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JAaligner

JAligner es una implementación de código abierto en Java del algoritmo Smith-Waterman [ 1 ] con la mejora de Gotoh [ 2 ] para el alineamiento local de secuencias por pares en bi...

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JAligner es una implementación de código abierto en Java del algoritmo Smith-Waterman [ 1 ] con la mejora de Gotoh [ 2 ] para el alineamiento local de secuencias por pares en biología, utilizando el modelo de penalización de huecos afines . Fue escrito por Ahmed Moustafa.

Véase también

Referencias

  1. ↑ Smith TF y Waterman MS (1981). Identificación de subsecuencias moleculares comunes. J Mol Biol, 147:195-197 .
  2. ↑ Gotoh O (1982). Un algoritmo mejorado para la comparación de secuencias biológicas. J Mol Biol, 162:705-708 .
  • Sitio web oficial
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