Jeffrey Barrick

Jeffrey E. Barrick es profesor del Departamento de Biociencias Moleculares de la Universidad de Texas en Austin . Su investigación utiliza las herramientas de la genómica , la biología sintética y la biología molecular para estudiar la evolución de los microorganismos , incluidos los simbiontes de los insectos . Desde 2022, Barrick dirige el Experimento de Evolución a Largo Plazo de E. coli (LTEE), que se lleva a cabo desde 1988. ^[1]

Barrick recibió su licenciatura en Química de Caltech en 2001, e hizo un doctorado en Bioquímica y Biofísica en Yale , ^[2] trabajando con Ronald Breaker en riboswitches y otros motivos reguladores de ARN en bacterias. ^[3] Barrick luego hizo investigación postdoctoral en la Universidad Estatal de Michigan , ^[2] donde trabajó con Richard Lenski en el LTEE y dirigió la primera secuenciación y análisis del genoma completo de las muestras bacterianas evolucionadas. ^[4] Un comentario adjunto señala que "La complejidad de la relación entre el ritmo y el modo de evolución a nivel genómico y organismal es la causa de cierta inquietud, y sugiere que se debe tener precaución al inferir el modo de evolución organismal a partir de las tasas de evolución evidentes en el ADN". ^[5]

Barrick se unió a la facultad de UT Austin en 2011 ^[6] y se convirtió en profesor titular en 2024. ^[7] Desde 2012, Barrick ha sido el mentor de la facultad para los equipos de estudiantes de biología sintética iGEM en UT Austin. ^[8] A agosto de 2024, Barrick ha publicado más de 100 artículos científicos y tiene un índice h de 54. ^[9]

Al hablar sobre el futuro del LTEE en 2015, Lenski, el director fundador, propuso que "cada científico sucesivo responsable del LTEE sería, idealmente, lo suficientemente joven como para poder dirigir el proyecto durante unos 25 años, pero lo suficientemente experimentado como para haber sido promovido y titular en función de sus logros independientes en un campo relevante (biología evolutiva, genómica, microbiología, etc.)". ^[10] En 2022, Barrick fue nombrado segundo director del LTEE, y los linajes en evolución ahora se están propagando en su laboratorio en UT Austin. ^[1]

Barrick ha contribuido de manera importante al LTEE, incluido el desarrollo del proceso computacional breseq utilizado para analizar secuencias de todo el genoma de ese proyecto y otros experimentos de evolución . ^{[11] [12]}

Barrick, Lenski y sus colegas identificaron mutaciones que permitieron que un competidor aparentemente inferior prevaleciera sobre un linaje más apto en una población LTEE, lo que demuestra diferencias genéticas en la capacidad de evolución . ^[13] El escritor científico Carl Zimmer comparó los hallazgos con un caso de "La liebre y la tortuga en un matraz de laboratorio". ^[14] El equipo de Barrick identificó posteriormente mutaciones implicadas en la evolución inesperada de la utilización de citrato en otra población. Zimmer explicó que "[Barrick] y sus colegas desarrollaron un nuevo método de ingeniería bacteriana para identificar las mutaciones que eran absolutamente esenciales para la alimentación completa con citrato". Sin embargo, continuó diciendo que las mutaciones relevantes "eran extrañamente pocas". ^[15] El equipo de Barrick descubrió posteriormente que este enfoque había pasado por alto otra mutación importante relacionada con el uso de citrato porque una mutación posterior (una involucrada en el refinamiento de la nueva función) anuló el efecto de la mutación anterior. ^[16]

En 2015, Barrick fue co-receptor de un premio por artículo destacado de la Sociedad de Genética de Estados Unidos por un artículo sobre interferencia clonal y selección dependiente de la frecuencia en el LTEE. ^[17] En 2024, Barrick y colaboradores descubrieron posibles casos de nacimiento de genes de novo , que involucran la generación de nuevas transcripciones de ARNm y proteínas asociadas con mutaciones cercanas. ^{[18] [19]}

Durante varios años, Barrick también ha trabajado con endosimbiontes bacterianos de abejas melíferas y otros artrópodos, con el objetivo de modificar los simbiontes para aplicaciones beneficiosas. ^[20] En 2020, Barrick, Nancy Moran y sus colegas modificaron genéticamente Snodgrassella alvi , una especie bacteriana que vive en el intestino de las abejas melíferas, para que induzca una defensa mediada por ARNi contra un ácaro parásito que porta un virus que es una gran amenaza para las abejas. ^[21] Un comentarista señaló que este "enfoque no solo puede proporcionar una solución a muchos de los problemas de las abejas melíferas, sino que también ofrece un nuevo conjunto de herramientas genómicas funcionales con las que diseccionar las complejidades moleculares de las abejas melíferas y sus sociedades". ^[22]