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Código mitocondrial de invertebrados

El código mitocondrial de los invertebrados ( tabla de traducción 5 ) es un código genético utilizado por el genoma mitocondrial de estos organismos . Las mitocondrias contienen...

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El código mitocondrial de los invertebrados ( tabla de traducción 5 ) es un código genético utilizado por el genoma mitocondrial de estos organismos . Las mitocondrias contienen su propio ADN y se reproducen independientemente de la célula huésped. Se ha identificado variación en la traducción del código genético mitocondrial cuando los codones de ADN dan lugar a aminoácidos no estándar en invertebrados, especialmente en artrópodos . [ 1 ] Esta variación ha sido útil como herramienta para mejorar el árbol filogenético de invertebrados, como los platelmintos . [ 2 ]

El código

   AAs = FFLLSSSSYY**CCWWLLLLPPPPHHQQRRRRIIMMTTTTNNKKSSSSVVVVAAAADDEEGGGG
Starts = ---M----------------------------MMMM---------------M------------
 Base1 = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
 Base2 = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
 Base3 = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

Bases: adenina (A), citosina (C), guanina (G) y timina (T) o uracilo (U).

Aminoácidos: Alanina (Ala, A), Arginina (Arg, R), Asparagina (Asn, N), Ácido aspártico (Asp, D), Cisteína (Cys, C), Ácido glutámico (Glu, E), Glutamina (Gln, Q), Glicina (Gly, G), Histidina (His, H), Isoleucina (Ile, I), Leucina (Leu, L), Lisina (Lys, K), Metionina (Met, M) , Fenilalanina (Phe, F), Prolina (Pro, P), Serina (Ser, S), Treonina (Thr, T), Triptófano (Trp, W), Tirosina (Tyr, Y), Valina (Val, V).

Diferencias con el código estándar

Nota: El codón AGG está ausente en Drosophila . [ 3 ]

Codones de iniciación alternativos

Rango sistemático

Otras variaciones

  • Varios artrópodos traducen el codón AGG como lisina en lugar de serina (como en el código mitocondrial de los pterobranquios ) o arginina (como en el código genético estándar ). [ 8 ] [ 9 ]
  • GUG posiblemente funcione como un iniciador en Drosophila . [ 10 ] [ 11 ] AUU no se utiliza como un iniciador en Mytilus [ 6 ]
  • "Debe operar un mecanismo excepcional para la iniciación de la traducción del ARNm de la subunidad I de la citocromo oxidasa tanto en D. melanogaster [ 12 ] como en D. yakuba [ 13 ], ya que su único codón de iniciación plausible, AUA, está fuera de fase con el resto del gen. La iniciación parece requerir la "lectura" de un cuarteto AUAA, lo que sería equivalente a la iniciación en AUA seguida inmediatamente por un cambio de marco de lectura ribosomal específico. Otro posible mecanismo... es que el ARNm sea "editado" para poner la iniciación AUA en fase." [ 14 ]

Véase también

Referencias

Este artículo incorpora texto de la Biblioteca Nacional de Medicina de los Estados Unidos , que es de dominio público . [ 15 ]

  1. ↑ Abascal, Federico; Posada, David; Knight, Robin D.; Zardoya, Rafael (25 de abril de 2006). " Evolución paralela del código genético en los genomas mitocondriales de artrópodos" . PLOS Biology . 4 (5): e127. doi : 10.1371/journal.pbio.0040127 . ISSN 1545-7885 . PMC 1440934. PMID 16620150 .   
  2. ↑ Telford, Maximilian J.; Herniou, Elisabeth A.; Russell, Robert B.; Littlewood, D. Timothy J. (10 de octubre de 2000). "Cambios en los códigos genéticos mitocondriales como caracteres filogenéticos: dos ejemplos de los gusanos planos" . Actas de la Academia Nacional de Ciencias . 97 (21): 11359– 11364. Bibcode : 2000PNAS...9711359T . doi : 10.1073 / pnas.97.21.11359 . ISSN 0027-8424 . PMC 17205. PMID 11027335 .   
  3. ↑ Sengupta S, Yang X, Higgs PG (junio de 2007). "Los mecanismos de reasignación de codones en los códigos genéticos mitocondriales" . Journal of Molecular Evolution . 64 (6): 662– 88. arXiv : q-bio/0703066 . Bibcode : 2007JMolE..64..662S . doi : 10.1007/s00239-006-0284-7 . PMC 1894752. PMID 17541678 .  
  4. ↑ Crozier RH, Crozier YC (enero de 1993). "El genoma mitocondrial de la abeja melífera Apis mellifera: secuencia completa y organización del genoma" . Genetics . 133 ( 1): 97–117 . doi : 10.1093/genetics/133.1.97 . PMC 1205303. PMID 8417993 .  
  5. 1 2 Boore JL, Brown WM (octubre de 1994). "Secuencia completa de ADN del genoma mitocondrial del quitón negro, Katharina tunicata" . Genetics . 138 ( 2): 423–43 . doi : 10.1093/genetics/138.2.423 . PMC 1206160. PMID 7828825 .  
  6. 1 2 Hoffmann RJ, Boore JL, Brown WM (junio de 1992). "Una nueva organización del genoma mitocondrial para el mejillón azul, Mytilus edulis" . Genetics . 131 ( 2): 397– 412. doi : 10.1093/genetics/131.2.397 . PMC 1205014. PMID 1386586 .  
  7. ↑ Batuecas B, Garesse R, Calleja M, Valverde JR, Marco R (julio de 1988). "Organización del genoma del ADN mitocondrial de Artemia" . Nucleic Acids Research . 16 (14A): 6515–29 . doi : 10.1093 / nar/16.14.6515 . PMC 338311. PMID 3135541 .  
  8. ↑ Abascal F, Posada D, Knight RD, Zardoya R (mayo de 2006). "Evolución paralela del código genético en genomas mitocondriales de artrópodos" . PLOS Biology . 4 (5): e127. doi : 10.1371/journal.pbio.0040127 . PMC 1440934. PMID 16620150 .  
  9. ↑ Robinson, Richard (25 de abril de 2006). "Para las mitocondrias de los artrópodos, la variedad en el código genético es estándar" . PLOS Biology . 4 (5): e175. doi : 10.1371/journal.pbio.0040175 . PMC 1440929. PMID 20076581 .  
  10. ↑ Clary DO, Wolstenholme DR (1985). "La molécula de ADN mitocondrial de Drosophila yakuba: secuencia de nucleótidos, organización genética y código genético". Journal of Molecular Evolution . 22 (3): 252– 71. Bibcode : 1985JMolE..22..252C . doi : 10.1007/BF02099755 . PMID 3001325. S2CID 12384495 .  
  11. ↑ Gadaleta G, Pepe G, De Candia G, Quagliariello C, Sbisà E, Saccone C (julio de 1988). "Secuencia de nucleótidos de la subunidad 1 de la NADH deshidrogenasa mitocondrial de rata . GTG, un nuevo codón iniciador en el genoma mitocondrial de vertebrados" . Nucleic Acids Research . 16 (13): 6233. doi : 10.1093/nar/16.13.6233 . PMC 336868. PMID 3399396 .  
  12. ↑ de Bruijn MH (1983). "ADN mitocondrial de Drosophila melanogaster, una organización y un código genético novedosos". Nature . 304 ( 5923): 234– 41. Bibcode : 1983Natur.304..234D . doi : 10.1038/304234a0 . PMID 6408489. S2CID 35948584 .  
  13. ↑ Clary DO, Wolstenholme DR (junio de 1983). "Secuencia de nucleótidos de un segmento de ADN mitocondrial de Drosophila que contiene los genes para las subunidades II y III de la citocromo c oxidasa y la subunidad 6 de la ATPasa" . Nucleic Acids Research . 11 (12): 4211–27 . doi : 10.1093/nar/11.12.4211 . PMC 326036. PMID 6306579 .  
  14. ↑ Fox TD (1987). "Variación natural en el código genético". Annual Review of Genetics . 21 : 67–91 . doi : 10.1146/annurev.ge.21.120187.000435 . PMID 3327473 . 
  15. ↑ Elzanowski A, Ostell J, Leipe D, Soussov V. "Los códigos genéticos" . Navegador de taxonomía . Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI), Biblioteca Nacional de Medicina de EE . UU . Consultado el 26 de agosto de 2015 .