluye un pseudonudo , pero uno de los tallos involucrados en este aparente pseudonudo muestra solo un ejemplo de covariación , por lo que la existencia del pseudonudo no está clara.

El motivo no se une como un riboswitch . [ 2 ] En cambio, se sugiere que regula la transcripción mediante la "incorporación errónea" de inosina en lugar de uno de los nucleótidos habituales (con ITP en lugar de GTP) en una cadena de ARN. En Faecalibacterium prausnitzii , esto provoca la terminación de la transcripción. También podría existir una función para la unión del motivo a la proteína IMPDH de la bacteria. [ 2 ]

Referencias

  1. Weinberg Z, Lünse CE, Corbino KA, Ames TD, Nelson JW, Roth A, Perkins KR, Sherlock ME, Breaker RR (octubre de 2017). " Detección de 224 ARN estructurados candidatos mediante análisis comparativo de subconjuntos específicos de regiones intergénicas" . Nucleic Acids Res . 45 (18): 10811–10823 . doi : 10.1093/nar/gkx699 . PMC 5737381. PMID 28977401 .  
  2. 1 2 Heiler, Anna Carola (2021). "Investigación del ARN IMPDH como un nuevo motivo regulador de genes" . Universidad de Konstanz (tesis doctoral).