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Interlolog

Un interologo es una interacción conservada entre un par de proteínas que tienen homólogos interactuantes en otro organismo. El término fue introducido en un artículo de 2000 po...

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Un interologo es una interacción conservada entre un par de proteínas que tienen homólogos interactuantes en otro organismo. El término fue introducido en un artículo de 2000 por Walhout et al. [ 1 ] [ 2 ]

Ejemplo

A

Supongamos que A y B son dos proteínas humanas diferentes que interactúan entre sí, y A' y B' son dos proteínas caninas diferentes que interactúan entre sí. Entonces, la interacción entre A y B es un interologo de la interacción entre A' y B' si se cumplen todas las siguientes condiciones:

  • A es un homólogo de A'. (Los homólogos de proteínas tienen secuencias de aminoácidos similares y derivan de una secuencia ancestral común).
  • B es un homólogo de B'.
  • A y B interactúan.
  • A' y B' interactúan.

Por lo tanto, los interólogos son pares homólogos de interacciones proteicas en diferentes organismos.

Véase también

Referencias

  1. ↑ Walhout, AJ; Sordella, R.; Lu, X.; Hartley, JL; Temple, GF; Brasch, MA; Thierry-Mieg, N.; Vidal, M. (2000). "Mapeo de interacciones proteicas en C. elegans utilizando proteínas involucradas en el desarrollo de la vulva". Science . 287 (5450): 116– 122. Bibcode : 2000Sci...287..116W . doi : 10.1126/science.287.5450.116 . PMID 10615043 . 
  2. ↑ Yu, H.; Luscombe, NM; Lu, HX; Zhu, X.; Xia, Y.; Han, JD; Bertin, N.; Chung, S.; Vidal, M.; Gerstein, M. (2004). "Transferencia de anotaciones entre genomas: interlogaritmos proteína-proteína y regulalogaritmos proteína-ADN" . Genome Research . 14 (6): 1107– 1118. doi : 10.1101/gr.1774904 . PMC 419789. PMID 15173116 .  
  • Yu, H.; Luscombe, NM; Lu, HX; Zhu, X.; Xia, Y.; Han, JD; Bertin, N.; Chung, S.; Vidal, M.; Gerstein, M. (2004). "Transferencia de anotaciones entre genomas: interólogos proteína-proteína y reguladores proteína-ADN" . Genome Research . 14 (6): 1107– 1118. doi : 10.1101/gr.1774904 . PMC 419789. PMID 15173116 .  
  • Kemmer, D.; Huang, Y.; Shah, SP; Lim, J.; Brumm, J.; Yuen, MM; Ling, J.; Xu, T.; Wasserman, WW; Ouellette, BF (2005). "Ulises: una aplicación para la proyección de interacciones moleculares entre especies" . Genome Biology . 6 (12): R106. doi : 10.1186/gb-2005-6-12-r106 . PMC 1414088. PMID 16356269 .  
  • Wiles, AM; Doderer, M.; Ruan, J.; Gu, TT; Ravi, D.; Blackman, B.; Bishop, AJ (2010). " Construcción y análisis de redes de interactoma de proteínas mediante comparaciones entre especies" . BMC Systems Biology . 4 : 36. doi : 10.1186/1752-0509-4-36 . PMC 2859380. PMID 20353594 .  
  • Interactome.org Archivado el 20 de agosto de 2008 en Wayback Machine : sitio del portal Interactome.
  • Interactomics.org : Portal web de Interactomics.
  • Sitio web para la predicción de interacciones entre especies.