Motivo de ARNnc Icd-II

El ARN no codificante (ARNnc) icd-II es un motivo de ARN propuesto como un candidato a ribointerruptor fuerte (SRC). ^{[ 1 ]} El ARNnc Icd-II se ha identificado mediante un análisis comparativo de secuencias en regiones intergénicas ricas en GC (IGR) de bacterias, utilizando una herramienta llamada Discovery of Intergenic Motifs PipeLine ( DIMPL ). ^{[ 2 ]} El ARNnc Icd-II se ha localizado corriente arriba del gen icd , que codifica una enzima isocitrato deshidrogenasa (IDH) dependiente de NADP ⁺ . ^{[ 3 ]} La IDH forma parte del ciclo del ácido cítrico y, por lo tanto, participa en la gestión del flujo de carbono a través de esta vía metabólica energética. El ARNnc Icd-II se ha encontrado en bacterias de la clase betaproteobacteria , particularmente en el género Polynucleobacter . La estructura secundaria del ARN icd-II consiste en una unión de tres tallos, donde se predice que el sitio de unión al ribosoma (RBS) del marco de lectura abierto (ORF) adyacente participa en el primer tallo apareado. Se ha propuesto que el ARN no codificante icd-II puede funcionar como un riboswitch que regula el inicio de la traducción de su ORF asociado.

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