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Igor Goryanin

Igor I. Goryanin es un biólogo de sistemas que ocupa la Cátedra Henrik Kacser de Biología de Sistemas Computacionales en la Universidad de Edimburgo . [ 1 ] [ 2 ] Biografía Gory...

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Igor I. Goryanin es un biólogo de sistemas que ocupa la Cátedra Henrik Kacser de Biología de Sistemas Computacionales en la Universidad de Edimburgo . [ 1 ] [ 2 ]

Biografía

Goryanin se graduó en 1985 con una maestría en matemáticas aplicadas del Departamento de Ciencias de la Computación del Instituto de Ingeniería Física de Moscú, donde desarrollaba métodos numéricos y algoritmos para el análisis de ecuaciones diferenciales rígidas. Goryanin trabajó durante más de doce años en el Instituto de Biofísica de la Academia Rusa de Ciencias y obtuvo su doctorado en 1995 en el mismo instituto. Durante este tiempo desarrolló DBSolve, un software para la simulación matemática y el análisis del metabolismo y la regulación celular. [ 3 ] De 1989 a 1995, también fue director ejecutivo y cofundador de Biobank Inc., Rusia.

Entre 1995 y 1997, Goryanin trabajó como científico informático visitante en la División de Matemáticas e Informática de los Laboratorios Nacionales de Argonne.

Goryanin se unió a GlaxoSmithKline (anteriormente conocida como GlaxoWellcome) en 1997, donde trabajó en la aplicación de técnicas de modelado e informática a la investigación y el desarrollo farmacéutico y a la industria de fabricación de medicamentos. El enfoque de modelado de organismos a nivel celular completo desarrollado por Goryanin se ha utilizado con éxito para mejorar la I+D de fármacos y el proceso de fabricación en plantas de producción, por ejemplo, en el diseño de ensayos antimicrobianos y la identificación de dianas farmacológicas antimicrobianas, el diseño racional de organismos, el diseño racional de biomarcadores y la priorización de dianas, así como en la reconstrucción de redes celulares para cánceres y trastornos metabólicos y lipídicos.

En 2005, Goryanin se trasladó a la Universidad de Edimburgo para ocupar la Cátedra Henrik Kacser de Biología de Sistemas Computacionales. En 2006, desarrolló uno de los primeros másteres en Biología de Sistemas Computacionales del Reino Unido, que actualmente se imparte en la Universidad de Edimburgo. Fue cofundador del Centro de Biología de Sistemas de Edimburgo, donde fue codirector (2006-2010), y del Centro de Bioinformática de Edimburgo, donde fue director (2005-2010).

Intereses y proyectos de investigación

  • Biología de sistemas: Reconstrucción, modelado y análisis de redes biológicas a partir de datos de genómica funcional y bibliografía especializada.
  • Desarrollo de infraestructura informática para biología de sistemas
  • Informática de las ciencias de la vida: Minería de datos e integración de datos de bases de datos biológicas y farmacéuticas.
  • Software y algoritmos para el modelado y la simulación, visualización y optimización de sistemas complejos.
  • Investigación en bioenergía y biorremediación: Optimización de dispositivos microbianos que aprovechan la capacidad de algunos microorganismos y enzimas para convertir directamente la materia orgánica en electricidad. (MFC)
  • Oncología de sistemas: Aplicación de modelos y análisis de vías metabólicas en tejidos humanos para predecir la respuesta al tratamiento contra el cáncer y para desarrollar terapias personalizadas, aprendizaje a distancia y diagnósticos oncológicos.

Colaboraciones

Igor es cofundador de la Alianza Internacional de E. coli (IECA). [ 4 ] Goryanin y su grupo participan actualmente en varias colaboraciones internacionales, incluido el desarrollo del Lenguaje de Marcado de Biología de Sistemas , [ 5 ] un formato legible por computadora para representar modelos de redes de reacciones bioquímicas y la Notación Gráfica de Biología de Sistemas , una representación gráfica estándar para biólogos de sistemas. [ 6 ]

Referencias

  1. ↑ "Igor Goryanin" . www.inf.ed.ac.uk. Consultado el 26 de abril de 2021 .
  2. ↑ Sisu, Diana. "Conferencia inaugural del profesor Igor Goryanin" . www.inf.ed.ac.uk. Consultado el 26 de abril de 2021 .
  3. ↑ Goryanin, I.; Hodgman, TC; Selkov, E. (1 de septiembre de 1999). "Simulación matemática y análisis del metabolismo y la regulación celular" . Bioinformatics . 15 (9): 749– 758. doi : 10.1093/bioinformatics/15.9.749 . PMID 10498775 . 
  4. ↑ Holden, Constance (30 de agosto de 2002). " Se lanza una alianza para modelar E. coli". Science . 297 (5586): 1459– 1460. doi : 10.1126/science.297.5586.1459a . PMID 12202792. S2CID 82478432 .  
  5. ↑ Hucka, M.; Finney, A.; Sauro, HM; Boluri, H.; Doyle, JC; Kitano, H.; Arkin, AP; Bornstein, BJ; Bray, D.; Cornish-Bowden, A.; Cuéllar, AA; Dronov, S.; Gilles, ED; Ginkel, M.; Gor, V.; Goryanin, II; Hedley, WJ; Hodgman, TC; Hofmeyr, J.-H.; Cazador, PJ; Juty, NS; Kasberger, JL; Kremling, A.; Kummer, U.; Le Novère, N.; Loew, LM; Lucio, D.; Mendes, P.; Minch, E.; Mjolsness, ED; Nakayama, Y.; Nelson, señor; Nielsen, PF; Sakurada, T.; Schaff, JC; Shapiro, BE; Shimizu, TS; Spence, HD; Stelling, J.; Takahashi, K.; Tomita, M.; Wagner, J.; Wang, J. (1 de marzo de 2003). "El lenguaje de marcado de biología de sistemas (SBML): un medio para la representación e intercambio de modelos de redes bioquímicas" . Bioinformatics . 19 (4): 524– 531. doi : 10.1093/bioinformatics/btg015 . PMID 12611808 . 
  6. ↑ "Acerca de" . Notación gráfica de biología de sistemas . Consultado el 26 de abril de 2021 .
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