Articulo de referencia

Revista de Biología Celular

La revista Journal of Cell Biology es una revista científica revisada por pares, publicada por Rockefeller University Press . Historia A principios de la década de 1950, un pequ...

La revista Journal of Cell Biology es una revista científica revisada por pares, publicada por Rockefeller University Press .

Historia

A principios de la década de 1950, un pequeño grupo de biólogos comenzó a explorar la anatomía intracelular utilizando la tecnología emergente de la microscopía electrónica . Muchos de estos investigadores trabajaban en el Instituto Rockefeller de Medicina, predecesor de la Universidad Rockefeller . A medida que sus trabajos avanzaban hacia su publicación, se sintieron decepcionados por la limitada calidad de la reproducción de imágenes en semitonos en las revistas impresas de la época y frustrados por las restrictivas políticas editoriales de las revistas existentes con respecto a sus resultados basados ​​en imágenes. En 1954, el director del Instituto Rockefeller, Detlev Bronk , organizó un almuerzo para discutir la creación de una nueva revista como plataforma para la publicación de este tipo de trabajos. [ 1 ]

El primer número de The Journal of Biophysical and Biochemical Cytology se publicó menos de un año después, el 25 de enero de 1955. La suscripción costaba 15 dólares al año. La lista de editores estaba compuesta por Richard S. Bear, H. Stanley Bennett, Albert L. Lehninger , George E. Palade , Keith R. Porter , Francis O. Schmitt , Franz Schrader y Arnold M. Seligman. Las instrucciones para los autores describían el alcance de la revista: « The Journal of Biophysical and Biochemical Cytology está diseñada para proporcionar un medio común para la publicación de investigaciones morfológicas , biofísicas y bioquímicas sobre células, sus componentes y sus productos. Prestará especial atención a los informes sobre la organización celular a nivel coloidal y molecular , y a los estudios que integren información citológica derivada de diversos enfoques técnicos». Reconociendo que necesitaban un título más atractivo, los editores cambiaron el nombre a The Journal of Cell Biology («JCB») en 1962.

Muchos descubrimientos fundamentales se han publicado en la revista, incluyendo las primeras descripciones de numerosas funciones y estructuras celulares, como la vía secretora , [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] el ADN mitocondrial [ 8 ] [ 9 ] y cloroplástico [ 10 ] , los microtúbulos , [ 11 ] [ 12 ] los filamentos intermedios , [ 13 ] las uniones estrechas [ 14 ] (incluyendo ocludinas [ 15 ] y claudinas [ 16 ] ), las uniones adherentes , [ 14 ] y las cadherinas . [ 17 ]

Fechas clave

  • 25 de enero de 1955: Publicación del primer número de la Revista de Citología Biofísica y Bioquímica.
  • Enero de 1961 – diciembre de 1983: Raymond Griffiths es editor ejecutivo.
  • Enero de 1962: El nombre de la revista cambió a The Journal of Cell Biology .
  • Enero de 1984 – diciembre de 1998 : Bernie Gilula es editor en jefe.
  • 13 de enero de 1997: Se publica en línea el primer número de JCB.
  • Abril de 1997 – abril de 2007: Mike Rossner es editor jefe.
  • Enero de 1999 – diciembre de 2008: Ira Mellman es redactor jefe.
  • Julio de 2000: Se permite a los autores publicar el archivo PDF final de sus artículos en sus propios sitios web.
  • Enero de 2001: JCB comienza a ofrecer su contenido en línea de forma gratuita al público seis meses después de su publicación.
  • Julio de 2002: JCB adopta un flujo de trabajo completamente electrónico.
  • Septiembre de 2002: JCB comienza a examinar todas las imágenes digitales en busca de indicios de manipulación.
  • Enero de 2003: JCB es pionera en el flujo de trabajo RGB para imágenes digitales en color.
  • Junio ​​de 2003: JCB publica gratuitamente para el público todo su contenido anterior con más de seis meses de antigüedad, desde el volumen 1, número 1.
  • Mayo de 2007 – julio de 2010: Emma Hill es editora ejecutiva.
  • Noviembre de 2007: JCB comienza a publicar todo su contenido en PubMed Central , donde está disponible gratuitamente para el público seis meses después de su publicación.
  • 1 de mayo de 2008: Una nueva política de derechos de autor permite a los autores conservar los derechos de autor de sus propias obras y a terceros reutilizar el contenido de JCB bajo una licencia Creative Commons .
  • Diciembre de 2008: JCB lanza Dataviewer.
  • Enero de 2009 – septiembre de 2014: Tom Misteli es redactor jefe.
  • Septiembre de 2010 – diciembre de 2014: Elizabeth H. Williams es editora ejecutiva.
  • Octubre de 2014 – Mayo de 2015: Alan Hall es Editor en Jefe. [ 18 ]
  • Abril de 2015 – agosto de 2019: Rebecca Alvania es editora ejecutiva.
  • Agosto de 2015 – presente: Jodi Nunnari es editora en jefe. [ 19 ]
  • Noviembre de 2019 – actualidad : Tim Spencer es editor ejecutivo.

Resumen e indexación

Según los Journal Citation Reports , la revista tiene un factor de impacto de 6,1 en 2024, lo que la sitúa en el puesto 28 de 201 revistas en la categoría "Biología Celular". [ 20 ]

Acceso en línea

La revista se publicó por primera vez en línea el 13 de enero de 1997. Todo el contenido fue de acceso gratuito durante ese primer año de publicación en línea. En enero de 1998, todo el contenido de investigación primaria se sometió a controles de acceso, pero las noticias y las reseñas siguieron siendo de acceso gratuito inmediatamente después de su publicación.

En enero de 2001, en respuesta a las peticiones de la comunidad investigadora para que se proporcionara acceso gratuito a los resultados de las investigaciones financiadas con fondos públicos, la revista fue una de las primeras en publicar el contenido de sus investigaciones primarias al público 6 meses después de su publicación. [ 21 ]

En junio de 2003, todo el contenido, a partir del volumen 1, número 1, se publicó en línea y se ofreció de forma gratuita. [ 22 ]

En noviembre de 2007, anticipándose al mandato de los Institutos Nacionales de Salud sobre el acceso público a los resultados de las investigaciones financiadas por los NIH, la revista comenzó a depositar todo su contenido en PubMed Central , donde la versión final publicada se publica para el público 6 meses después de su publicación. [ 23 ]

En julio de 2000, la revista fue una de las primeras en permitir a los autores publicar el archivo PDF final de sus artículos en sus propios sitios web. [ 24 ] El 1 de mayo de 2008, se modificó la política de derechos de autor , permitiendo a los autores conservar los derechos de autor de sus propias obras. Al mismo tiempo, el contenido de la revista se abrió al uso de terceros bajo una licencia Creative Commons . La única restricción para este uso por parte de terceros es que no pueden crear un sitio espejo gratuito durante los primeros seis meses posteriores a la publicación.

Integridad de los datos

Orígenes de la detección de imágenes

En 2002, la revista adoptó un flujo de trabajo de producción completamente electrónico. Esto significa que todo el texto se envía como archivos de documentos electrónicos y todas las figuras como archivos de imágenes electrónicas. Mientras formateaba los archivos de figuras para un manuscrito aceptado, Mike Rossner , quien era entonces el editor jefe , descubrió un Western blot en el que la intensidad de una sola banda se había ajustado selectivamente en relación con las demás. Los autores obtuvieron los datos originales y era evidente que la manipulación afectaba la interpretación de los datos. Se revocó la aceptación editorial del manuscrito y la revista implementó de inmediato una política para examinar todas las imágenes en todos los artículos aceptados en busca de evidencia de manipulación de imágenes. [ 25 ]

Directrices para el manejo de imágenes digitales

En consulta con científicos en ejercicio que formaban parte del consejo editorial , se desarrollaron directrices para el manejo de imágenes digitales, que se publicaron por primera vez en junio de 2003. [ 26 ]

Publicidad sobre manipulación de imágenes y análisis de imágenes

El programa de revisión de imágenes de la revista se dio a conocer en un artículo de Nature en abril de 2005, titulado "CSI Cell Biology". [ 27 ] El día de Navidad de 2005, The New York Times publicó un artículo que mostraba que la manipulación de imágenes era parte del fraude científico perpetrado por Hwang Woo-Suk y sus colegas. [ 28 ] Cuando se hizo evidente que el programa de revisión de la Journal of Cell Biology habría detectado la manipulación de imágenes antes de la publicación, The New York Times destacó el proceso de la revista en la portada de su sección Science Times el 24 de enero de 2006. [ 29 ] Esto aumentó la conciencia entre el público y entre otras revistas biomédicas sobre el valor potencial de la revisión de imágenes por parte de los editores de revistas.

Respuesta de la Academia Nacional de Ciencias

En febrero de 2006, los editores expresaron la necesidad de estándares consensuados por la comunidad para mantener la integridad de los datos en una carta dirigida al presidente de la Academia Nacional de Ciencias de los Estados Unidos, Ralph Cicerone . [ 30 ] La carta, junto con las preocupaciones posteriores sobre los datos digitales planteadas por otras editoriales científicas, impulsó un estudio del Comité de Ciencia, Ingeniería y Políticas Públicas (una unidad conjunta de la academia, la Academia Nacional de Ingeniería y el Instituto de Medicina ) para examinar el tema de la integridad de los datos. El estudio se encargó en mayo de 2006.

Mike Rossner presentó una ponencia ante el Comité en una reunión abierta en abril de 2007, en la que describió la experiencia de JCB y de otras revistas de Rockefeller University Press en el manejo de la manipulación de imágenes. Señaló que debería ser responsabilidad de la comunidad investigadora desarrollar estándares de integridad de datos, pero JCB había asumido este papel porque no existían tales estándares cuando JCB se enfrentó por primera vez al problema en 2002.

El Comité publicó su informe, titulado «Garantizar la integridad, la accesibilidad y la gestión de los datos de investigación en la era digital», en julio de 2009. [ 31 ] El anuncio de la NAS citó específicamente al JCB por sus medidas proactivas para establecer directrices específicas sobre «formas aceptables e inaceptables de alterar imágenes». El informe abordó el problema de la integridad de los datos desde la perspectiva de la veracidad y la precisión en la adquisición y la presentación de datos, y desde la perspectiva de la accesibilidad de los datos a lo largo del tiempo. No proporcionó estándares específicos para mantener la integridad de los datos ni recomendaciones para hacer cumplir dichos estándares una vez establecidos. El informe llegó a la conclusión general de que «los propios investigadores son responsables de garantizar la integridad de sus datos de investigación».

innovaciones técnicas

El estándar RGB

JCB fue la primera revista en adoptar el "Estándar RGB" para la reproducción de imágenes en color. Para maximizar la calidad de la reproducción de imágenes en color, JCB declaró en enero de 2004 [ 32 ] que la versión en línea de la revista es la "revista oficial" y que las imágenes se reproducirían en línea utilizando los archivos de los autores en el mismo esquema de color (rojo, verde, azul) en el que se adquieren con cámaras digitales y que se utiliza para mostrarlas en un monitor de computadora.

Anteriormente, se solicitaba a los autores que convirtieran sus archivos RGB al esquema de color CMYK necesario para la impresión en papel, lo que resultaba en una pérdida considerable de brillo de la imagen. Posteriormente, la editorial convertía esos archivos CMYK de nuevo a RGB para su publicación en línea, lo que implicaba una segunda modificación de los colores originales. La llegada del flujo de trabajo RGB permitió que los colores se mostraran en la publicación en línea exactamente como aparecían en los archivos originales de los autores.

El visor de datos JCB

El 1 de diciembre de 2008, JCB lanzó JCB DataViewer, la primera aplicación basada en navegador para visualizar datos de imágenes multidimensionales originales. [ 33 ] Esta aplicación se desarrolló en colaboración con Glencoe Software [ 34 ] utilizando un motor de gestión de datos basado en el software OMERO desarrollado por Open Microscopy Environment . [ 35 ] Glencoe Software también desarrolló una aplicación "Rollup" para cargar archivos de imágenes originales a DataViewer. DataViewer admite numerosos tipos de archivos propietarios de diversos microscopios y sistemas de documentación de geles. [ 36 ]

Esta revolucionaria aplicación permite a los autores de JCB presentar datos de imágenes multidimensionales tal como fueron adquiridos, brindándoles la oportunidad de compartir datos que antes no era posible compartir. Los lectores de JCB pueden ver los datos originales que respaldan un artículo publicado e interactuar con ellos desplazándose por una pila de imágenes en el eje z o una pila de imágenes de lapso de tiempo. Los usuarios pueden seleccionar canales individuales para visualizarlos o verlos todos por separado en la misma pantalla. También pueden generar gráficos de intensidad de píxeles a lo largo de cualquier eje horizontal o vertical.

Una actualización del software en agosto de 2012 permite al usuario pasar sin problemas de una magnificación de 1 milímetro a 1 micrómetro en imágenes obtenidas con microscopios ópticos y electrónicos. Como ejemplo, proporcionan una imagen completa de un embrión de pez cebra. [ 37 ] [ 38 ]

Referencias

  1. "Introducción: recuerdos sobre los inicios de la Revista de Biología Celular" . Jcb.rupress.org. 1 de diciembre de 1981. Consultado el 20 de octubre de 2011 .
  2. Siekevitz, Philip; Palade, George E. (25 de septiembre de 1958). "Estudio citoquímico del páncreas del conejillo de indias" . The Journal of Biophysical and Biochemical Cytology . 4 (5): 557– 566. doi : 10.1083/jcb.4.5.557 . PMC 2224556. PMID 13587549 .  
  3. Siekevitz, Philip; Palade, George E. (1 de julio de 1960). "Estudio citoquímico del páncreas del conejillo de indias" . The Journal of Biophysical and Biochemical Cytology . 7 (4): 619– 630. doi : 10.1083/jcb.7.4.619 . PMC 2224887. PMID 14446510 .  
  4. Caro, Lucien G.; Palade, George E. (1 de marzo de 1964). "Síntesis, almacenamiento y descarga de proteínas en la célula exocrina pancreática" . The Journal of Cell Biology . 20 (3): 473– 495. doi : 10.1083/jcb.20.3.473 . PMC 2106415. PMID 14128049 .  
  5. Jamieson, James D.; Palade, George E. (1 de agosto de 1967). "Transporte intracelular de proteínas secretoras en la célula exocrina pancreática" . The Journal of Cell Biology . 34 (2): 577– 596. doi : 10.1083/jcb.34.2.577 . PMC 2107305. PMID 6035647 .  
  6. Jamieson, James D.; Palade, George E. (1 de agosto de 1967). "Transporte intracelular de proteínas secretoras en la célula exocrina pancreática" . The Journal of Cell Biology . 34 (2): 597– 615. doi : 10.1083/jcb.34.2.597 . PMC 2107311. PMID 6035648 .  
  7. Jamieson, James D.; Palade, George E. (1 de julio de 1971). "Síntesis, transporte intracelular y liberación de proteínas secretoras en células exocrinas pancreáticas estimuladas" . The Journal of Cell Biology . 50 (1): 135– 158. doi : 10.1083/jcb.50.1.135 . PMC 2108418. PMID 4327462 .  
  8. Nass, Margit MK; Nass, Sylvan (1 de diciembre de 1963). " Fibras intramitocondriales con características de ADN" . The Journal of Cell Biology . 19 (3): 593– 611. doi : 10.1083/jcb.19.3.593 . PMC 2106331. PMID 14086138 .  
  9. Nass, Sylvan; Nass, Margit MK (1 de diciembre de 1963). "Fibras intramitocondriales con características de ADN" . The Journal of Cell Biology . 19 (3): 613– 629. doi : 10.1083/jcb.19.3.613 . PMC 2106332. PMID 14086139 .  
  10. Hans Ris; Walter Plaut (1 de junio de 1962). "Ultraestructura de las áreas que contienen ADN en el cloroplasto de Chlamydomonas" . The Journal of Cell Biology . 13 (3). Jcb.rupress.org: 383–391 . doi : 10.1083/jcb.13.3.383 . PMC 2106071. PMID 14492436 .  
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