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ITK-SNAP

ITK-SNAP es una aplicación de software interactiva que permite a los usuarios navegar por imágenes médicas tridimensionales, delimitar manualmente regiones anatómicas de interés...

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ITK-SNAP es una aplicación de software interactiva que permite a los usuarios navegar por imágenes médicas tridimensionales, delimitar manualmente regiones anatómicas de interés y realizar segmentación automática de imágenes . El software fue diseñado pensando en investigadores clínicos y de ciencias básicas, y se ha puesto énfasis en una interfaz fácil de usar y en mantener un conjunto limitado de funciones para evitar la sobrecarga de funcionalidades . ITK-SNAP se utiliza con mayor frecuencia para trabajar con conjuntos de datos de resonancia magnética (RM), tomografía computarizada de haz cónico (TCBC) y tomografía computarizada (TC).

Características

El propósito de la herramienta es facilitar a los investigadores la delimitación de estructuras anatómicas y regiones de interés en datos de imágenes. El conjunto de funciones se mantiene al mínimo. Las principales características del programa son:

Navegación de imágenes
En todo momento se muestran tres planos de corte ortogonales a través del volumen de la imagen. Estos planos están vinculados por un cursor común, de modo que al mover el cursor en un plano se actualizan los demás. El cursor se mueve arrastrando el ratón sobre los planos de corte, lo que permite una navegación fluida. El cursor vinculado también funciona entre sesiones de ITK-SNAP, lo que posibilita la navegación por datos de imágenes multimodales (por ejemplo, dos resonancias magnéticas de un mismo sujeto en una sola sesión).
Segmentación manual
ITK-SNAP proporciona herramientas para la delimitación manual de estructuras anatómicas en imágenes. El etiquetado puede realizarse en los tres planos de corte ortogonales y los resultados pueden visualizarse como una representación tridimensional. Esto facilita garantizar que la segmentación mantenga una forma coherente en 3D.
Segmentación automática
ITK-SNAP ofrece segmentación automática de funciones mediante el método de conjuntos de nivel . Esto permite segmentar estructuras que parecen relativamente homogéneas en imágenes médicas con muy poca intervención humana. Por ejemplo, los ventrículos laterales en resonancia magnética se pueden segmentar de forma fiable, al igual que algunos tipos de tumores en tomografía computarizada y resonancia magnética.

ITK-SNAP es un software de código abierto distribuido bajo la Licencia Pública General GNU . Está escrito en C++ y utiliza la biblioteca Insight Segmentation and Registration Toolkit (ITK). ITK-SNAP puede leer y escribir diversos formatos de imágenes médicas, como DICOM, NIfTI y Mayo Analyze . También ofrece soporte limitado para datos de imágenes multicomponente (por ejemplo, imágenes de tensor de difusión ) y multivariadas.

Aplicaciones

ITK-SNAP se ha aplicado en las siguientes áreas

Referencias

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  • Sitio web principal de ITK-SNAP (descargas, errores, listas de correo)
  • ITK-SNAP en SourceForge
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