Articulo de referencia

Interferón Lambda 3

El interferón lambda 3 (símbolo genético: IFNL3) codifica la proteína IFNL3. IFNL3 anteriormente se denominaba IL28B , pero el Comité de Nomenclatura Genética de la Organización...

El interferón lambda 3 (símbolo genético: IFNL3) codifica la proteína IFNL3. IFNL3 anteriormente se denominaba IL28B , pero el Comité de Nomenclatura Genética de la Organización del Genoma Humano renombró este gen en 2013, al tiempo que le asignó un nombre al gen IFNL4 , entonces recién descubierto . [5] Junto con IFNL1 (anteriormente IL29 ) e IFNL2 (anteriormente IL28A ), estos genes se encuentran en un grupo en la región cromosómica 19q13. IFNL3 comparte ~96% de identidad de aminoácidos con IFNL2, ~80% de identidad con IFNL1 y ~30% de identidad con IFNL4.

Los genes del interferón lambda codifican citocinas clasificadas como interferones de tipo III , que están distantemente relacionados con los interferones de tipo I y la familia IL-10 . Los interferones de tipo III son inducidos por la infección viral e interactúan con un receptor de citocina de clase II heterodimérico que consiste en el receptor de interleucina 10 beta (IL10RB) y el receptor de interferón lambda 1 (IFNLR1) para enviar señales a través de la vía antiviral JAK-STAT. [proporcionado por RefSeq , julio de 2008].

Hepatitis C

En 2009 (es decir, antes del descubrimiento de IFNL4 ), los resultados de los estudios de asociación de todo el genoma (GWAS) indicaron que los polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) que se encuentran cerca de IFNL3 (rs12979860, rs8099917 y otros) estaban fuertemente asociados con la respuesta al tratamiento con interferón-α pegilado y ribavirina para la hepatitis C crónica, [6] [7] [8] [9] así como con la eliminación espontánea de la infección por hepatitis C (VHC). [10] [11] [12] [13] El gen entonces conocido como IL28B (ahora IFNL3) era el gen conocido más cercano en ese momento, por lo que estas variantes genéticas se denominaron " variantes de IL28B ". Se asumió que las asociaciones observadas reflejaban diferencias en la estructura o regulación de ese gen. Sin embargo, el descubrimiento de IFNL4 reveló que el SNP rs12979860 se encuentra dentro del intrón 1 de IFNL4 , mientras que rs8099917 se encuentra en una región intergénica , pero más cercana a IFNL4. [5]   Los SNP rs12979860 y rs8099917 están en alto desequilibrio de ligamiento con una variante de IFNL4 ( IFNL4- ΔG/TT; rs368234815) que controla la generación de la proteína IFNL4. [5] IFNL4- ΔG/TT parece ser el polimorfismo funcional que explica las asociaciones de GWAS de SNP cercanos con la eliminación del VHC, y se demostró que IFNL4- ΔG/TT tiene una asociación estadística más fuerte con la eliminación del VHC que la de rs12979860, especialmente en poblaciones de ascendencia africana en las que el desequilibrio de ligamiento entre estas variantes es más débil que en otras poblaciones. [5] [14]

Una posible variante funcional en IFNL3 es el SNP rs4803217, que se encuentra en la región reguladora no traducida 3' . La sustitución de la timina ancestral por guanina en este sitio aumenta la expresión del ARNm de IFNL3 al disminuir la degradación del ARNm y la unión de microARN inducida por el VHC [15] y cambia la estructura del ARN. [16] [11] Existe un alto desequilibrio de ligamiento entre rs4803217 y la variante IFNL4- ΔG/TT. [5] Se ha demostrado que rs4803217 se asocia con la eliminación del VHC, [16] sin embargo, esa asociación parece surgir del desequilibrio de ligamiento con IFNL4- ΔG/TT en lugar de un efecto funcional directo del SNP rs4803217 en sí.

Referencias

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  2. ^ abc GRCm38: Lanzamiento de Ensembl 89: ENSMUSG00000060747 – Ensembl , mayo de 2017
  3. ^ "Referencia de PubMed humana:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .
  4. ^ "Referencia PubMed de ratón:". Centro Nacional de Información Biotecnológica, Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . .
  5. ^ abcde Prokunina-Olsson L, Muchmore B, Tang W, Pfeiffer RM, Park H, Dickensheets H, et al. (febrero de 2013). "Una variante anterior a IFNL3 (IL28B) que crea un nuevo gen de interferón IFNL4 se asocia con una disminución de la eliminación del virus de la hepatitis C". Nature Genetics . 45 (2): 164–71. doi :10.1038/ng.2521. PMC 3793390 . PMID  23291588. 
  6. ^ Ge D, Fellay J, Thompson AJ, Simon JS, Shianna KV, Urban TJ, et al. (septiembre de 2009). "La variación genética en IL28B predice la eliminación viral inducida por el tratamiento de la hepatitis C". Nature . 461 (7262): 399–401. Bibcode :2009Natur.461..399G. doi :10.1038/nature08309. PMID  19684573. S2CID  1707096.
  7. ^ Suppiah V, Moldovan M, Ahlenstiel G, Berg T, Weltman M, Abate ML, et al. (octubre de 2009). "IL28B está asociada con la respuesta a la terapia con interferón alfa y ribavirina para la hepatitis C crónica". Nature Genetics . 41 (10): 1100–4. doi :10.1038/ng.447. PMID  19749758. S2CID  21619093.
  8. ^ Tanaka Y, Nishida N, Sugiyama M, Kurosaki M, Matsuura K, Sakamoto N, et al. (octubre de 2009). "Asociación de IL28B en todo el genoma con la respuesta a la terapia con interferón alfa pegilado y ribavirina para la hepatitis C crónica". Nature Genetics . 41 (10): 1105–9. doi :10.1038/ng.449. PMID  19749757. S2CID  20399078.
  9. ^ Muir AJ, Gong L, Johnson SG, Lee MT, Williams MS, Klein TE, et al. (febrero de 2014). "Directrices del Consorcio de Implementación de Farmacogenética Clínica (CPIC) para regímenes basados ​​en el genotipo IFNL3 (IL28B) y PEG interferón-α". Farmacología clínica y terapéutica . 95 (2): 141–6. doi :10.1038/clpt.2013.203. PMC 3904555 . PMID  24096968. 
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  12. ^ Thomas DL, Thio CL, Martin MP, Qi Y, Ge D, O'Huigin C, et al. (octubre de 2009). "Variación genética en IL28B y eliminación espontánea del virus de la hepatitis C". Nature . 461 (7265): 798–801. Bibcode :2009Natur.461..798T. doi :10.1038/nature08463. PMC 3172006 . PMID  19759533. 
  13. ^ Rauch A, Kutalik Z, Descombes P, Cai T, Di Iulio J, Mueller T, et al. (abril de 2010). "La variación genética en IL28B está asociada con la hepatitis C crónica y el fracaso del tratamiento: un estudio de asociación de todo el genoma". Gastroenterología . 138 (4): 1338–45, 1345.e1-7. doi :10.1053/j.gastro.2009.12.056. PMID  20060832. S2CID  25546833.
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Lectura adicional

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