Hispanopedia WikiInterferome es una base de datos bioinformática en línea de genes regulados por interferón (IRG). [1] Estos genes regulados por interferón también se conocen como genes estimulados por interferón (ISG). La base de datos contiene información sobre genes regulados de tipo I (IFN alfa, beta), tipo II (IFN gamma) y tipo III (IFN lambda) y se actualiza periódicamente. La comunidad de investigación de interferones y citocinas [2] la utiliza tanto como herramienta de análisis como recurso de información. Los interferones se identificaron como proteínas antivirales hace más de 50 años. Sin embargo, desde entonces se ha identificado su participación en la inmunomodulación , la proliferación celular , la inflamación y otros procesos homeostáticos . Estas citocinas se utilizan como terapias en muchas enfermedades, como infecciones virales crónicas , cáncer y esclerosis múltiple . [3] Estos interferones regulan la transcripción de aproximadamente 2000 genes de manera dependiente del subtipo de interferón, la dosis, el tipo de célula y el estímulo. Esta base de datos de genes regulados por interferón es un intento de integrar información de experimentos de alto rendimiento y bases de datos de biología molecular para obtener una comprensión detallada de la biología del interferón.
Contenido
El interferoma comprende los siguientes conjuntos de datos:
- Datos de expresión genética de genes regulados por interferón de Homo sapiens , Mus musculus y Pan troglodytes , seleccionados manualmente de más de 30 conjuntos de datos de microarrays y proteómicos públicos y internos .
Herramientas
Interferome ofrece muchas formas de buscar y recuperar datos de la base de datos:
- Identificar firmas genéticas reguladas por interferón en datos de microarrays;
- Análisis y anotación de ontología genética ;
- Expresión tisular normal de genes regulados por interferón;
- Análisis regulatorio de genes regulados por interferón;
- Análisis BLAST (Herramienta básica de búsqueda de alineación local) y descarga de secuencias de ortólogos;
Manejo del interferoma
El interferoma está gestionado por un equipo de la Universidad de Monash : el Instituto de Investigación Médica de Monash y la Universidad de Cambridge.
Referencias
- ^ ab Samarajiwa, Shamith A; Forster Sam; Auchettl Katie; Hertzog Paul J (enero de 2009). "INTERFEROMA: la base de datos de genes regulados por interferón". Nucleic Acids Res . 37 (número de la base de datos). Inglaterra: D852-7. doi :10.1093/nar/gkn732. PMC 2686605 . PMID 18996892.
- ^ "Inicio". isicr.org .
- ^ "Acerca del cáncer". 30 de agosto de 2017.
Enlaces externos
- INTERFEROMA
